MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020558	TG	3	6	216087	216092	0 %	50 %	50 %	0 %	470209000
5002	NC_020558	CG	3	6	216168	216173	0 %	0 %	50 %	50 %	470209000
5003	NC_020558	AGC	2	6	216205	216210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209000
5004	NC_020558	AGA	2	6	216214	216219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209000
5005	NC_020558	ATC	2	6	216395	216400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209000
5006	NC_020558	T	6	6	216435	216440	0 %	100 %	0 %	0 %	470209000
5007	NC_020558	AGT	3	9	216505	216513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209000
5008	NC_020558	GCTC	2	8	216526	216533	0 %	25 %	25 %	50 %	470209000
5009	NC_020558	GAT	2	6	216535	216540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209000
5010	NC_020558	TA	3	6	216606	216611	50 %	50 %	0 %	0 %	470209000
5011	NC_020558	GAA	2	6	216612	216617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209000
5012	NC_020558	TA	3	6	216650	216655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_020558	ATT	2	6	216663	216668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209001
5014	NC_020558	ATGGC	2	10	216690	216699	20 %	20 %	40 %	20 %	470209001
5015	NC_020558	GCA	2	6	216710	216715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209001
5016	NC_020558	AAC	2	6	216718	216723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209001
5017	NC_020558	AAG	2	6	216735	216740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209001
5018	NC_020558	AGA	2	6	216746	216751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209001
5019	NC_020558	AGA	2	6	216829	216834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209001
5020	NC_020558	A	6	6	216837	216842	100 %	0 %	0 %	0 %	470209001
5021	NC_020558	CCG	2	6	216979	216984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209001
5022	NC_020558	GAT	2	6	217157	217162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209001
5023	NC_020558	GGT	2	6	217178	217183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209001
5024	NC_020558	ACT	2	6	217195	217200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209001
5025	NC_020558	TGA	2	6	217225	217230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209001
5026	NC_020558	A	7	7	217236	217242	100 %	0 %	0 %	0 %	470209001
5027	NC_020558	GCGG	2	8	217316	217323	0 %	0 %	75 %	25 %	470209001
5028	NC_020558	AGA	2	6	217324	217329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209001
5029	NC_020558	A	6	6	217347	217352	100 %	0 %	0 %	0 %	470209001
5030	NC_020558	AGA	2	6	217420	217425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209001
5031	NC_020558	AGA	2	6	217441	217446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209001
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5034	NC_020558	GAA	2	6	217526	217531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209001
5035	NC_020558	AATT	2	8	217606	217613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_020558	ATAG	2	8	217635	217642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_020558	TAA	2	6	217651	217656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209002
5038	NC_020558	GGT	2	6	217773	217778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209002
5039	NC_020558	ATT	2	6	217854	217859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209002
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5046	NC_020558	TCTCCA	2	12	218295	218306	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470209002
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5051	NC_020558	CGC	2	6	218557	218562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209002
5052	NC_020558	TAA	2	6	218580	218585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209002
5053	NC_020558	AG	3	6	218588	218593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020558	T	6	6	218612	218617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_020558	A	8	8	218621	218628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_020558	CAG	2	6	218664	218669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_020558	CTTT	2	8	218673	218680	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5058	NC_020558	AT	3	6	218690	218695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_020558	AAC	2	6	218707	218712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_020558	T	6	6	218804	218809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5063	NC_020558	AT	3	6	218892	218897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_020558	AAC	2	6	218909	218914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_020558	T	6	6	219007	219012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_020558	GAAAA	2	10	219228	219237	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_020558	AT	3	6	219298	219303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020558	AAC	2	6	219315	219320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_020558	AAACA	2	10	219321	219330	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5089	NC_020558	TGATA	2	10	219798	219807	40 %	40 %	20 %	0 %	470209003
5090	NC_020558	A	6	6	219826	219831	100 %	0 %	0 %	0 %	470209003
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5094	NC_020558	A	6	6	219931	219936	100 %	0 %	0 %	0 %	470209003
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5099	NC_020558	TGA	2	6	220059	220064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209003
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5102	NC_020558	CAA	2	6	220169	220174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209003
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5112	NC_020558	AAG	2	6	220660	220665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209004
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5117	NC_020558	TAT	2	6	220936	220941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209005
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5123	NC_020558	A	6	6	221136	221141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_020558	AGT	2	6	221232	221237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209006
5125	NC_020558	TA	3	6	221372	221377	50 %	50 %	0 %	0 %	470209006
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5127	NC_020558	CGG	2	6	221415	221420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470209006
5128	NC_020558	GAAA	2	8	221424	221431	75 %	0 %	25 %	0 %	470209006
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5144	NC_020558	GAA	2	6	222325	222330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209007
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5186	NC_020558	CAA	2	6	224155	224160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5227	NC_020558	AAG	2	6	226305	226310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5230	NC_020558	CGG	2	6	226449	226454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5237	NC_020558	TC	3	6	226885	226890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5238	NC_020558	ACC	2	6	227064	227069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5239	NC_020558	AT	3	6	227085	227090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_020558	AGC	2	6	227144	227149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5241	NC_020558	TGG	2	6	227304	227309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_020558	AAG	2	6	227346	227351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_020558	TAGGCG	2	12	227438	227449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5244	NC_020558	ACA	2	6	227454	227459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5245	NC_020558	AGTG	2	8	227551	227558	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_020558	GGAA	2	8	227605	227612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_020558	AGT	2	6	227665	227670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_020558	GAG	2	6	227703	227708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_020558	GA	3	6	227726	227731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_020558	GA	3	6	227805	227810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_020558	CGG	2	6	227963	227968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5252	NC_020558	GA	3	6	228061	228066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_020558	TAGG	2	8	228179	228186	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_020558	GAG	2	6	228215	228220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_020558	TGG	2	6	228225	228230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_020558	TAC	2	6	228233	228238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_020558	CCT	2	6	228321	228326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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