MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-4 DNA

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020822	GCT	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020822	AAG	2	6	256	261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020822	ACG	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279654
4	NC_020822	ACT	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279654
5	NC_020822	ATG	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279654
6	NC_020822	ATG	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279655
7	NC_020822	CGG	2	6	1034	1039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279655
8	NC_020822	CCG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279655
9	NC_020822	TCC	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279655
10	NC_020822	CGA	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279655
11	NC_020822	TAA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279655
12	NC_020822	TGA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279655
13	NC_020822	CAT	2	6	1417	1422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
14	NC_020822	TAC	2	6	1457	1462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
15	NC_020822	TCA	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
16	NC_020822	AGC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279655
17	NC_020822	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279655
18	NC_020822	CAG	2	6	1829	1834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020822	ATT	2	6	1887	1892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020822	CTT	2	6	1948	1953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020822	TAT	2	6	1962	1967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020822	CAA	2	6	1981	1986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020822	GTA	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020822	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279656
25	NC_020822	GAA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279656
26	NC_020822	ATT	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279656
27	NC_020822	AAT	2	6	2450	2455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
28	NC_020822	TGA	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
29	NC_020822	GAT	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
30	NC_020822	ATA	2	6	2538	2543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
31	NC_020822	TCA	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279656
32	NC_020822	CTC	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279656
33	NC_020822	GAT	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
34	NC_020822	TAA	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
35	NC_020822	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279657
36	NC_020822	AAC	2	6	3175	3180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279657
37	NC_020822	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279657
38	NC_020822	CAA	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279657
39	NC_020822	CAG	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279657
40	NC_020822	GAT	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279657
41	NC_020822	GAC	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279657
42	NC_020822	AGC	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279658
43	NC_020822	ATC	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279658
44	NC_020822	GCG	2	6	4219	4224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279658
45	NC_020822	GAA	2	6	4405	4410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279658
46	NC_020822	GCC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279658
47	NC_020822	GGT	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279658
48	NC_020822	GTT	2	6	4659	4664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279658
49	NC_020822	TAA	3	9	4736	4744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020822	ACT	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279659
51	NC_020822	TTC	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279659
52	NC_020822	GAA	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279659
53	NC_020822	GCT	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279659
54	NC_020822	ATA	2	6	5044	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279659
55	NC_020822	ACC	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279659
56	NC_020822	CAT	2	6	5648	5653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020822	ATA	2	6	5714	5719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020822	TGA	2	6	5771	5776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020822	GTA	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020822	TAA	2	6	5810	5815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020822	ATA	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020822	CAA	2	6	5864	5869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020822	TAA	2	6	5922	5927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020822	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020822	GTA	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279660
66	NC_020822	GAA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279660
67	NC_020822	CAA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279660
68	NC_020822	GTC	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279660
69	NC_020822	GAT	2	6	6400	6405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279660
70	NC_020822	TCA	2	6	6449	6454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279660
71	NC_020822	TCT	2	6	6552	6557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279660
72	NC_020822	GCG	2	6	6595	6600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279660
73	NC_020822	CTT	2	6	6607	6612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279660
74	NC_020822	TGT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279660
75	NC_020822	AGC	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279660
76	NC_020822	GAA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279660
77	NC_020822	CAG	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020822	GTC	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020822	TGA	2	6	7245	7250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020822	ATA	2	6	7384	7389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020822	GTC	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020822	ATT	2	6	7473	7478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279661
83	NC_020822	GAT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279661
84	NC_020822	GTA	2	6	7670	7675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279661
85	NC_020822	AGA	2	6	7729	7734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279661
86	NC_020822	ATT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279661
87	NC_020822	CCA	2	6	7818	7823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279661
88	NC_020822	AAT	2	6	7841	7846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279661
89	NC_020822	ATT	2	6	7875	7880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279662
90	NC_020822	TTC	3	9	7982	7990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279662
91	NC_020822	ATT	2	6	8297	8302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279662
92	NC_020822	CTT	2	6	8407	8412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279662
93	NC_020822	ATC	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279662
94	NC_020822	TGT	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279662
