MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020558	ACA	2	6	240954	240959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209012
5502	NC_020558	GCG	2	6	241034	241039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470209012
5503	NC_020558	CAGT	2	8	241083	241090	25 %	25 %	25 %	25 %	470209012
5504	NC_020558	CAA	2	6	241116	241121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209012
5505	NC_020558	TCG	2	6	241168	241173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209012
5506	NC_020558	AAC	2	6	241188	241193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209012
5507	NC_020558	AAG	2	6	241200	241205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209012
5508	NC_020558	GAA	2	6	241315	241320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209012
5509	NC_020558	AAAT	2	8	241337	241344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_020558	AGG	2	6	241457	241462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_020558	GT	3	6	241491	241496	0 %	50 %	50 %	0 %	470209013
5512	NC_020558	T	6	6	241496	241501	0 %	100 %	0 %	0 %	470209013
5513	NC_020558	TAAT	2	8	241576	241583	50 %	50 %	0 %	0 %	470209013
5514	NC_020558	TTA	2	6	241627	241632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209013
5515	NC_020558	CAAA	2	8	241779	241786	75 %	0 %	0 %	25 %	470209013
5516	NC_020558	AGT	2	6	241805	241810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209013
5517	NC_020558	GTC	2	6	241864	241869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209013
5518	NC_020558	AAAGA	2	10	241907	241916	80 %	0 %	20 %	0 %	470209013
5519	NC_020558	AGA	3	9	241922	241930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209013
5520	NC_020558	AGA	2	6	241937	241942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209013
5521	NC_020558	ATT	2	6	241983	241988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209013
5522	NC_020558	ACT	2	6	242013	242018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209013
5523	NC_020558	GGT	2	6	242036	242041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209013
5524	NC_020558	GTT	2	6	242250	242255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209013
5525	NC_020558	TGT	2	6	242342	242347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209013
5526	NC_020558	GAT	2	6	242421	242426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209013
5527	NC_020558	GAT	2	6	242432	242437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209013
5528	NC_020558	TGT	2	6	242438	242443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209013
5529	NC_020558	AGA	2	6	242444	242449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209013
5530	NC_020558	TTA	2	6	242461	242466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209013
5531	NC_020558	CAG	2	6	242509	242514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209013
5532	NC_020558	GAA	2	6	242515	242520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209013
5533	NC_020558	T	7	7	242579	242585	0 %	100 %	0 %	0 %	470209014
5534	NC_020558	TCAT	2	8	242660	242667	25 %	50 %	0 %	25 %	470209014
5535	NC_020558	T	6	6	242679	242684	0 %	100 %	0 %	0 %	470209014
5536	NC_020558	GTT	2	6	242696	242701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209014
5537	NC_020558	TTG	2	6	242711	242716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209014
5538	NC_020558	TG	3	6	242715	242720	0 %	50 %	50 %	0 %	470209014
5539	NC_020558	AAG	2	6	242723	242728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209014
5540	NC_020558	GAAA	2	8	242731	242738	75 %	0 %	25 %	0 %	470209014
5541	NC_020558	ATG	2	6	242873	242878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209014
5542	NC_020558	ATT	2	6	242905	242910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209014
5543	NC_020558	ATT	2	6	242916	242921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209014
5544	NC_020558	AGTAAA	2	12	242958	242969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470209014
5545	NC_020558	GTG	2	6	242986	242991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209014
5546	NC_020558	CGC	2	6	243044	243049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209014
5547	NC_020558	TAT	2	6	243175	243180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209014
5548	NC_020558	ATG	2	6	243276	243281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209015
5549	NC_020558	TTA	2	6	243309	243314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209015
5550	NC_020558	TGG	2	6	243316	243321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209015
5551	NC_020558	CTA	2	6	243347	243352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209015
5552	NC_020558	T	6	6	243433	243438	0 %	100 %	0 %	0 %	470209015
5553	NC_020558	CTA	2	6	243543	243548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209015
5554	NC_020558	GAA	2	6	243683	243688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209015
5555	NC_020558	AAT	2	6	243723	243728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209015
