MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 34457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020450	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284226
2	NC_020450	CGG	2	6	197	202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284226
3	NC_020450	GAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284226
4	NC_020450	ATG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284226
5	NC_020450	AGC	2	6	305	310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284226
6	NC_020450	TGG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284226
7	NC_020450	TTC	2	6	561	566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284226
8	NC_020450	AAT	2	6	784	789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284226
9	NC_020450	ACT	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284226
10	NC_020450	ATT	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284226
11	NC_020450	TTG	2	6	1151	1156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284226
12	NC_020450	GGC	2	6	1258	1263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284226
13	NC_020450	CTA	3	9	1476	1484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020450	TAT	2	6	1489	1494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020450	TAA	2	6	1542	1547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284227
16	NC_020450	ATA	2	6	1706	1711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284227
17	NC_020450	TTA	2	6	1750	1755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284227
18	NC_020450	GCT	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284227
19	NC_020450	AGA	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
20	NC_020450	ATG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284227
21	NC_020450	AAG	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
22	NC_020450	TCA	2	6	2198	2203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284227
23	NC_020450	TTA	2	6	2241	2246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284227
24	NC_020450	TGC	2	6	2331	2336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284227
25	NC_020450	GTA	2	6	2425	2430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284227
26	NC_020450	GAA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
27	NC_020450	AAG	2	6	2489	2494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
28	NC_020450	GAA	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
29	NC_020450	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
30	NC_020450	TTA	2	6	2862	2867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
31	NC_020450	CTT	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
32	NC_020450	GCA	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284228
33	NC_020450	TAT	2	6	2983	2988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
34	NC_020450	ACA	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284228
35	NC_020450	CAG	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284228
36	NC_020450	GAG	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284228
37	NC_020450	AGA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
38	NC_020450	CTG	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284228
39	NC_020450	GAA	2	6	3238	3243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
40	NC_020450	ACT	2	6	3266	3271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284228
41	NC_020450	GTC	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284228
42	NC_020450	GAA	2	6	3373	3378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
43	NC_020450	TGA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
44	NC_020450	CTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
45	NC_020450	CTG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284228
46	NC_020450	TAG	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
47	NC_020450	GCT	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284228
48	NC_020450	AAG	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
49	NC_020450	AAT	2	6	3904	3909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284228
50	NC_020450	GAT	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
51	NC_020450	TCT	2	6	3933	3938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
52	NC_020450	TGA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
53	NC_020450	TGA	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
54	NC_020450	TTA	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
55	NC_020450	TGT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284228
56	NC_020450	TTG	2	6	4451	4456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284228
57	NC_020450	TAA	2	6	4467	4472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284228
58	NC_020450	GAA	2	6	4546	4551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
59	NC_020450	TGA	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
60	NC_020450	ATT	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
61	NC_020450	TTC	2	6	4760	4765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
62	NC_020450	AAG	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
63	NC_020450	TTG	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284228
64	NC_020450	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
65	NC_020450	TGA	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
66	NC_020450	TAT	2	6	4952	4957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
67	NC_020450	AAG	3	9	5183	5191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
68	NC_020450	TGA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
69	NC_020450	ATG	2	6	5237	5242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
70	NC_020450	AGA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
71	NC_020450	TGA	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
72	NC_020450	AGT	2	6	5386	5391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
73	NC_020450	TGA	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
74	NC_020450	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
75	NC_020450	TCT	2	6	5476	5481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
76	NC_020450	ATT	2	6	5483	5488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
77	NC_020450	AAG	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
78	NC_020450	ATG	2	6	5714	5719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
79	NC_020450	AAG	2	6	5798	5803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
80	NC_020450	GCA	2	6	6245	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284229
81	NC_020450	TGA	2	6	6307	6312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
82	NC_020450	AAG	2	6	6480	6485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284229
83	NC_020450	GAA	2	6	6554	6559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284229
84	NC_020450	ACT	2	6	6617	6622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284229
85	NC_020450	CAG	2	6	6729	6734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284229
86	NC_020450	ATA	2	6	6843	6848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284229
87	NC_020450	TTC	2	6	6937	6942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284229
88	NC_020450	ATG	2	6	7254	7259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
89	NC_020450	GTG	2	6	7479	7484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284229
90	NC_020450	AGA	2	6	7558	7563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284229
91	NC_020450	CTT	2	6	7628	7633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284229
92	NC_020450	TGA	2	6	7654	7659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
93	NC_020450	AGC	2	6	7708	7713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284229
94	NC_020450	ATA	3	9	7788	7796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284229
95	NC_020450	TGA	2	6	7840	7845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
96	NC_020450	TAA	2	6	8047	8052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284229
97	NC_020450	CTA	2	6	8191	8196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284229
98	NC_020450	ATT	2	6	8299	8304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284229
99	NC_020450	CAA	2	6	8323	8328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284229
100	NC_020450	AAT	2	6	8342	8347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284229
101	NC_020450	TGA	2	6	8394	8399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
102	NC_020450	AGA	2	6	8482	8487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284229
103	NC_020450	AGC	2	6	8632	8637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284229
104	NC_020450	AGA	2	6	8644	8649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284229
105	NC_020450	AGA	2	6	8779	8784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284229
106	NC_020450	AGA	2	6	8878	8883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284229
107	NC_020450	GAA	2	6	8939	8944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284229
108	NC_020450	ATA	2	6	8958	8963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284229
109	NC_020450	TGA	2	6	8977	8982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
110	NC_020450	AGC	2	6	9028	9033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284229
111	NC_020450	CTG	2	6	9180	9185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284229
112	NC_020450	TGA	2	6	9268	9273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
113	NC_020450	TGA	2	6	9283	9288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
114	NC_020450	AAG	2	6	9384	9389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284229
115	NC_020450	TTC	2	6	9520	9525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284229
116	NC_020450	AGG	2	6	9634	9639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284229
117	NC_020450	TTG	2	6	9654	9659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284229
118	NC_020450	GAT	2	6	9668	9673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
119	NC_020450	GAA	2	6	9748	9753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284230
120	NC_020450	TGA	3	9	9861	9869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284230
121	NC_020450	TAA	2	6	9883	9888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284230
122	NC_020450	TAA	2	6	9961	9966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284231
123	NC_020450	ACC	2	6	10054	10059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284231
124	NC_020450	ATA	2	6	10131	10136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284231
125	NC_020450	AGT	2	6	10193	10198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284231
126	NC_020450	CTA	2	6	10398	10403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284231
127	NC_020450	CTT	3	9	10423	10431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284231
128	NC_020450	GGT	2	6	10567	10572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020450	TGA	2	6	10618	10623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020450	CAG	2	6	10772	10777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284232
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132	NC_020450	CAT	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284232
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147	NC_020450	GAA	2	6	11945	11950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_020450	GAT	2	6	12569	12574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_020450	TAA	2	6	19516	19521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_020450	TTA	3	9	19546	19554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_020450	AAT	2	6	20597	20602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284241
257	NC_020450	TAT	2	6	20616	20621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_020450	ACA	2	6	20704	20709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_020450	ATT	2	6	20713	20718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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