MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 7218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020450	TGTC	2	8	110	117	0 %	50 %	25 %	25 %	459284226
2	NC_020450	CTTG	2	8	138	145	0 %	50 %	25 %	25 %	459284226
3	NC_020450	AATC	2	8	286	293	50 %	25 %	0 %	25 %	459284226
4	NC_020450	TATT	2	8	461	468	25 %	75 %	0 %	0 %	459284226
5	NC_020450	ATGC	2	8	502	509	25 %	25 %	25 %	25 %	459284226
6	NC_020450	TGAC	2	8	527	534	25 %	25 %	25 %	25 %	459284226
7	NC_020450	TCAA	2	8	1681	1688	50 %	25 %	0 %	25 %	459284227
8	NC_020450	ATCA	2	8	2142	2149	50 %	25 %	0 %	25 %	459284227
9	NC_020450	TTGA	2	8	2254	2261	25 %	50 %	25 %	0 %	459284227
10	NC_020450	AGGT	2	8	2450	2457	25 %	25 %	50 %	0 %	459284227
11	NC_020450	TGAT	2	8	2531	2538	25 %	50 %	25 %	0 %	459284227
12	NC_020450	GTAC	2	8	2653	2660	25 %	25 %	25 %	25 %	459284227
13	NC_020450	AATT	2	8	2662	2669	50 %	50 %	0 %	0 %	459284227
14	NC_020450	TGTC	2	8	2712	2719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020450	GAAA	2	8	2901	2908	75 %	0 %	25 %	0 %	459284228
16	NC_020450	AAAT	2	8	3629	3636	75 %	25 %	0 %	0 %	459284228
17	NC_020450	GAAA	2	8	3795	3802	75 %	0 %	25 %	0 %	459284228
18	NC_020450	CTTT	2	8	4639	4646	0 %	75 %	0 %	25 %	459284228
19	NC_020450	AGAC	2	8	5320	5327	50 %	0 %	25 %	25 %	459284228
20	NC_020450	TTTA	2	8	5624	5631	25 %	75 %	0 %	0 %	459284228
21	NC_020450	ATCA	2	8	5665	5672	50 %	25 %	0 %	25 %	459284228
22	NC_020450	TGAA	2	8	5825	5832	50 %	25 %	25 %	0 %	459284228
23	NC_020450	ATGA	2	8	5989	5996	50 %	25 %	25 %	0 %	459284228
24	NC_020450	TATC	2	8	6509	6516	25 %	50 %	0 %	25 %	459284229
25	NC_020450	TTGA	2	8	7064	7071	25 %	50 %	25 %	0 %	459284229
26	NC_020450	TGAT	2	8	7266	7273	25 %	50 %	25 %	0 %	459284229
27	NC_020450	TGGT	2	8	7344	7351	0 %	50 %	50 %	0 %	459284229
28	NC_020450	CAAT	2	8	7361	7368	50 %	25 %	0 %	25 %	459284229
29	NC_020450	AATT	2	8	7446	7453	50 %	50 %	0 %	0 %	459284229
30	NC_020450	GATG	2	8	7522	7529	25 %	25 %	50 %	0 %	459284229
31	NC_020450	ATTG	2	8	7729	7736	25 %	50 %	25 %	0 %	459284229
32	NC_020450	GTTC	2	8	7772	7779	0 %	50 %	25 %	25 %	459284229
33	NC_020450	TCCT	2	8	8080	8087	0 %	50 %	0 %	50 %	459284229
34	NC_020450	ATTT	2	8	9243	9250	25 %	75 %	0 %	0 %	459284229
35	NC_020450	TTTG	2	8	9328	9335	0 %	75 %	25 %	0 %	459284229
36	NC_020450	AGAT	2	8	9505	9512	50 %	25 %	25 %	0 %	459284229
37	NC_020450	GATA	2	8	9705	9712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020450	TTTC	2	8	10268	10275	0 %	75 %	0 %	25 %	459284231
39	NC_020450	CAAT	2	8	10339	10346	50 %	25 %	0 %	25 %	459284231
40	NC_020450	TAAT	2	8	10731	10738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020450	AAAT	2	8	11022	11029	75 %	25 %	0 %	0 %	459284232
42	NC_020450	AATT	2	8	11165	11172	50 %	50 %	0 %	0 %	459284232
43	NC_020450	ACTT	2	8	11626	11633	25 %	50 %	0 %	25 %	459284232
44	NC_020450	AAGG	2	8	11977	11984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020450	TCAG	2	8	12035	12042	25 %	25 %	25 %	25 %	459284233
46	NC_020450	TCAA	2	8	12075	12082	50 %	25 %	0 %	25 %	459284233
47	NC_020450	CTTA	2	8	12132	12139	25 %	50 %	0 %	25 %	459284233
48	NC_020450	TTGT	2	8	13113	13120	0 %	75 %	25 %	0 %	459284234
49	NC_020450	TTTA	2	8	13209	13216	25 %	75 %	0 %	0 %	459284234