5556	NC_020558	AAT	2	6	243739	243744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_020558	TATT	2	8	243836	243843	25 %	75 %	0 %	0 %	470209016
5558	NC_020558	ATG	2	6	243855	243860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209016
5559	NC_020558	GAA	2	6	243917	243922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209016
5560	NC_020558	TCAA	2	8	244015	244022	50 %	25 %	0 %	25 %	470209016
5561	NC_020558	AGA	3	9	244084	244092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209016
5562	NC_020558	GTC	2	6	244155	244160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209016
5563	NC_020558	AAG	2	6	244188	244193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209016
5564	NC_020558	A	6	6	244316	244321	100 %	0 %	0 %	0 %	470209016
5565	NC_020558	GAT	2	6	244358	244363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209016
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5569	NC_020558	ATT	2	6	244579	244584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209016
5570	NC_020558	TTGG	2	8	244602	244609	0 %	50 %	50 %	0 %	470209016
5571	NC_020558	GAA	3	9	244622	244630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209016
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5574	NC_020558	ATG	2	6	244742	244747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209017
5575	NC_020558	TAG	2	6	244748	244753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209017
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5577	NC_020558	CTG	2	6	244793	244798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209017
5578	NC_020558	TGA	2	6	244926	244931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209017
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5580	NC_020558	A	6	6	244987	244992	100 %	0 %	0 %	0 %	470209017
5581	NC_020558	TTTA	2	8	245082	245089	25 %	75 %	0 %	0 %	470209017
5582	NC_020558	TAC	2	6	245102	245107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209017
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5584	NC_020558	TGAA	2	8	245208	245215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_020558	T	6	6	245241	245246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_020558	AT	3	6	245253	245258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_020558	GAA	2	6	245323	245328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_020558	AG	4	8	245349	245356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_020558	T	7	7	245543	245549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_020558	A	6	6	245567	245572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_020558	AGG	2	6	245589	245594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_020558	CAA	2	6	245595	245600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_020558	AGA	2	6	245619	245624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209018
5594	NC_020558	CAA	2	6	245630	245635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209018
5595	NC_020558	CGA	2	6	245654	245659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209018
5596	NC_020558	T	6	6	245665	245670	0 %	100 %	0 %	0 %	470209018
5597	NC_020558	T	6	6	245676	245681	0 %	100 %	0 %	0 %	470209018
5598	NC_020558	TGG	2	6	245707	245712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209018
5599	NC_020558	T	7	7	245728	245734	0 %	100 %	0 %	0 %	470209018
5600	NC_020558	TTTG	2	8	245751	245758	0 %	75 %	25 %	0 %	470209018
5601	NC_020558	TAT	2	6	245765	245770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209018
5602	NC_020558	CTA	2	6	245816	245821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209018
5603	NC_020558	CAG	2	6	245873	245878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209018
5604	NC_020558	GAT	2	6	245887	245892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209018
5605	NC_020558	CCT	2	6	246059	246064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470209018
5606	NC_020558	GTT	2	6	246095	246100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209018
5607	NC_020558	TAG	2	6	246180	246185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_020558	AAAGGA	2	12	246196	246207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_020558	GA	3	6	246249	246254	50 %	0 %	50 %	0 %	470209019
5610	NC_020558	GTGAA	2	10	246282	246291	40 %	20 %	40 %	0 %	470209019
5611	NC_020558	ATT	2	6	246350	246355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209019
5612	NC_020558	TCG	2	6	246370	246375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209019
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5620	NC_020558	GCGG	2	8	246885	246892	0 %	0 %	75 %	25 %	470209020
5621	NC_020558	ACT	2	6	246967	246972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209020
5622	NC_020558	A	6	6	247006	247011	100 %	0 %	0 %	0 %	470209020
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5624	NC_020558	ATG	2	6	247045	247050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209020
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5746	NC_020558	A	6	6	252089	252094	100 %	0 %	0 %	0 %	470209029
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