MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020558	GAT	2	6	44455	44460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208814
1002	NC_020558	ACCA	2	8	44475	44482	50 %	0 %	0 %	50 %	470208814
1003	NC_020558	TAA	2	6	44502	44507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208814
1004	NC_020558	AGA	2	6	44508	44513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208814
1005	NC_020558	TCTT	2	8	44546	44553	0 %	75 %	0 %	25 %	470208814
1006	NC_020558	ATT	2	6	44623	44628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208814
1007	NC_020558	CTG	2	6	44663	44668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208814
1008	NC_020558	TTG	2	6	44779	44784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208814
1009	NC_020558	AT	3	6	44877	44882	50 %	50 %	0 %	0 %	470208814
1010	NC_020558	TGA	2	6	44883	44888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208814
1011	NC_020558	GCA	2	6	44899	44904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208814
1012	NC_020558	AGC	2	6	44928	44933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208814
1013	NC_020558	AAAG	2	8	44947	44954	75 %	0 %	25 %	0 %	470208814
1014	NC_020558	AAT	2	6	44970	44975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208814
1015	NC_020558	TTG	2	6	45029	45034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208814
1016	NC_020558	AGG	2	6	45129	45134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020558	GGC	2	6	45250	45255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208815
1018	NC_020558	TGG	2	6	45257	45262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208815
1019	NC_020558	CAA	2	6	45273	45278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208815
1020	NC_020558	AAG	2	6	45286	45291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208815
1021	NC_020558	ATG	3	9	45403	45411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208815
1022	NC_020558	T	6	6	45437	45442	0 %	100 %	0 %	0 %	470208815
1023	NC_020558	GCG	2	6	45466	45471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208815
1024	NC_020558	TCT	2	6	45500	45505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208815
1025	NC_020558	A	7	7	45548	45554	100 %	0 %	0 %	0 %	470208815
1026	NC_020558	ACT	2	6	45577	45582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208815
1027	NC_020558	ATTTT	2	10	45595	45604	20 %	80 %	0 %	0 %	470208815
1028	NC_020558	GTT	2	6	45610	45615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208815
1029	NC_020558	AGA	2	6	45653	45658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208815
1030	NC_020558	GAAG	2	8	45672	45679	50 %	0 %	50 %	0 %	470208815
1031	NC_020558	A	7	7	45719	45725	100 %	0 %	0 %	0 %	470208815
1032	NC_020558	AAAC	2	8	45778	45785	75 %	0 %	0 %	25 %	470208815
1033	NC_020558	GTT	2	6	45828	45833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208815
1034	NC_020558	GAA	2	6	45922	45927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208815
1035	NC_020558	TTA	2	6	45967	45972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208815
1036	NC_020558	AG	3	6	45980	45985	50 %	0 %	50 %	0 %	470208815
1037	NC_020558	GCT	2	6	46041	46046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208815
1038	NC_020558	ATT	2	6	46080	46085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208815
1039	NC_020558	TGA	2	6	46097	46102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208815
1040	NC_020558	AAAGAT	2	12	46107	46118	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470208815
1041	NC_020558	GGC	2	6	46191	46196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208815
1042	NC_020558	AAG	2	6	46252	46257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208815
1043	NC_020558	TTAA	2	8	46360	46367	50 %	50 %	0 %	0 %	470208816
1044	NC_020558	CAA	3	9	46409	46417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208816
1045	NC_020558	GAA	2	6	46549	46554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208816
1046	NC_020558	A	6	6	46560	46565	100 %	0 %	0 %	0 %	470208816
1047	NC_020558	ATT	2	6	46567	46572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208816
1048	NC_020558	A	6	6	46618	46623	100 %	0 %	0 %	0 %	470208816
1049	NC_020558	AAAC	2	8	46629	46636	75 %	0 %	0 %	25 %	470208816
1050	NC_020558	ATTT	2	8	46642	46649	25 %	75 %	0 %	0 %	470208816
1051	NC_020558	T	7	7	46647	46653	0 %	100 %	0 %	0 %	470208816
1052	NC_020558	TGC	2	6	46674	46679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208816
1053	NC_020558	GAT	2	6	46777	46782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208816
1054	NC_020558	TACG	2	8	46797	46804	25 %	25 %	25 %	25 %	470208816
1055	NC_020558	GAAAC	2	10	46853	46862	60 %	0 %	20 %	20 %	470208816
1056	NC_020558	ATA	2	6	46892	46897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208816
1057	NC_020558	ATT	2	6	46900	46905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208816
1058	NC_020558	TA	3	6	46928	46933	50 %	50 %	0 %	0 %	470208816
1059	NC_020558	TGAAAT	2	12	46944	46955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470208816
1060	NC_020558	TAG	2	6	47037	47042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208816
1061	NC_020558	ATAA	2	8	47063	47070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020558	GACTT	2	10	47092	47101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_020558	TAAA	2	8	47125	47132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020558	AGTG	2	8	47142	47149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020558	TGG	2	6	47152	47157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208817
1066	NC_020558	TTA	2	6	47161	47166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208817
1067	NC_020558	ATTTT	2	10	47179	47188	20 %	80 %	0 %	0 %	470208817
1068	NC_020558	AAT	2	6	47220	47225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208817
1069	NC_020558	CAT	2	6	47243	47248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208817
1070	NC_020558	GTA	2	6	47283	47288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208817
1071	NC_020558	ATT	2	6	47376	47381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208817
1072	NC_020558	AGC	2	6	47393	47398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208817
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1084	NC_020558	T	8	8	47823	47830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1086	NC_020558	TTAG	2	8	47876	47883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020558	TGA	2	6	47891	47896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020558	TAT	2	6	48008	48013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208818
1089	NC_020558	TGA	2	6	48015	48020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208818
1090	NC_020558	ATG	2	6	48037	48042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208818
1091	NC_020558	T	7	7	48057	48063	0 %	100 %	0 %	0 %	470208818
1092	NC_020558	GA	3	6	48075	48080	50 %	0 %	50 %	0 %	470208818
1093	NC_020558	ATT	2	6	48215	48220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208818
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1097	NC_020558	T	6	6	48336	48341	0 %	100 %	0 %	0 %	470208818
1098	NC_020558	CAG	2	6	48380	48385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208818
1099	NC_020558	CCAG	2	8	48423	48430	25 %	0 %	25 %	50 %	470208818
1100	NC_020558	CAT	2	6	48472	48477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208818
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1102	NC_020558	GAAC	2	8	48592	48599	50 %	0 %	25 %	25 %	470208818
1103	NC_020558	TTTA	2	8	48633	48640	25 %	75 %	0 %	0 %	470208818
1104	NC_020558	CAA	2	6	48769	48774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208818
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1106	NC_020558	A	6	6	48800	48805	100 %	0 %	0 %	0 %	470208818
1107	NC_020558	ATG	2	6	48938	48943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208818
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1109	NC_020558	A	6	6	49131	49136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020558	ATA	2	6	49257	49262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020558	ATT	2	6	49284	49289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020558	GCTC	2	8	49294	49301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_020558	ATGGT	2	10	49344	49353	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020558	AGG	2	6	49386	49391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020558	GTAGA	2	10	49393	49402	40 %	20 %	40 %	0 %	470208819
1116	NC_020558	CAT	2	6	49428	49433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208819
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1123	NC_020558	GAG	2	6	49734	49739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020558	ATG	2	6	49751	49756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208820
1125	NC_020558	GTA	2	6	49763	49768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208820
1126	NC_020558	CAA	2	6	49868	49873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208820
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1128	NC_020558	TGT	2	6	49903	49908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208820
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