MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 2018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020450	AACTG	2	10	258	267	40 %	20 %	20 %	20 %	459284226
2	NC_020450	ATAAA	2	10	7044	7053	80 %	20 %	0 %	0 %	459284229
3	NC_020450	AAGAT	2	10	9830	9839	60 %	20 %	20 %	0 %	459284230
4	NC_020450	AGTAA	2	10	9973	9982	60 %	20 %	20 %	0 %	459284231
5	NC_020450	TAATA	2	10	10157	10166	60 %	40 %	0 %	0 %	459284231
6	NC_020450	AAATG	2	10	11885	11894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020450	AATAA	2	10	12535	12544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020450	ATTCT	2	10	12906	12915	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020450	ATGGT	2	10	13047	13056	20 %	40 %	40 %	0 %	459284234
10	NC_020450	ATTTT	2	10	16048	16057	20 %	80 %	0 %	0 %	459284237
11	NC_020450	AAATG	2	10	16286	16295	60 %	20 %	20 %	0 %	459284237
12	NC_020450	TACTT	2	10	17948	17957	20 %	60 %	0 %	20 %	459284237
13	NC_020450	TTTAG	2	10	20020	20029	20 %	60 %	20 %	0 %	459284240
14	NC_020450	CTATT	2	10	20638	20647	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020450	ATGGA	2	10	20721	20730	40 %	20 %	40 %	0 %	459284242
16	NC_020450	AGTGG	2	10	20783	20792	20 %	20 %	60 %	0 %	459284242
17	NC_020450	GGGTT	2	10	21316	21325	0 %	40 %	60 %	0 %	459284242
18	NC_020450	ATTTT	2	10	22953	22962	20 %	80 %	0 %	0 %	459284243
19	NC_020450	TTTGG	2	10	23807	23816	0 %	60 %	40 %	0 %	459284244
20	NC_020450	TGGTA	2	10	25747	25756	20 %	40 %	40 %	0 %	459284245
21	NC_020450	CTTAA	2	10	26806	26815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020450	AAGTC	2	10	26947	26956	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020450	TTTTA	2	10	28295	28304	20 %	80 %	0 %	0 %	459284246
24	NC_020450	GATTG	2	10	34136	34145	20 %	40 %	40 %	0 %	459284251
25	NC_020450	AAAAG	2	10	34587	34596	80 %	0 %	20 %	0 %	459284252
26	NC_020450	GGAGA	2	10	34936	34945	40 %	0 %	60 %	0 %	459284252
27	NC_020450	ATTCA	2	10	35212	35221	40 %	40 %	0 %	20 %	459284252
28	NC_020450	AAATT	2	10	35565	35574	60 %	40 %	0 %	0 %	459284252
29	NC_020450	GAAAT	2	10	36003	36012	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020450	ATCAA	2	10	36541	36550	60 %	20 %	0 %	20 %	459284253
31	NC_020450	AGTAA	2	10	37037	37046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020450	AATTA	2	10	37750	37759	60 %	40 %	0 %	0 %	459284254
33	NC_020450	GGATT	2	10	37855	37864	20 %	40 %	40 %	0 %	459284254
34	NC_020450	ATTAT	2	10	38023	38032	40 %	60 %	0 %	0 %	459284254
35	NC_020450	CTTAT	2	10	38216	38225	20 %	60 %	0 %	20 %	459284254
36	NC_020450	AAATA	2	10	38370	38379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020450	TATTG	2	10	40532	40541	20 %	60 %	20 %	0 %	459284257
38	NC_020450	TTTAA	2	10	40665	40674	40 %	60 %	0 %	0 %	459284257
39	NC_020450	TTAAT	2	10	41651	41660	40 %	60 %	0 %	0 %	459284258
40	NC_020450	CAAAA	2	10	42850	42859	80 %	0 %	0 %	20 %	459284259
41	NC_020450	TAGTA	2	10	43128	43137	40 %	40 %	20 %	0 %	459284259
42	NC_020450	GCTTG	2	10	43744	43753	0 %	40 %	40 %	20 %	459284260
43	NC_020450	TCCAT	2	10	44095	44104	20 %	40 %	0 %	40 %	459284260
44	NC_020450	GGCTT	2	10	46874	46883	0 %	40 %	40 %	20 %	459284262
45	NC_020450	AATTA	2	10	47378	47387	60 %	40 %	0 %	0 %	459284263
