MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 2046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020557	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020557	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	470205643
3	NC_020557	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	470205643
4	NC_020557	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	470205644
5	NC_020557	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	470205644
6	NC_020557	CAAAA	2	10	7073	7082	80 %	0 %	0 %	20 %	470205647
7	NC_020557	TTGAT	2	10	11587	11596	20 %	60 %	20 %	0 %	470205649
8	NC_020557	TTTTA	2	10	12260	12269	20 %	80 %	0 %	0 %	470205650
9	NC_020557	GTATG	2	10	13203	13212	20 %	40 %	40 %	0 %	470205651
10	NC_020557	AAAGA	2	10	14218	14227	80 %	0 %	20 %	0 %	470205652
11	NC_020557	ATGAA	2	10	17059	17068	60 %	20 %	20 %	0 %	470205655
12	NC_020557	GAATG	2	10	18801	18810	40 %	20 %	40 %	0 %	470205656
13	NC_020557	TAATT	2	10	20179	20188	40 %	60 %	0 %	0 %	470205659
14	NC_020557	ATTAA	2	10	21691	21700	60 %	40 %	0 %	0 %	470205661
15	NC_020557	AAATC	2	10	22152	22161	60 %	20 %	0 %	20 %	470205661
16	NC_020557	AACAT	2	10	22313	22322	60 %	20 %	0 %	20 %	470205661
17	NC_020557	TTTTA	2	10	22930	22939	20 %	80 %	0 %	0 %	470205662
18	NC_020557	GACCA	2	10	23014	23023	40 %	0 %	20 %	40 %	470205662
19	NC_020557	TGGAT	2	10	23273	23282	20 %	40 %	40 %	0 %	470205662
20	NC_020557	CAAAA	2	10	24274	24283	80 %	0 %	0 %	20 %	470205663
21	NC_020557	ATTAT	2	10	24759	24768	40 %	60 %	0 %	0 %	470205664
22	NC_020557	TCAGG	2	10	25928	25937	20 %	20 %	40 %	20 %	470205666
23	NC_020557	TTTAC	2	10	26928	26937	20 %	60 %	0 %	20 %	470205667
24	NC_020557	GAAAA	2	10	32859	32868	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020557	TGAAA	2	10	34014	34023	60 %	20 %	20 %	0 %	470205673
26	NC_020557	GAATG	2	10	35885	35894	40 %	20 %	40 %	0 %	470205675
27	NC_020557	AAATT	2	10	36012	36021	60 %	40 %	0 %	0 %	470205675
28	NC_020557	ATGGA	2	10	38133	38142	40 %	20 %	40 %	0 %	470205676
29	NC_020557	AAAAC	2	10	40239	40248	80 %	0 %	0 %	20 %	470205677
30	NC_020557	TTATT	2	10	41728	41737	20 %	80 %	0 %	0 %	470205679
31	NC_020557	AAAAG	2	10	42942	42951	80 %	0 %	20 %	0 %	470205679
32	NC_020557	ATAAA	2	10	43766	43775	80 %	20 %	0 %	0 %	470205680
33	NC_020557	ATTTT	2	10	45571	45580	20 %	80 %	0 %	0 %	470205682
34	NC_020557	GAAAC	2	10	46829	46838	60 %	0 %	20 %	20 %	470205683
35	NC_020557	GACTT	2	10	47068	47077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020557	ATTTT	2	10	47155	47164	20 %	80 %	0 %	0 %	470205684
37	NC_020557	AAATG	2	10	48285	48294	60 %	20 %	20 %	0 %	470205685
38	NC_020557	ATGGT	2	10	49320	49329	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020557	GTAGA	2	10	49369	49378	40 %	20 %	40 %	0 %	470205686
40	NC_020557	TTACT	2	10	50351	50360	20 %	60 %	0 %	20 %	470205688
41	NC_020557	GAAAT	2	10	51009	51018	60 %	20 %	20 %	0 %	470205689
42	NC_020557	CTTAG	2	10	51108	51117	20 %	40 %	20 %	20 %	470205689
43	NC_020557	TAAAA	2	10	52359	52368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020557	TGCTA	2	10	52533	52542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020557	TTTTA	2	10	52701	52710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020557	AGTTA	2	10	54007	54016	40 %	40 %	20 %	0 %	470205693
47	NC_020557	TTATG	2	10	54556	54565	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020557	CGCAA	2	10	57520	57529	40 %	0 %	20 %	40 %	470205696
