MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020558	CTT	2	6	22726	22731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208794
502	NC_020558	A	6	6	22786	22791	100 %	0 %	0 %	0 %	470208794
503	NC_020558	ACA	2	6	22820	22825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208794
504	NC_020558	GAA	2	6	22851	22856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208794
505	NC_020558	A	6	6	22855	22860	100 %	0 %	0 %	0 %	470208794
506	NC_020558	A	6	6	22876	22881	100 %	0 %	0 %	0 %	470208794
507	NC_020558	AT	3	6	22914	22919	50 %	50 %	0 %	0 %	470208794
508	NC_020558	TCA	2	6	22935	22940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_020558	TTTTA	2	10	22954	22963	20 %	80 %	0 %	0 %	470208795
510	NC_020558	CG	3	6	22973	22978	0 %	0 %	50 %	50 %	470208795
511	NC_020558	T	7	7	23031	23037	0 %	100 %	0 %	0 %	470208795
512	NC_020558	GACCA	2	10	23038	23047	40 %	0 %	20 %	40 %	470208795
513	NC_020558	GTA	2	6	23057	23062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208795
514	NC_020558	ATT	2	6	23066	23071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208795
515	NC_020558	T	6	6	23147	23152	0 %	100 %	0 %	0 %	470208795
516	NC_020558	TTC	2	6	23196	23201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208795
517	NC_020558	T	6	6	23216	23221	0 %	100 %	0 %	0 %	470208795
518	NC_020558	TGGAT	2	10	23297	23306	20 %	40 %	40 %	0 %	470208795
519	NC_020558	T	6	6	23349	23354	0 %	100 %	0 %	0 %	470208795
520	NC_020558	GCA	2	6	23365	23370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208795
521	NC_020558	AGTTGC	2	12	23477	23488	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470208795
522	NC_020558	TTAAAG	2	12	23529	23540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470208795
523	NC_020558	GTT	2	6	23549	23554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208795
524	NC_020558	AGCC	2	8	23595	23602	25 %	0 %	25 %	50 %	470208795
525	NC_020558	GAAC	2	8	23631	23638	50 %	0 %	25 %	25 %	470208795
526	NC_020558	GTT	2	6	23652	23657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208795
527	NC_020558	GCC	3	9	23688	23696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470208795
528	NC_020558	A	7	7	23768	23774	100 %	0 %	0 %	0 %	470208795
529	NC_020558	A	6	6	23950	23955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020558	CG	3	6	23994	23999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_020558	TAT	3	9	24043	24051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208796
532	NC_020558	ATTA	2	8	24067	24074	50 %	50 %	0 %	0 %	470208796
533	NC_020558	A	6	6	24099	24104	100 %	0 %	0 %	0 %	470208796
534	NC_020558	AGA	2	6	24112	24117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208796
535	NC_020558	AAG	2	6	24128	24133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208796
536	NC_020558	TAC	2	6	24148	24153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208796
537	NC_020558	GTT	2	6	24155	24160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208796
538	NC_020558	GTAA	2	8	24224	24231	50 %	25 %	25 %	0 %	470208796
539	NC_020558	TAT	2	6	24235	24240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208796
540	NC_020558	GAA	2	6	24245	24250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208796
541	NC_020558	CAAAA	2	10	24298	24307	80 %	0 %	0 %	20 %	470208796
542	NC_020558	AGT	2	6	24328	24333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208796
543	NC_020558	A	6	6	24368	24373	100 %	0 %	0 %	0 %	470208796
544	NC_020558	TGA	2	6	24427	24432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208796
545	NC_020558	AAC	2	6	24452	24457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208796
546	NC_020558	AG	3	6	24574	24579	50 %	0 %	50 %	0 %	470208796
547	NC_020558	AAT	2	6	24611	24616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208796
548	NC_020558	AT	3	6	24700	24705	50 %	50 %	0 %	0 %	470208796
549	NC_020558	ATTGAA	2	12	24737	24748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470208796
550	NC_020558	A	6	6	24752	24757	100 %	0 %	0 %	0 %	470208796
551	NC_020558	ATTAT	2	10	24783	24792	40 %	60 %	0 %	0 %	470208797
552	NC_020558	GCA	2	6	24794	24799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208797
553	NC_020558	AAC	2	6	24853	24858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208797
554	NC_020558	GAA	2	6	24884	24889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208797
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557	NC_020558	ATA	2	6	25110	25115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208797
558	NC_020558	TGA	2	6	25156	25161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208797
559	NC_020558	GGA	2	6	25165	25170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208797
560	NC_020558	CAA	2	6	25241	25246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208798
561	NC_020558	TTG	2	6	25283	25288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208798
562	NC_020558	ATG	2	6	25289	25294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208798