46	NC_020450	GACTT	2	10	47837	47846	20 %	40 %	20 %	20 %	459284264
47	NC_020450	GTTTT	2	10	47991	48000	0 %	80 %	20 %	0 %	459284264
48	NC_020450	TTTCA	2	10	48034	48043	20 %	60 %	0 %	20 %	459284264
49	NC_020450	ATTCA	2	10	49290	49299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020450	AAATT	2	10	49631	49640	60 %	40 %	0 %	0 %	459284265
51	NC_020450	CTTAA	2	10	49905	49914	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020450	GGTTC	2	10	51054	51063	0 %	40 %	40 %	20 %	459284266
53	NC_020450	CTTTA	2	10	51089	51098	20 %	60 %	0 %	20 %	459284266
54	NC_020450	ATTTT	2	10	51262	51271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020450	CAAAT	2	10	52711	52720	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020450	AGAAT	2	10	54162	54171	60 %	20 %	20 %	0 %	459284269
57	NC_020450	AGTTT	2	10	55557	55566	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020450	AATAA	2	10	55711	55720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020450	AATCA	2	10	56709	56718	60 %	20 %	0 %	20 %	459284270
60	NC_020450	CCATT	2	10	58798	58807	20 %	40 %	0 %	40 %	459284271
61	NC_020450	TGAAA	2	10	59017	59026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020450	ATGAT	2	10	60533	60542	40 %	40 %	20 %	0 %	459284274
63	NC_020450	TGGTT	2	10	61529	61538	0 %	60 %	40 %	0 %	459284275
64	NC_020450	GTAAA	2	10	63034	63043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020450	ATTTA	2	10	65294	65303	40 %	60 %	0 %	0 %	459284280
66	NC_020450	TTTTA	2	10	68120	68129	20 %	80 %	0 %	0 %	459284283
67	NC_020450	AGATT	2	10	71939	71948	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020450	TCAAG	2	10	72917	72926	40 %	20 %	20 %	20 %	459284289
69	NC_020450	GTTTG	2	10	73555	73564	0 %	60 %	40 %	0 %	459284289
70	NC_020450	ATAGA	2	10	73789	73798	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020450	TATCT	2	10	77120	77129	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020450	TAGCT	2	10	77620	77629	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020450	TAAAA	2	10	77795	77804	80 %	20 %	0 %	0 %	459284292
74	NC_020450	CAGGT	2	10	79629	79638	20 %	20 %	40 %	20 %	459284294
75	NC_020450	TCTGG	2	10	80169	80178	0 %	40 %	40 %	20 %	459284294
76	NC_020450	TATGA	2	10	81026	81035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020450	GTTTG	2	10	81222	81231	0 %	60 %	40 %	0 %	459284295
78	NC_020450	ACAAT	2	10	85122	85131	60 %	20 %	0 %	20 %	459284298
79	NC_020450	GATTT	2	10	85193	85202	20 %	60 %	20 %	0 %	459284298
80	NC_020450	TTACA	2	10	86171	86180	40 %	40 %	0 %	20 %	459284299
81	NC_020450	AATAG	2	10	90475	90484	60 %	20 %	20 %	0 %	459284304
82	NC_020450	TGGGT	2	10	91587	91596	0 %	40 %	60 %	0 %	459284305
83	NC_020450	AGCTT	2	10	92282	92291	20 %	40 %	20 %	20 %	459284305
84	NC_020450	TATTC	2	10	93150	93159	20 %	60 %	0 %	20 %	459284306
85	NC_020450	TTTTA	2	10	93883	93892	20 %	80 %	0 %	0 %	459284307
86	NC_020450	ATTTT	2	10	95825	95834	20 %	80 %	0 %	0 %	459284309
87	NC_020450	TTATT	2	10	96026	96035	20 %	80 %	0 %	0 %	459284309
88	NC_020450	AATTC	2	10	96499	96508	40 %	40 %	0 %	20 %	459284309
89	NC_020450	TATAA	2	10	96713	96722	60 %	40 %	0 %	0 %	459284309
