MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 56398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020450	A	6	6	174288	174293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020450	TAA	2	6	174319	174324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284386
4003	NC_020450	TGA	2	6	174368	174373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284386
4004	NC_020450	AGC	2	6	174428	174433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284386
4005	NC_020450	TGA	2	6	174449	174454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284386
4006	NC_020450	TGA	2	6	174530	174535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284386
4007	NC_020450	A	6	6	174535	174540	100 %	0 %	0 %	0 %	459284386
4008	NC_020450	GCA	2	6	174576	174581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284386
4009	NC_020450	CTGAAT	2	12	174679	174690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	459284386
4010	NC_020450	GGAC	2	8	174693	174700	25 %	0 %	50 %	25 %	459284386
4011	NC_020450	GAA	2	6	174714	174719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284386
4012	NC_020450	CAT	2	6	174749	174754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284386
4013	NC_020450	GTT	2	6	174840	174845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284386
4014	NC_020450	ATC	2	6	174934	174939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284386
4015	NC_020450	TGC	2	6	174950	174955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284386
4016	NC_020450	GCAAAA	2	12	175050	175061	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	459284386
4017	NC_020450	CAA	2	6	175075	175080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284386
4018	NC_020450	AAAAGC	2	12	175091	175102	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	459284386
4019	NC_020450	AAG	2	6	175129	175134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284386
4020	NC_020450	A	6	6	175203	175208	100 %	0 %	0 %	0 %	459284386
4021	NC_020450	AAT	2	6	175305	175310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_020450	TAAA	2	8	175314	175321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_020450	AAC	2	6	175339	175344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284387
4024	NC_020450	A	6	6	175348	175353	100 %	0 %	0 %	0 %	459284387
4025	NC_020450	GAA	2	6	175417	175422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284387
4026	NC_020450	ATA	2	6	175439	175444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284387
4027	NC_020450	A	6	6	175618	175623	100 %	0 %	0 %	0 %	459284387
4028	NC_020450	GAA	2	6	175624	175629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284387
4029	NC_020450	T	6	6	175643	175648	0 %	100 %	0 %	0 %	459284387
4030	NC_020450	CAG	2	6	175664	175669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284387
4031	NC_020450	TAA	2	6	175692	175697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284387
4032	NC_020450	ATT	2	6	175719	175724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284387
4033	NC_020450	TGGAA	2	10	175742	175751	40 %	20 %	40 %	0 %	459284387
4034	NC_020450	GCA	2	6	175765	175770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284387
4035	NC_020450	A	7	7	175801	175807	100 %	0 %	0 %	0 %	459284387
4036	NC_020450	TGATT	2	10	175821	175830	20 %	60 %	20 %	0 %	459284387
4037	NC_020450	ATT	3	9	175970	175978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284387
4038	NC_020450	AAT	2	6	176005	176010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284387
4039	NC_020450	CAA	2	6	176045	176050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284387
4040	NC_020450	ATT	2	6	176065	176070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284387
4041	NC_020450	A	6	6	176111	176116	100 %	0 %	0 %	0 %	459284387
4042	NC_020450	TTG	2	6	176147	176152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284387
4043	NC_020450	AT	3	6	176181	176186	50 %	50 %	0 %	0 %	459284387
4044	NC_020450	G	6	6	176227	176232	0 %	0 %	100 %	0 %	459284387
4045	NC_020450	TGT	2	6	176277	176282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284387
4046	NC_020450	GAC	2	6	176304	176309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284387
4047	NC_020450	ATTT	2	8	176326	176333	25 %	75 %	0 %	0 %	459284387
4048	NC_020450	GAA	2	6	176428	176433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284387