49	NC_020557	TTTTA	2	10	58461	58470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020557	AAACG	2	10	62831	62840	60 %	0 %	20 %	20 %	470205702
51	NC_020557	CGAAA	2	10	64317	64326	60 %	0 %	20 %	20 %	470205703
52	NC_020557	AAAAC	2	10	64327	64336	80 %	0 %	0 %	20 %	470205703
53	NC_020557	AACAA	2	10	65711	65720	80 %	0 %	0 %	20 %	470205705
54	NC_020557	GAGAG	2	10	70760	70769	40 %	0 %	60 %	0 %	470205708
55	NC_020557	GCAAA	2	10	71942	71951	60 %	0 %	20 %	20 %	470205711
56	NC_020557	CAATA	2	10	72007	72016	60 %	20 %	0 %	20 %	470205711
57	NC_020557	GCCTT	2	10	72807	72816	0 %	40 %	20 %	40 %	470205712
58	NC_020557	CAAAA	2	10	73184	73193	80 %	0 %	0 %	20 %	470205712
59	NC_020557	GCTTG	2	10	75243	75252	0 %	40 %	40 %	20 %	470205715
60	NC_020557	AAACT	2	10	75253	75262	60 %	20 %	0 %	20 %	470205715
61	NC_020557	TCAAG	2	10	75918	75927	40 %	20 %	20 %	20 %	470205716
62	NC_020557	GCGCT	2	10	77278	77287	0 %	20 %	40 %	40 %	470205718
63	NC_020557	TCATT	2	10	80387	80396	20 %	60 %	0 %	20 %	470205721
64	NC_020557	ATTTT	2	10	80639	80648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020557	CTAAA	2	10	82752	82761	60 %	20 %	0 %	20 %	470205723
66	NC_020557	AAGTT	2	10	83177	83186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020557	GAAAA	2	10	84094	84103	80 %	0 %	20 %	0 %	470205724
68	NC_020557	TGAAA	2	10	84336	84345	60 %	20 %	20 %	0 %	470205724
69	NC_020557	AAATT	2	10	84680	84689	60 %	40 %	0 %	0 %	470205724
70	NC_020557	AGCGG	2	10	85264	85273	20 %	0 %	60 %	20 %	470205724
71	NC_020557	AGTTA	2	10	86673	86682	40 %	40 %	20 %	0 %	470205724
72	NC_020557	GAAAT	2	10	87760	87769	60 %	20 %	20 %	0 %	470205725
73	NC_020557	AAAAG	2	10	88072	88081	80 %	0 %	20 %	0 %	470205725
74	NC_020557	TGAAA	2	10	89069	89078	60 %	20 %	20 %	0 %	470205725
75	NC_020557	TGCAT	2	10	91729	91738	20 %	40 %	20 %	20 %	470205728
76	NC_020557	TTACT	2	10	91975	91984	20 %	60 %	0 %	20 %	470205728
77	NC_020557	GTTTT	2	10	93573	93582	0 %	80 %	20 %	0 %	470205730
78	NC_020557	GAAGT	2	10	93854	93863	40 %	20 %	40 %	0 %	470205730
79	NC_020557	AGCGG	2	10	95173	95182	20 %	0 %	60 %	20 %	470205731
80	NC_020557	ATATC	2	10	100977	100986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020557	TTCCA	2	10	101755	101764	20 %	40 %	0 %	40 %	470205741
82	NC_020557	AAAAG	2	10	103657	103666	80 %	0 %	20 %	0 %	470205743
83	NC_020557	ACGGT	2	10	105201	105210	20 %	20 %	40 %	20 %	470205744
84	NC_020557	GAAAT	2	10	106440	106449	60 %	20 %	20 %	0 %	470205745
85	NC_020557	GAATT	2	10	107081	107090	40 %	40 %	20 %	0 %	470205745
86	NC_020557	AACCA	2	10	110953	110962	60 %	0 %	0 %	40 %	470205748
87	NC_020557	CTCGA	2	10	112633	112642	20 %	20 %	20 %	40 %	470205750
88	NC_020557	TTCCA	2	10	112967	112976	20 %	40 %	0 %	40 %	470205750
89	NC_020557	TACTG	2	10	113232	113241	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020557	TCTCT	2	10	113805	113814	0 %	60 %	0 %	40 %	470205751
91	NC_020557	TTTTA	2	10	114165	114174	20 %	80 %	0 %	0 %	470205752
92	NC_020557	AAAAG	2	10	114430	114439	80 %	0 %	20 %	0 %	470205753
93	NC_020557	AAAGT	2	10	115457	115466	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020557	TTAGT	2	10	116578	116587	20 %	60 %	20 %	0 %	470205757
95	NC_020557	TTTAT	2	10	119487	119496	20 %	80 %	0 %	0 %	470205762
96	NC_020557	AAGTG	2	10	121509	121518	40 %	20 %	40 %	0 %	470205765
97	NC_020557	GTCAG	2	10	121954	121963	20 %	20 %	40 %	20 %	470205766
98	NC_020557	TTGTT	2	10	125101	125110	0 %	80 %	20 %	0 %	470205769