90	NC_020450	TGGAT	2	10	97461	97470	20 %	40 %	40 %	0 %	459284310
91	NC_020450	ATCTT	2	10	98919	98928	20 %	60 %	0 %	20 %	459284311
92	NC_020450	GAAAA	2	10	100370	100379	80 %	0 %	20 %	0 %	459284312
93	NC_020450	CCAAA	2	10	101198	101207	60 %	0 %	0 %	40 %	459284312
94	NC_020450	TGGCT	2	10	102160	102169	0 %	40 %	40 %	20 %	459284314
95	NC_020450	GCCAT	2	10	102360	102369	20 %	20 %	20 %	40 %	459284314
96	NC_020450	CAAAT	2	10	102739	102748	60 %	20 %	0 %	20 %	459284315
97	NC_020450	TTTTA	2	10	103011	103020	20 %	80 %	0 %	0 %	459284315
98	NC_020450	TTTTA	2	10	103341	103350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020450	GCTTG	2	10	107714	107723	0 %	40 %	40 %	20 %	459284322
100	NC_020450	TAAAA	2	10	109388	109397	80 %	20 %	0 %	0 %	459284325
101	NC_020450	TCTCT	2	10	111180	111189	0 %	60 %	0 %	40 %	459284329
102	NC_020450	CGTCG	2	10	113369	113378	0 %	20 %	40 %	40 %	459284331
103	NC_020450	ACCAA	2	10	114799	114808	60 %	0 %	0 %	40 %	459284332
104	NC_020450	TGTAT	2	10	115469	115478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020450	ACAAA	2	10	117756	117765	80 %	0 %	0 %	20 %	459284333
106	NC_020450	AAATT	2	10	118605	118614	60 %	40 %	0 %	0 %	459284333
107	NC_020450	GCAAA	2	10	118827	118836	60 %	0 %	20 %	20 %	459284333
108	NC_020450	AATAC	2	10	119594	119603	60 %	20 %	0 %	20 %	459284333
109	NC_020450	AATAC	2	10	119879	119888	60 %	20 %	0 %	20 %	459284333
110	NC_020450	TAAAA	2	10	121946	121955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020450	TTTTA	2	10	121982	121991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020450	ATGGA	2	10	124340	124349	40 %	20 %	40 %	0 %	459284335
113	NC_020450	TAATT	2	10	124439	124448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020450	AATGT	2	10	125022	125031	40 %	40 %	20 %	0 %	459284336
115	NC_020450	TAATT	2	10	128069	128078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020450	AAGTC	2	10	129319	129328	40 %	20 %	20 %	20 %	459284339
117	NC_020450	TGTTT	2	10	130608	130617	0 %	80 %	20 %	0 %	459284340
118	NC_020450	GCTTT	2	10	134043	134052	0 %	60 %	20 %	20 %	459284345
119	NC_020450	CGTCA	2	10	134465	134474	20 %	20 %	20 %	40 %	459284346
120	NC_020450	TGTCA	2	10	135138	135147	20 %	40 %	20 %	20 %	459284346
121	NC_020450	TTTAT	2	10	135154	135163	20 %	80 %	0 %	0 %	459284346
122	NC_020450	TAATT	2	10	136691	136700	40 %	60 %	0 %	0 %	459284347
123	NC_020450	ACGGA	2	10	141702	141711	40 %	0 %	40 %	20 %	459284352
124	NC_020450	TTTTG	2	10	142816	142825	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020450	TTTTG	2	10	143156	143165	0 %	80 %	20 %	0 %	459284353
126	NC_020450	GAATT	2	10	143776	143785	40 %	40 %	20 %	0 %	459284353
127	NC_020450	AAATC	2	10	144489	144498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_020450	TGAAA	2	10	144851	144860	60 %	20 %	20 %	0 %	459284354
129	NC_020450	AATTT	2	10	146539	146548	40 %	60 %	0 %	0 %	459284356
130	NC_020450	TCTTT	2	10	147407	147416	0 %	80 %	0 %	20 %	459284357
131	NC_020450	TTTGA	2	10	148357	148366	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020450	ATGAA	2	10	149775	149784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020450	CCAAA	2	10	151468	151477	60 %	0 %	0 %	40 %	459284361