563	NC_020558	A	6	6	25302	25307	100 %	0 %	0 %	0 %	470208798
564	NC_020558	CTG	2	6	25343	25348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208798
565	NC_020558	GCA	2	6	25381	25386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208798
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567	NC_020558	AAT	2	6	25396	25401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208798
568	NC_020558	GCA	2	6	25416	25421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208798
569	NC_020558	A	7	7	25536	25542	100 %	0 %	0 %	0 %	470208798
570	NC_020558	ATT	2	6	25580	25585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208798
571	NC_020558	A	7	7	25659	25665	100 %	0 %	0 %	0 %	470208798
572	NC_020558	AAG	2	6	25674	25679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020558	GTTA	2	8	25720	25727	25 %	50 %	25 %	0 %	470208799
574	NC_020558	TAA	2	6	25788	25793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208799
575	NC_020558	CGG	2	6	25888	25893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208799
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577	NC_020558	TCAGG	2	10	25952	25961	20 %	20 %	40 %	20 %	470208799
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580	NC_020558	TGG	2	6	26242	26247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208799
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584	NC_020558	TCG	2	6	26304	26309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208799
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587	NC_020558	CAAA	2	8	26404	26411	75 %	0 %	0 %	25 %	470208799
588	NC_020558	GAG	2	6	26462	26467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208799
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590	NC_020558	GTTG	2	8	26548	26555	0 %	50 %	50 %	0 %	470208800
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592	NC_020558	TGA	3	9	26648	26656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208800
593	NC_020558	ATG	2	6	26667	26672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208800
594	NC_020558	GGT	2	6	26712	26717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208800
595	NC_020558	AAAG	2	8	26756	26763	75 %	0 %	25 %	0 %	470208800
596	NC_020558	AAG	2	6	26770	26775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208800
597	NC_020558	CGA	2	6	26851	26856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208800
598	NC_020558	AT	3	6	26876	26881	50 %	50 %	0 %	0 %	470208800
599	NC_020558	TTTAC	2	10	26952	26961	20 %	60 %	0 %	20 %	470208800
600	NC_020558	GTC	2	6	27057	27062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208800
601	NC_020558	A	7	7	27216	27222	100 %	0 %	0 %	0 %	470208800
602	NC_020558	TTA	2	6	27243	27248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208800
603	NC_020558	ATT	2	6	27264	27269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208800
604	NC_020558	GGA	2	6	27309	27314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020558	T	6	6	27336	27341	0 %	100 %	0 %	0 %	470208801
606	NC_020558	GGA	2	6	27362	27367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208801
607	NC_020558	A	6	6	27373	27378	100 %	0 %	0 %	0 %	470208801
608	NC_020558	TCA	2	6	27395	27400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208801
609	NC_020558	AGC	2	6	27401	27406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208801
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611	NC_020558	ACG	2	6	27433	27438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208801
612	NC_020558	ATT	2	6	27441	27446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208801
613	NC_020558	AGG	2	6	27503	27508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208801
614	NC_020558	TTA	2	6	27526	27531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208801
615	NC_020558	CTG	2	6	27538	27543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208801
616	NC_020558	TTA	2	6	27548	27553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208801
617	NC_020558	AT	3	6	27613	27618	50 %	50 %	0 %	0 %	470208801
618	NC_020558	TTG	2	6	27700	27705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208801
619	NC_020558	CAG	2	6	27730	27735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208801
620	NC_020558	TTG	2	6	27759	27764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208801
621	NC_020558	CAA	2	6	27885	27890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208801
622	NC_020558	ACC	2	6	27935	27940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208801
623	NC_020558	TGG	2	6	27965	27970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208801
624	NC_020558	TAA	2	6	28026	28031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208801
625	NC_020558	T	6	6	28065	28070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020558	ATG	2	6	28080	28085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208802
627	NC_020558	AAG	2	6	28093	28098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208802
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