99	NC_020557	ATTTT	2	10	126827	126836	20 %	80 %	0 %	0 %	470205771
100	NC_020557	GCCGT	2	10	127866	127875	0 %	20 %	40 %	40 %	470205774
101	NC_020557	AAAAT	2	10	128267	128276	80 %	20 %	0 %	0 %	470205774
102	NC_020557	AACTT	2	10	129409	129418	40 %	40 %	0 %	20 %	470205776
103	NC_020557	ACAAA	2	10	129511	129520	80 %	0 %	0 %	20 %	470205776
104	NC_020557	CTTGA	2	10	130306	130315	20 %	40 %	20 %	20 %	470205776
105	NC_020557	TTGGT	2	10	131101	131110	0 %	60 %	40 %	0 %	470205777
106	NC_020557	TATGA	2	10	133971	133980	40 %	40 %	20 %	0 %	470205782
107	NC_020557	ACGGC	2	10	136689	136698	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_020557	TTTAA	2	10	136761	136770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020557	AATTT	2	10	136947	136956	40 %	60 %	0 %	0 %	470205787
110	NC_020557	GATAA	2	10	137110	137119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020557	AATAA	2	10	138216	138225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020557	GAATA	2	10	140126	140135	60 %	20 %	20 %	0 %	470205792
113	NC_020557	TTTAC	2	10	141325	141334	20 %	60 %	0 %	20 %	470205793
114	NC_020557	AGATG	2	10	141374	141383	40 %	20 %	40 %	0 %	470205793
115	NC_020557	ATATG	2	10	144041	144050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020557	TCTAA	2	10	146671	146680	40 %	40 %	0 %	20 %	470205796
117	NC_020557	AAATC	2	10	147186	147195	60 %	20 %	0 %	20 %	470205796
118	NC_020557	GGCTG	2	10	147223	147232	0 %	20 %	60 %	20 %	470205796
119	NC_020557	CGAAA	2	10	147801	147810	60 %	0 %	20 %	20 %	470205796
120	NC_020557	AAGAT	2	10	150190	150199	60 %	20 %	20 %	0 %	470205798
121	NC_020557	TGCGC	2	10	150311	150320	0 %	20 %	40 %	40 %	470205798
122	NC_020557	GAATT	2	10	150561	150570	40 %	40 %	20 %	0 %	470205799
123	NC_020557	AAATA	2	10	153616	153625	80 %	20 %	0 %	0 %	470205803
124	NC_020557	TTCTT	2	10	154821	154830	0 %	80 %	0 %	20 %	470205805
125	NC_020557	CTAAA	2	10	154969	154978	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020557	TTCCA	2	10	155372	155381	20 %	40 %	0 %	40 %	470205806
127	NC_020557	AACCT	2	10	157143	157152	40 %	20 %	0 %	40 %	470205807
128	NC_020557	ACAAA	2	10	159864	159873	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_020557	ACTTT	2	10	161135	161144	20 %	60 %	0 %	20 %	470205812
130	NC_020557	AAAAG	2	10	162564	162573	80 %	0 %	20 %	0 %	470205813
131	NC_020557	ATGAA	2	10	164338	164347	60 %	20 %	20 %	0 %	470205814
132	NC_020557	TACTT	2	10	167346	167355	20 %	60 %	0 %	20 %	470205818
133	NC_020557	AGTGA	2	10	169923	169932	40 %	20 %	40 %	0 %	470205820
134	NC_020557	CCGTA	2	10	171334	171343	20 %	20 %	20 %	40 %	470205821
135	NC_020557	TGGAA	2	10	172155	172164	40 %	20 %	40 %	0 %	470205822
136	NC_020557	ATGTA	2	10	172250	172259	40 %	40 %	20 %	0 %	470205822
137	NC_020557	GCGTT	2	10	174012	174021	0 %	40 %	40 %	20 %	470205823
138	NC_020557	AAGCG	2	10	174378	174387	40 %	0 %	40 %	20 %	470205823
139	NC_020557	CAAAA	2	10	174655	174664	80 %	0 %	0 %	20 %	470205823
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141	NC_020557	AGAAA	2	10	178270	178279	80 %	0 %	20 %	0 %	470205826
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144	NC_020557	AATTT	2	10	181120	181129	40 %	60 %	0 %	0 %	470205830
145	NC_020557	ATTTG	2	10	181947	181956	20 %	60 %	20 %	0 %	470205831
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147	NC_020557	ACAAA	2	10	186766	186775	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_020557	AAAGT	2	10	189095	189104	60 %	20 %	20 %	0 %	470205839