134	NC_020450	TATAA	2	10	152605	152614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020450	TTGGC	2	10	152948	152957	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020450	GTAAA	2	10	153666	153675	60 %	20 %	20 %	0 %	459284363
137	NC_020450	AAATT	2	10	154818	154827	60 %	40 %	0 %	0 %	459284364
138	NC_020450	ATTCG	2	10	156375	156384	20 %	40 %	20 %	20 %	459284365
139	NC_020450	ATTTT	2	10	157899	157908	20 %	80 %	0 %	0 %	459284367
140	NC_020450	TCACA	2	10	158293	158302	40 %	20 %	0 %	40 %	459284367
141	NC_020450	TTGGT	2	10	159439	159448	0 %	60 %	40 %	0 %	459284368
142	NC_020450	CAAGA	2	10	160603	160612	60 %	0 %	20 %	20 %	459284369
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144	NC_020450	AAATT	2	10	162503	162512	60 %	40 %	0 %	0 %	459284371
145	NC_020450	ACAAT	2	10	163608	163617	60 %	20 %	0 %	20 %	459284373
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147	NC_020450	TCGAT	2	10	164840	164849	20 %	40 %	20 %	20 %	459284373
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151	NC_020450	AAAGT	2	10	171500	171509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020450	TGATT	2	10	173289	173298	20 %	60 %	20 %	0 %	459284384
153	NC_020450	CTTAT	2	10	173531	173540	20 %	60 %	0 %	20 %	459284384
154	NC_020450	TGGAA	2	10	175742	175751	40 %	20 %	40 %	0 %	459284387
155	NC_020450	TGATT	2	10	175821	175830	20 %	60 %	20 %	0 %	459284387
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161	NC_020450	AAAGA	2	10	179496	179505	80 %	0 %	20 %	0 %	459284390
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165	NC_020450	TTCCT	2	10	182518	182527	0 %	60 %	0 %	40 %	459284393
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171	NC_020450	ACAGG	2	10	187958	187967	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_020450	TGATT	2	10	191570	191579	20 %	60 %	20 %	0 %	459284400
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191	NC_020450	TGACA	2	10	221972	221981	40 %	20 %	20 %	20 %	459284432
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208	NC_020450	TTCCT	2	10	242403	242412	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
209	NC_020450	AATAA	2	10	242423	242432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_020450	TTTGC	2	10	242601	242610	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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219	NC_020450	AAATA	2	10	256389	256398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_020450	ACTGA	2	10	257985	257994	40 %	20 %	20 %	20 %	459284463
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242	NC_020450	AGATA	2	10	283121	283130	60 %	20 %	20 %	0 %	459284488
243	NC_020450	AGAGC	2	10	283135	283144	40 %	0 %	40 %	20 %	459284488
244	NC_020450	TCAAA	2	10	287036	287045	60 %	20 %	0 %	20 %	459284492
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246	NC_020450	TTCTC	2	10	287656	287665	0 %	60 %	0 %	40 %	459284492
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248	NC_020450	GATTT	2	10	292327	292336	20 %	60 %	20 %	0 %	459284496
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250	NC_020450	AAAAG	2	10	294187	294196	80 %	0 %	20 %	0 %	459284498
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252	NC_020450	TTTTA	2	10	294711	294720	20 %	80 %	0 %	0 %	459284498