50	NC_020450	TATG	2	8	13564	13571	25 %	50 %	25 %	0 %	459284234
51	NC_020450	TAGA	2	8	14047	14054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020450	TAAA	2	8	14108	14115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020450	GAAA	2	8	14428	14435	75 %	0 %	25 %	0 %	459284235
54	NC_020450	ATGA	2	8	15000	15007	50 %	25 %	25 %	0 %	459284236
55	NC_020450	CATG	2	8	15071	15078	25 %	25 %	25 %	25 %	459284236
56	NC_020450	GCGT	2	8	15103	15110	0 %	25 %	50 %	25 %	459284236
57	NC_020450	CTTT	2	8	16420	16427	0 %	75 %	0 %	25 %	459284237
58	NC_020450	TGAT	2	8	16672	16679	25 %	50 %	25 %	0 %	459284237
59	NC_020450	TCAA	2	8	17214	17221	50 %	25 %	0 %	25 %	459284237
60	NC_020450	AAAC	2	8	17767	17774	75 %	0 %	0 %	25 %	459284237
61	NC_020450	ATGT	2	8	19244	19251	25 %	50 %	25 %	0 %	459284238
62	NC_020450	TAAA	2	8	19555	19562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020450	CAAA	2	8	19571	19578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020450	AAAT	2	8	21756	21763	75 %	25 %	0 %	0 %	459284242
65	NC_020450	GGTA	2	8	21817	21824	25 %	25 %	50 %	0 %	459284242
66	NC_020450	CAAT	2	8	22699	22706	50 %	25 %	0 %	25 %	459284243
67	NC_020450	TAAT	2	8	22745	22752	50 %	50 %	0 %	0 %	459284243
68	NC_020450	CAAA	2	8	22813	22820	75 %	0 %	0 %	25 %	459284243
69	NC_020450	AAGT	2	8	22874	22881	50 %	25 %	25 %	0 %	459284243
70	NC_020450	ATTG	2	8	23510	23517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020450	TACT	2	8	23946	23953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020450	AATC	2	8	24197	24204	50 %	25 %	0 %	25 %	459284245
73	NC_020450	TTGC	2	8	24809	24816	0 %	50 %	25 %	25 %	459284245
74	NC_020450	ATGG	2	8	25055	25062	25 %	25 %	50 %	0 %	459284245
75	NC_020450	AAAC	2	8	25222	25229	75 %	0 %	0 %	25 %	459284245
76	NC_020450	TGAA	2	8	25308	25315	50 %	25 %	25 %	0 %	459284245
77	NC_020450	AAGA	2	8	25406	25413	75 %	0 %	25 %	0 %	459284245
78	NC_020450	TCAA	2	8	25420	25427	50 %	25 %	0 %	25 %	459284245
79	NC_020450	TGCT	2	8	25551	25558	0 %	50 %	25 %	25 %	459284245
80	NC_020450	CAAC	2	8	25580	25587	50 %	0 %	0 %	50 %	459284245
81	NC_020450	TATT	2	8	25779	25786	25 %	75 %	0 %	0 %	459284245
82	NC_020450	TGAT	2	8	25836	25843	25 %	50 %	25 %	0 %	459284245
83	NC_020450	GCGT	2	8	26534	26541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020450	TATT	2	8	26903	26910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020450	TTTA	2	8	27175	27182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020450	TGCT	2	8	27412	27419	0 %	50 %	25 %	25 %	459284246
87	NC_020450	TGGT	2	8	27484	27491	0 %	50 %	50 %	0 %	459284246
88	NC_020450	TTAA	2	8	27669	27676	50 %	50 %	0 %	0 %	459284246
89	NC_020450	TGGT	2	8	27730	27737	0 %	50 %	50 %	0 %	459284246
90	NC_020450	CAAT	2	8	27859	27866	50 %	25 %	0 %	25 %	459284246
91	NC_020450	TGAT	2	8	28321	28328	25 %	50 %	25 %	0 %	459284246
92	NC_020450	ATTA	2	8	29015	29022	50 %	50 %	0 %	0 %	459284246
93	NC_020450	ATCA	2	8	29321	29328	50 %	25 %	0 %	25 %	459284247
94	NC_020450	AGCA	2	8	29593	29600	50 %	0 %	25 %	25 %	459284247
95	NC_020450	TAAA	2	8	29658	29665	75 %	25 %	0 %	0 %	459284247
96	NC_020450	TGAC	2	8	29715	29722	25 %	25 %	25 %	25 %	459284247