4049	NC_020450	TGA	2	6	176493	176498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284387
4050	NC_020450	TCG	2	6	176586	176591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284388
4051	NC_020450	AAAC	2	8	176615	176622	75 %	0 %	0 %	25 %	459284388
4052	NC_020450	ACTG	2	8	176627	176634	25 %	25 %	25 %	25 %	459284388
4053	NC_020450	TTG	2	6	176682	176687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284388
4054	NC_020450	ACA	2	6	176706	176711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284388
4055	NC_020450	AATTA	2	10	176713	176722	60 %	40 %	0 %	0 %	459284388
4056	NC_020450	ATA	2	6	176775	176780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284388
4057	NC_020450	T	7	7	176797	176803	0 %	100 %	0 %	0 %	459284388
4058	NC_020450	GAT	2	6	176813	176818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284388
4059	NC_020450	AGA	2	6	176851	176856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284388
4060	NC_020450	ATA	2	6	176871	176876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284388
4061	NC_020450	TAT	2	6	176891	176896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284388
4062	NC_020450	CAGT	2	8	176953	176960	25 %	25 %	25 %	25 %	459284388
4063	NC_020450	CATG	2	8	177076	177083	25 %	25 %	25 %	25 %	459284388
4064	NC_020450	AGC	2	6	177103	177108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284388
4065	NC_020450	A	7	7	177205	177211	100 %	0 %	0 %	0 %	459284388
4066	NC_020450	TGG	2	6	177245	177250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284388
4067	NC_020450	AAAGC	2	10	177365	177374	60 %	0 %	20 %	20 %	459284388
4068	NC_020450	GTC	2	6	177375	177380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284388
4069	NC_020450	TAAAAA	2	12	177406	177417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	459284388
4070	NC_020450	TTA	2	6	177444	177449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284388
4071	NC_020450	A	6	6	177472	177477	100 %	0 %	0 %	0 %	459284388
4072	NC_020450	TTC	2	6	177487	177492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284389
4073	NC_020450	TTAA	2	8	177523	177530	50 %	50 %	0 %	0 %	459284389
4074	NC_020450	CAA	2	6	177716	177721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284389
4075	NC_020450	TCT	2	6	177794	177799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284389
4076	NC_020450	GTT	2	6	177802	177807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284389
4077	NC_020450	TTAAT	2	10	177821	177830	40 %	60 %	0 %	0 %	459284389
4078	NC_020450	TTA	2	6	177848	177853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284389
4079	NC_020450	TAAT	2	8	177863	177870	50 %	50 %	0 %	0 %	459284389
4080	NC_020450	ATC	2	6	177925	177930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284389
4081	NC_020450	AGT	2	6	178002	178007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284389
4082	NC_020450	AGC	2	6	178014	178019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284389
4083	NC_020450	TATC	2	8	178038	178045	25 %	50 %	0 %	25 %	459284389
4084	NC_020450	CCAAC	2	10	178157	178166	40 %	0 %	0 %	60 %	459284389
4085	NC_020450	AT	3	6	178209	178214	50 %	50 %	0 %	0 %	459284389
4086	NC_020450	GGACTT	2	12	178234	178245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	459284389
4087	NC_020450	TTAA	2	8	178287	178294	50 %	50 %	0 %	0 %	459284389
4088	NC_020450	GTAA	2	8	178334	178341	50 %	25 %	25 %	0 %	459284390
4089	NC_020450	AAC	2	6	178425	178430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284390
4090	NC_020450	TTG	2	6	178482	178487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284390
4091	NC_020450	TTTC	2	8	178581	178588	0 %	75 %	0 %	25 %	459284390
4092	NC_020450	TGA	2	6	178681	178686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284390
4093	NC_020450	ATT	2	6	178749	178754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284390
4094	NC_020450	ATT	2	6	178872	178877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284390
4095	NC_020450	GAAA	2	8	178883	178890	75 %	0 %	25 %	0 %	459284390
4096	NC_020450	A	7	7	178888	178894	100 %	0 %	0 %	0 %	459284390
4097	NC_020450	AAC	2	6	178903	178908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284390
4098	NC_020450	CATGA	2	10	178922	178931	40 %	20 %	20 %	20 %	459284390
4099	NC_020450	A	7	7	178939	178945	100 %	0 %	0 %	0 %	459284390
4100	NC_020450	TAA	2	6	178951	178956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284390