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156	NC_020557	TGAAA	2	10	194657	194666	60 %	20 %	20 %	0 %	470205844
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158	NC_020557	AAGTG	2	10	195512	195521	40 %	20 %	40 %	0 %	470205844
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162	NC_020557	AAAAG	2	10	197152	197161	80 %	0 %	20 %	0 %	470205845
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181	NC_020557	GAAAA	2	10	219046	219055	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020557	GAAAA	2	10	219249	219258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020557	AAACA	2	10	219342	219351	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_020557	TGATA	2	10	219819	219828	40 %	40 %	20 %	0 %	470205867
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186	NC_020557	AAATT	2	10	223991	224000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_020557	TCGTG	2	10	231367	231376	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_020557	AAGGT	2	10	232834	232843	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020557	ATTTT	2	10	236511	236520	20 %	80 %	0 %	0 %	470205874
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200	NC_020557	GGCAT	2	10	249785	249794	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
201	NC_020557	CAAAG	2	10	250885	250894	60 %	0 %	20 %	20 %	470205890
202	NC_020557	TCGTA	2	10	254707	254716	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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205	NC_020557	ATTTG	2	10	257856	257865	20 %	60 %	20 %	0 %	470205900
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236	NC_020557	ATTTG	2	10	303783	303792	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
237	NC_020557	TAGAT	2	10	303823	303832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
238	NC_020557	TTTGA	2	10	304932	304941	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
239	NC_020557	GTTTT	2	10	304943	304952	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
240	NC_020557	TTGGG	2	10	305647	305656	0 %	40 %	60 %	0 %	470205948
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243	NC_020557	TATTT	2	10	310994	311003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_020557	TGCGA	2	10	313882	313891	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_020557	TCAAG	2	10	320332	320341	40 %	20 %	20 %	20 %	470205967
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254	NC_020557	TAGTT	2	10	329906	329915	20 %	60 %	20 %	0 %	470205979
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256	NC_020557	TCCAA	2	10	331540	331549	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
257	NC_020557	AACTT	2	10	331771	331780	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
258	NC_020557	TACAG	2	10	335805	335814	40 %	20 %	20 %	20 %	470205982
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267	NC_020557	TTCAC	2	10	345885	345894	20 %	40 %	0 %	40 %	470205995
268	NC_020557	ATTTC	2	10	346318	346327	20 %	60 %	0 %	20 %	470205996
269	NC_020557	ACAAA	2	10	348531	348540	80 %	0 %	0 %	20 %	470205999
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271	NC_020557	GTGAT	2	10	353096	353105	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_020557	GGTTT	2	10	528517	528526	0 %	60 %	40 %	0 %	470206220
403	NC_020557	CCAAA	2	10	529370	529379	60 %	0 %	0 %	40 %	470206221
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