MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-9 DNA

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020825	TTTA	2	8	42	49	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020825	A	7	7	277	283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020825	CTA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020825	TTTA	2	8	336	343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020825	TAG	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020825	ACT	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020825	AT	3	6	594	599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020825	AAG	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279721
9	NC_020825	TCA	2	6	714	719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020825	CTC	2	6	807	812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279722
11	NC_020825	TCA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279722
12	NC_020825	AAT	2	6	974	979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279722
13	NC_020825	TCT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279722
14	NC_020825	CTT	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279722
15	NC_020825	TCA	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279722
16	NC_020825	T	8	8	1177	1184	0 %	100 %	0 %	0 %	472279722
17	NC_020825	ATT	2	6	1252	1257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020825	TAAG	2	8	1261	1268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020825	GAA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279723
20	NC_020825	A	6	6	1346	1351	100 %	0 %	0 %	0 %	472279723
21	NC_020825	AAT	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279723
22	NC_020825	TTGTTC	2	12	1630	1641	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472279723
23	NC_020825	CTA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279723
24	NC_020825	TTG	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279723
25	NC_020825	TTCAC	2	10	1766	1775	20 %	40 %	0 %	40 %	472279723
26	NC_020825	GTA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279723
27	NC_020825	TCG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
28	NC_020825	TTC	2	6	1902	1907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279724
29	NC_020825	GTTT	2	8	1912	1919	0 %	75 %	25 %	0 %	472279724
30	NC_020825	TTG	2	6	1923	1928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279724
31	NC_020825	CGT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
32	NC_020825	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
33	NC_020825	CAAC	2	8	2090	2097	50 %	0 %	0 %	50 %	472279724
34	NC_020825	GCT	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
35	NC_020825	GTT	2	6	2129	2134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279724
36	NC_020825	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279724
37	NC_020825	GAT	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279724
38	NC_020825	TATT	2	8	2314	2321	25 %	75 %	0 %	0 %	472279724
39	NC_020825	ATT	2	6	2367	2372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279724
40	NC_020825	CA	3	6	2603	2608	50 %	0 %	0 %	50 %	472279724
41	NC_020825	CTG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
42	NC_020825	ACTTCA	2	12	2692	2703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279724
43	NC_020825	CTT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279724
44	NC_020825	CCGA	2	8	2879	2886	25 %	0 %	25 %	50 %	472279724
45	NC_020825	ATT	2	6	2929	2934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279724
46	NC_020825	TGA	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279724
47	NC_020825	ATTTG	2	10	2988	2997	20 %	60 %	20 %	0 %	472279724
48	NC_020825	CGG	2	6	3154	3159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020825	GAGC	2	8	3171	3178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020825	GCGTA	2	10	3205	3214	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020825	TGA	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020825	AAAC	2	8	3344	3351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020825	GAA	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020825	CAA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020825	AAC	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020825	GCC	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279725
57	NC_020825	ACG	2	6	3630	3635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279725
58	NC_020825	CAAGC	2	10	3671	3680	40 %	0 %	20 %	40 %	472279725
59	NC_020825	ACC	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279725
60	NC_020825	A	7	7	3720	3726	100 %	0 %	0 %	0 %	472279725
61	NC_020825	TTA	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279725
62	NC_020825	CAAC	2	8	3795	3802	50 %	0 %	0 %	50 %	472279725
63	NC_020825	A	7	7	3825	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	472279725
64	NC_020825	GAC	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279725
65	NC_020825	T	6	6	3991	3996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020825	AGG	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020825	A	6	6	4082	4087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020825	TAT	2	6	4090	4095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020825	T	6	6	4195	4200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020825	AATA	2	8	4264	4271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020825	AAG	2	6	4401	4406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020825	CTT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020825	T	6	6	4438	4443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020825	A	6	6	4466	4471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020825	ATA	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020825	CAC	2	6	4500	4505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020825	CAA	2	6	4672	4677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020825	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020825	AAC	2	6	4704	4709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020825	CAA	2	6	4777	4782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020825	TAC	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020825	CCG	2	6	4819	4824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_020825	AAT	2	6	4826	4831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020825	AAC	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020825	C	7	7	4910	4916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_020825	ATA	2	6	4929	4934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020825	A	6	6	4934	4939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020825	TCAA	2	8	4951	4958	50 %	25 %	0 %	25 %	472279726
89	NC_020825	AAG	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279726
90	NC_020825	AAT	2	6	5150	5155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279726
91	NC_020825	CCAT	2	8	5254	5261	25 %	25 %	0 %	50 %	472279726
92	NC_020825	GTA	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279726
93	NC_020825	ATAC	2	8	5292	5299	50 %	25 %	0 %	25 %	472279726
94	NC_020825	CAC	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279726
95	NC_020825	TAAC	2	8	5330	5337	50 %	25 %	0 %	25 %	472279726
96	NC_020825	ATCT	2	8	5385	5392	25 %	50 %	0 %	25 %	472279726
97	NC_020825	TCC	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279726
98	NC_020825	A	6	6	5436	5441	100 %	0 %	0 %	0 %	472279726
99	NC_020825	TAA	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279726
100	NC_020825	CCT	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279726
101	NC_020825	C	6	6	5603	5608	0 %	0 %	0 %	100 %	472279726
102	NC_020825	AAT	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020825	TTA	2	6	5630	5635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020825	A	6	6	5635	5640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020825	AC	3	6	5666	5671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020825	CAA	2	6	5704	5709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020825	CT	3	6	5728	5733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020825	CTT	2	6	5766	5771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020825	AAC	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.