4101	NC_020450	AAG	2	6	179058	179063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284390
4102	NC_020450	AGA	2	6	179071	179076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284390
4103	NC_020450	TAT	2	6	179112	179117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284390
4104	NC_020450	ACAA	2	8	179125	179132	75 %	0 %	0 %	25 %	459284390
4105	NC_020450	AAC	2	6	179139	179144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284390
4106	NC_020450	AGA	2	6	179176	179181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284390
4107	NC_020450	TAA	2	6	179317	179322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284390
4108	NC_020450	A	6	6	179391	179396	100 %	0 %	0 %	0 %	459284390
4109	NC_020450	ATT	3	9	179399	179407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284390
4110	NC_020450	AAAGA	2	10	179496	179505	80 %	0 %	20 %	0 %	459284390
4111	NC_020450	A	6	6	179514	179519	100 %	0 %	0 %	0 %	459284391
4112	NC_020450	T	7	7	179539	179545	0 %	100 %	0 %	0 %	459284391
4113	NC_020450	TTG	2	6	179548	179553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284391
4114	NC_020450	TTG	2	6	179557	179562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284391
4115	NC_020450	CTG	2	6	179680	179685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284391
4116	NC_020450	ATCA	2	8	179692	179699	50 %	25 %	0 %	25 %	459284391
4117	NC_020450	T	7	7	179759	179765	0 %	100 %	0 %	0 %	459284391
4118	NC_020450	AGTAA	2	10	179793	179802	60 %	20 %	20 %	0 %	459284391
4119	NC_020450	ATC	2	6	179964	179969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284391
4120	NC_020450	A	6	6	179970	179975	100 %	0 %	0 %	0 %	459284391
4121	NC_020450	T	6	6	180149	180154	0 %	100 %	0 %	0 %	459284391
4122	NC_020450	ATT	2	6	180162	180167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284391
4123	NC_020450	TTTA	2	8	180214	180221	25 %	75 %	0 %	0 %	459284391
4124	NC_020450	A	6	6	180255	180260	100 %	0 %	0 %	0 %	459284391
4125	NC_020450	GTG	2	6	180301	180306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284391
4126	NC_020450	GTA	2	6	180366	180371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284391
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4128	NC_020450	AAC	2	6	180416	180421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284391
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4134	NC_020450	GTTG	2	8	180727	180734	0 %	50 %	50 %	0 %	459284391
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4140	NC_020450	A	7	7	181074	181080	100 %	0 %	0 %	0 %	459284392
4141	NC_020450	ATG	2	6	181104	181109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284392
4142	NC_020450	TGT	2	6	181137	181142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284392
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4152	NC_020450	A	6	6	181560	181565	100 %	0 %	0 %	0 %	459284392
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4238	NC_020450	AAT	2	6	185116	185121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284395
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4243	NC_020450	AATC	2	8	185219	185226	50 %	25 %	0 %	25 %	459284395
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4247	NC_020450	GTTTAT	2	12	185377	185388	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	459284395
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4375	NC_020450	TTA	2	6	190280	190285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284399
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4379	NC_020450	ATT	2	6	190417	190422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284399
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4471	NC_020450	A	7	7	194220	194226	100 %	0 %	0 %	0 %	459284402
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4492	NC_020450	T	6	6	195058	195063	0 %	100 %	0 %	0 %	459284402
4493	NC_020450	TCAA	2	8	195124	195131	50 %	25 %	0 %	25 %	459284402
4494	NC_020450	GAAT	2	8	195176	195183	50 %	25 %	25 %	0 %	459284402
4495	NC_020450	CTC	2	6	195202	195207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459284402
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4499	NC_020450	AGA	2	6	195331	195336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_020450	GAA	2	6	195391	195396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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