95	NC_020822	GAT	2	6	8679	8684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020822	TCT	2	6	8727	8732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020822	AAC	2	6	8876	8881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020822	TAT	2	6	8973	8978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020822	CAA	2	6	9080	9085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279663
100	NC_020822	GTG	2	6	9104	9109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279663
101	NC_020822	GGT	2	6	9138	9143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279663
102	NC_020822	GTG	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279663
103	NC_020822	TGA	2	6	9478	9483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020822	ATT	2	6	9617	9622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279664
105	NC_020822	GTG	2	6	9625	9630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279664
106	NC_020822	GAG	2	6	9655	9660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279664
107	NC_020822	TCC	3	9	9819	9827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_020822	GTT	2	6	9859	9864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020822	GCC	2	6	9897	9902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020822	CAA	2	6	10060	10065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020822	GCG	2	6	10068	10073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279665
112	NC_020822	TGA	3	9	10149	10157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279665
113	NC_020822	AAG	2	6	10209	10214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279665
114	NC_020822	TGG	2	6	10282	10287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279665
115	NC_020822	GAA	3	9	10327	10335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279665
116	NC_020822	TAC	2	6	10366	10371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279665
117	NC_020822	AGA	2	6	10460	10465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020822	GTA	2	6	10582	10587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020822	GTA	3	9	10593	10601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020822	GAT	2	6	10678	10683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279666
121	NC_020822	TTG	2	6	10751	10756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279666
122	NC_020822	GAA	3	9	10792	10800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279666
123	NC_020822	TCG	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279667
124	NC_020822	AAG	2	6	11027	11032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279667
125	NC_020822	CAA	2	6	11048	11053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279667
126	NC_020822	TAT	2	6	11054	11059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279667
127	NC_020822	GAA	2	6	11089	11094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279667
128	NC_020822	AGA	2	6	11225	11230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279667
129	NC_020822	TTA	2	6	11395	11400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279667
130	NC_020822	TTC	2	6	11466	11471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279668
131	NC_020822	TTA	2	6	11491	11496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279668
132	NC_020822	TAA	2	6	11514	11519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279668
133	NC_020822	TGC	2	6	11635	11640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279668
134	NC_020822	TGA	2	6	11793	11798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279669
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258	NC_020822	ACG	2	6	20458	20463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279674
259	NC_020822	TTA	2	6	20502	20507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279674
260	NC_020822	TCG	2	6	20523	20528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
261	NC_020822	CTC	2	6	20614	20619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279674
262	NC_020822	CGT	2	6	20620	20625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
263	NC_020822	CAA	2	6	20763	20768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
264	NC_020822	AGA	2	6	20769	20774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279674
265	NC_020822	TTG	2	6	20896	20901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279674
266	NC_020822	ATC	2	6	20950	20955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279674
267	NC_020822	GCA	2	6	20960	20965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279674
268	NC_020822	CCG	2	6	21004	21009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279674
269	NC_020822	AAG	2	6	21017	21022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279674
270	NC_020822	ACC	2	6	21619	21624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279674
271	NC_020822	AAC	2	6	21644	21649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
272	NC_020822	CAT	2	6	21675	21680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279674
273	NC_020822	CGG	2	6	21714	21719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279674
274	NC_020822	GCT	2	6	21731	21736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
275	NC_020822	AAC	2	6	21928	21933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
276	NC_020822	TAT	2	6	22001	22006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_020822	CAA	2	6	22242	22247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_020822	TAA	2	6	22333	22338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_020822	AAT	2	6	22396	22401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_020822	AGG	2	6	22461	22466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_020822	AGA	2	6	22503	22508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279675
282	NC_020822	CAA	3	9	22527	22535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279675
283	NC_020822	TGA	2	6	22735	22740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279675
284	NC_020822	TAC	2	6	22864	22869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279675
285	NC_020822	TGC	2	6	22937	22942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279675
286	NC_020822	GCA	2	6	22955	22960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279675
287	NC_020822	TGA	2	6	22979	22984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279675
288	NC_020822	TTG	2	6	23053	23058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279675
289	NC_020822	ATG	2	6	23118	23123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279675
290	NC_020822	TGG	2	6	23196	23201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279675
291	NC_020822	TTA	2	6	23259	23264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020822	GGT	2	6	23445	23450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279676
293	NC_020822	GTT	2	6	23469	23474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279676
294	NC_020822	TTG	2	6	23559	23564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279676
295	NC_020822	CTG	2	6	23592	23597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279676
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299	NC_020822	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279678
300	NC_020822	TCA	2	6	24153	24158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279678
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307	NC_020822	GCT	2	6	24637	24642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279678
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313	NC_020822	CCA	2	6	25188	25193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279678
314	NC_020822	AAG	2	6	25296	25301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279678
315	NC_020822	TCA	3	9	25317	25325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.