97	NC_020450	AAGC	2	8	29819	29826	50 %	0 %	25 %	25 %	459284247
98	NC_020450	ATAA	2	8	30134	30141	75 %	25 %	0 %	0 %	459284247
99	NC_020450	AAGA	2	8	30340	30347	75 %	0 %	25 %	0 %	459284247
100	NC_020450	AAGA	2	8	30720	30727	75 %	0 %	25 %	0 %	459284247
101	NC_020450	TTCA	2	8	30783	30790	25 %	50 %	0 %	25 %	459284247
102	NC_020450	GTTG	2	8	31191	31198	0 %	50 %	50 %	0 %	459284248
103	NC_020450	ATTA	2	8	31538	31545	50 %	50 %	0 %	0 %	459284248
104	NC_020450	TAAA	2	8	31657	31664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020450	AGTA	2	8	31670	31677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020450	AGTG	2	8	32220	32227	25 %	25 %	50 %	0 %	459284249
107	NC_020450	TTAA	2	8	32496	32503	50 %	50 %	0 %	0 %	459284249
108	NC_020450	CGAA	2	8	33035	33042	50 %	0 %	25 %	25 %	459284250
109	NC_020450	CATT	2	8	33231	33238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020450	TTTG	2	8	33339	33346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020450	ATTT	2	8	33684	33691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020450	AACA	2	8	33998	34005	75 %	0 %	0 %	25 %	459284251
113	NC_020450	TTTG	2	8	34006	34013	0 %	75 %	25 %	0 %	459284251
114	NC_020450	TAAA	2	8	34269	34276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020450	ATTT	2	8	34305	34312	25 %	75 %	0 %	0 %	459284252
116	NC_020450	ACCA	2	8	34366	34373	50 %	0 %	0 %	50 %	459284252
117	NC_020450	ATCA	2	8	34471	34478	50 %	25 %	0 %	25 %	459284252
118	NC_020450	AGAA	2	8	34522	34529	75 %	0 %	25 %	0 %	459284252
119	NC_020450	ATAA	2	8	34609	34616	75 %	25 %	0 %	0 %	459284252
120	NC_020450	TTCG	2	8	34656	34663	0 %	50 %	25 %	25 %	459284252
121	NC_020450	ATTT	2	8	34815	34822	25 %	75 %	0 %	0 %	459284252
122	NC_020450	AATA	2	8	35629	35636	75 %	25 %	0 %	0 %	459284252
123	NC_020450	CATT	2	8	35640	35647	25 %	50 %	0 %	25 %	459284252
124	NC_020450	AGGG	2	8	35815	35822	25 %	0 %	75 %	0 %	459284252
125	NC_020450	AAAT	2	8	36050	36057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020450	AGTC	2	8	36201	36208	25 %	25 %	25 %	25 %	459284253
127	NC_020450	TGAG	2	8	36328	36335	25 %	25 %	50 %	0 %	459284253
128	NC_020450	ATTA	2	8	37511	37518	50 %	50 %	0 %	0 %	459284254
129	NC_020450	ATTC	2	8	38122	38129	25 %	50 %	0 %	25 %	459284254
130	NC_020450	AGCA	2	8	38248	38255	50 %	0 %	25 %	25 %	459284254
131	NC_020450	ATTT	2	8	38966	38973	25 %	75 %	0 %	0 %	459284255
132	NC_020450	AAAT	2	8	39146	39153	75 %	25 %	0 %	0 %	459284255
133	NC_020450	TCAT	2	8	39735	39742	25 %	50 %	0 %	25 %	459284257
134	NC_020450	GAGC	2	8	39946	39953	25 %	0 %	50 %	25 %	459284257
135	NC_020450	TCAA	2	8	40023	40030	50 %	25 %	0 %	25 %	459284257
136	NC_020450	GTCA	2	8	40037	40044	25 %	25 %	25 %	25 %	459284257
137	NC_020450	AGTA	2	8	40107	40114	50 %	25 %	25 %	0 %	459284257
138	NC_020450	TGTT	2	8	40127	40134	0 %	75 %	25 %	0 %	459284257
139	NC_020450	AAAC	2	8	40785	40792	75 %	0 %	0 %	25 %	459284257
140	NC_020450	AGAA	2	8	41005	41012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020450	ATCA	2	8	41199	41206	50 %	25 %	0 %	25 %	459284258
142	NC_020450	TCAA	2	8	42184	42191	50 %	25 %	0 %	25 %	459284258
143	NC_020450	TAAC	2	8	42335	42342	50 %	25 %	0 %	25 %	459284258
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