253	NC_020450	ATTTT	2	10	296251	296260	20 %	80 %	0 %	0 %	459284500
254	NC_020450	TATAC	2	10	296656	296665	40 %	40 %	0 %	20 %	459284500
255	NC_020450	ATTTT	2	10	298834	298843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_020450	GATAA	2	10	300675	300684	60 %	20 %	20 %	0 %	459284503
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258	NC_020450	ATATC	2	10	306726	306735	40 %	40 %	0 %	20 %	459284510
259	NC_020450	CAGCT	2	10	307825	307834	20 %	20 %	20 %	40 %	459284511
260	NC_020450	AGAAC	2	10	308178	308187	60 %	0 %	20 %	20 %	459284511
261	NC_020450	TAAAA	2	10	309770	309779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_020450	TTTTA	2	10	311712	311721	20 %	80 %	0 %	0 %	459284515
263	NC_020450	GCGCT	2	10	312029	312038	0 %	20 %	40 %	40 %	459284515
264	NC_020450	AAAAT	2	10	312540	312549	80 %	20 %	0 %	0 %	459284516
265	NC_020450	AAAAT	2	10	314469	314478	80 %	20 %	0 %	0 %	459284517
266	NC_020450	GAAAA	2	10	314479	314488	80 %	0 %	20 %	0 %	459284518
267	NC_020450	ACTTT	2	10	314492	314501	20 %	60 %	0 %	20 %	459284518
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269	NC_020450	TGATT	2	10	315826	315835	20 %	60 %	20 %	0 %	459284519
270	NC_020450	CACTT	2	10	322414	322423	20 %	40 %	0 %	40 %	459284527
271	NC_020450	TTGAT	2	10	322897	322906	20 %	60 %	20 %	0 %	459284527
272	NC_020450	TGGTT	2	10	323165	323174	0 %	60 %	40 %	0 %	459284527
273	NC_020450	TTTGT	2	10	323895	323904	0 %	80 %	20 %	0 %	459284528
274	NC_020450	TGTAT	2	10	325388	325397	20 %	60 %	20 %	0 %	459284528
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277	NC_020450	ATTGT	2	10	326701	326710	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_020450	TTCAA	2	10	336636	336645	40 %	40 %	0 %	20 %	459284537
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288	NC_020450	ATGTC	2	10	343291	343300	20 %	40 %	20 %	20 %	459284541
289	NC_020450	TTGGG	2	10	343625	343634	0 %	40 %	60 %	0 %	459284541
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293	NC_020450	TTATA	2	10	347412	347421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_020450	CAGGA	2	10	347773	347782	40 %	0 %	40 %	20 %	459284545
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296	NC_020450	CTTTC	2	10	351126	351135	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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350	NC_020450	GGCTT	2	10	429769	429778	0 %	40 %	40 %	20 %	459284620
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374	NC_020450	ATAAA	2	10	467240	467249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_020450	TTGAT	2	10	478006	478015	20 %	60 %	20 %	0 %	459284663
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387	NC_020450	TTTTA	2	10	482957	482966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_020450	TTGCC	2	10	491693	491702	0 %	40 %	20 %	40 %	459284674
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399	NC_020450	AAGCG	2	10	500576	500585	40 %	0 %	40 %	20 %	459284684
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401	NC_020450	ATTAT	2	10	503009	503018	40 %	60 %	0 %	0 %	459284686
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