MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 63174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020557	AAAT	2	8	241372	241379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_020557	AGG	2	6	241492	241497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_020557	GT	3	6	241526	241531	0 %	50 %	50 %	0 %	470205877
5504	NC_020557	T	6	6	241531	241536	0 %	100 %	0 %	0 %	470205877
5505	NC_020557	TAAT	2	8	241611	241618	50 %	50 %	0 %	0 %	470205877
5506	NC_020557	TTA	2	6	241662	241667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205877
5507	NC_020557	CAAA	2	8	241814	241821	75 %	0 %	0 %	25 %	470205877
5508	NC_020557	AGT	2	6	241840	241845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205877
5509	NC_020557	GTC	2	6	241899	241904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205877
5510	NC_020557	AAAGA	2	10	241942	241951	80 %	0 %	20 %	0 %	470205877
5511	NC_020557	AGA	3	9	241957	241965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205877
5512	NC_020557	AGA	2	6	241972	241977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205877
5513	NC_020557	ATT	2	6	242018	242023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205877
5514	NC_020557	ACT	2	6	242048	242053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205877
5515	NC_020557	GGT	2	6	242071	242076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205877
5516	NC_020557	GTT	2	6	242285	242290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205877
5517	NC_020557	TGT	2	6	242377	242382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205877
5518	NC_020557	GAT	2	6	242456	242461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205877
5519	NC_020557	GAT	2	6	242467	242472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205877
5520	NC_020557	TGT	2	6	242473	242478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205877
5521	NC_020557	AGA	2	6	242479	242484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205877
5522	NC_020557	TTA	2	6	242496	242501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205877
5523	NC_020557	CAG	2	6	242544	242549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205877
5524	NC_020557	GAA	2	6	242550	242555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205877
5525	NC_020557	T	7	7	242614	242620	0 %	100 %	0 %	0 %	470205878
5526	NC_020557	TCAT	2	8	242695	242702	25 %	50 %	0 %	25 %	470205878
5527	NC_020557	T	6	6	242714	242719	0 %	100 %	0 %	0 %	470205878
5528	NC_020557	GTT	2	6	242731	242736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205878
5529	NC_020557	TTG	2	6	242746	242751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205878
5530	NC_020557	TG	3	6	242750	242755	0 %	50 %	50 %	0 %	470205878
5531	NC_020557	AAG	2	6	242758	242763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205878
5532	NC_020557	GAAA	2	8	242766	242773	75 %	0 %	25 %	0 %	470205878
5533	NC_020557	ATG	2	6	242908	242913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205878
5534	NC_020557	ATT	2	6	242940	242945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205878
5535	NC_020557	ATT	2	6	242951	242956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205878
5536	NC_020557	AGTAAA	2	12	242993	243004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470205878
5537	NC_020557	GTG	2	6	243021	243026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205878
5538	NC_020557	CGC	2	6	243079	243084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470205878
5539	NC_020557	TAT	2	6	243210	243215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205878
5540	NC_020557	ATG	2	6	243311	243316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205879
5541	NC_020557	TTA	2	6	243344	243349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205879
5542	NC_020557	TGG	2	6	243351	243356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205879
5543	NC_020557	CTA	2	6	243382	243387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205879
5544	NC_020557	T	6	6	243468	243473	0 %	100 %	0 %	0 %	470205879
5545	NC_020557	CTA	2	6	243578	243583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205879
5546	NC_020557	GAA	2	6	243718	243723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205879
5547	NC_020557	AAT	2	6	243758	243763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205879
5548	NC_020557	AAT	2	6	243774	243779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020557	TATT	2	8	243871	243878	25 %	75 %	0 %	0 %	470205880
5550	NC_020557	ATG	2	6	243890	243895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205880
5551	NC_020557	GAA	2	6	243952	243957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205880
5552	NC_020557	TCAA	2	8	244050	244057	50 %	25 %	0 %	25 %	470205880
5553	NC_020557	AGA	3	9	244119	244127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205880
5554	NC_020557	GTC	2	6	244190	244195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205880
5555	NC_020557	AAG	2	6	244223	244228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205880
5556	NC_020557	A	6	6	244351	244356	100 %	0 %	0 %	0 %	470205880
5557	NC_020557	GAT	2	6	244393	244398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205880
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5560	NC_020557	ATT	2	6	244564	244569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205880
5561	NC_020557	ATT	2	6	244614	244619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205880
5562	NC_020557	TTGG	2	8	244637	244644	0 %	50 %	50 %	0 %	470205880
5563	NC_020557	GAA	3	9	244657	244665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205880
5564	NC_020557	AGA	2	6	244677	244682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205880
5565	NC_020557	A	6	6	244761	244766	100 %	0 %	0 %	0 %	470205881
5566	NC_020557	ATG	2	6	244777	244782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205881
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5569	NC_020557	CTG	2	6	244828	244833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205881
5570	NC_020557	TGA	2	6	244961	244966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205881
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5572	NC_020557	A	6	6	245022	245027	100 %	0 %	0 %	0 %	470205881
5573	NC_020557	TTTA	2	8	245117	245124	25 %	75 %	0 %	0 %	470205881
5574	NC_020557	TAC	2	6	245137	245142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205881
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5576	NC_020557	TGAA	2	8	245243	245250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_020557	T	6	6	245276	245281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_020557	AT	3	6	245288	245293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_020557	GAA	2	6	245358	245363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_020557	AG	4	8	245384	245391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_020557	T	7	7	245578	245584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_020557	A	6	6	245602	245607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_020557	AGG	2	6	245624	245629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_020557	CAA	2	6	245630	245635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_020557	CGA	2	6	245689	245694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205882
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5589	NC_020557	T	6	6	245711	245716	0 %	100 %	0 %	0 %	470205882
5590	NC_020557	TGG	2	6	245742	245747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205882
5591	NC_020557	T	7	7	245763	245769	0 %	100 %	0 %	0 %	470205882
5592	NC_020557	TTTG	2	8	245786	245793	0 %	75 %	25 %	0 %	470205882
5593	NC_020557	TAT	2	6	245800	245805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205882
5594	NC_020557	CTA	2	6	245851	245856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205882
5595	NC_020557	CAG	2	6	245908	245913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205882
5596	NC_020557	GAT	2	6	245922	245927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205882
5597	NC_020557	CCT	2	6	246085	246090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470205882
5598	NC_020557	GTT	2	6	246121	246126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205882
5599	NC_020557	TAG	2	6	246206	246211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_020557	AAAGGA	2	12	246222	246233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_020557	GA	3	6	246275	246280	50 %	0 %	50 %	0 %	470205883
5602	NC_020557	GTGAA	2	10	246308	246317	40 %	20 %	40 %	0 %	470205883
5603	NC_020557	ATT	2	6	246376	246381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205883
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5606	NC_020557	GAT	2	6	246457	246462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205883
5607	NC_020557	TGA	2	6	246536	246541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205883
5608	NC_020557	A	6	6	246677	246682	100 %	0 %	0 %	0 %	470205884
5609	NC_020557	GCA	2	6	246727	246732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205884
5610	NC_020557	A	6	6	246878	246883	100 %	0 %	0 %	0 %	470205884
5611	NC_020557	GCGG	2	8	246911	246918	0 %	0 %	75 %	25 %	470205884
5612	NC_020557	ACT	2	6	246993	246998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205884
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5619	NC_020557	ATC	2	6	247218	247223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205884
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5621	NC_020557	AAC	2	6	247281	247286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205884
5622	NC_020557	GAT	2	6	247313	247318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205884
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5624	NC_020557	TAC	2	6	247351	247356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205884
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