MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 56398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020450	CTT	2	6	43095	43100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284259
1003	NC_020450	GCA	2	6	43109	43114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284259
1004	NC_020450	GTG	2	6	43122	43127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284259
1005	NC_020450	TAGTA	2	10	43128	43137	40 %	40 %	20 %	0 %	459284259
1006	NC_020450	ATT	2	6	43204	43209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284259
1007	NC_020450	CAA	2	6	43225	43230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284259
1008	NC_020450	ACA	2	6	43262	43267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284259
1009	NC_020450	ATT	2	6	43363	43368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284259
1010	NC_020450	GT	3	6	43374	43379	0 %	50 %	50 %	0 %	459284259
1011	NC_020450	CCA	2	6	43505	43510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284259
1012	NC_020450	TCT	2	6	43547	43552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284259
1013	NC_020450	TTGC	2	8	43560	43567	0 %	50 %	25 %	25 %	459284259
1014	NC_020450	CCA	2	6	43592	43597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284259
1015	NC_020450	ATCTTT	2	12	43630	43641	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	459284259
1016	NC_020450	TGC	2	6	43672	43677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284259
1017	NC_020450	GCTTG	2	10	43744	43753	0 %	40 %	40 %	20 %	459284260
1018	NC_020450	T	6	6	43787	43792	0 %	100 %	0 %	0 %	459284260
1019	NC_020450	TTG	2	6	43804	43809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284260
1020	NC_020450	TCAG	2	8	43891	43898	25 %	25 %	25 %	25 %	459284260
1021	NC_020450	ACGA	2	8	43911	43918	50 %	0 %	25 %	25 %	459284260
1022	NC_020450	T	6	6	43926	43931	0 %	100 %	0 %	0 %	459284260
1023	NC_020450	CCA	2	6	43932	43937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284260
1024	NC_020450	TCT	2	6	43948	43953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284260
1025	NC_020450	TCA	2	6	43975	43980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284260
1026	NC_020450	AAC	2	6	44025	44030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284260
1027	NC_020450	CTT	2	6	44063	44068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284260
1028	NC_020450	TCCAT	2	10	44095	44104	20 %	40 %	0 %	40 %	459284260
1029	NC_020450	AGC	2	6	44142	44147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284260
1030	NC_020450	GAG	2	6	44153	44158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284260
1031	NC_020450	CAA	2	6	44216	44221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284260
1032	NC_020450	GAA	2	6	44275	44280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284260
1033	NC_020450	CCA	2	6	44281	44286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284260
1034	NC_020450	T	6	6	44316	44321	0 %	100 %	0 %	0 %	459284260
1035	NC_020450	T	6	6	44325	44330	0 %	100 %	0 %	0 %	459284260
1036	NC_020450	CAT	2	6	44411	44416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284260
1037	NC_020450	AGA	2	6	44458	44463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284260
1038	NC_020450	ATG	2	6	44549	44554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284260
1039	NC_020450	CTT	2	6	44570	44575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284260
1040	NC_020450	TCA	2	6	44686	44691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284260
1041	NC_020450	CAA	2	6	44723	44728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284260
1042	NC_020450	CTT	2	6	44735	44740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284260
1043	NC_020450	ATA	2	6	44824	44829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284260
1044	NC_020450	T	6	6	44873	44878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020450	CTT	2	6	44985	44990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284261
1046	NC_020450	AATT	2	8	45096	45103	50 %	50 %	0 %	0 %	459284261
1047	NC_020450	CCG	2	6	45149	45154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459284261
1048	NC_020450	T	7	7	45237	45243	0 %	100 %	0 %	0 %	459284261
1049	NC_020450	TCA	2	6	45260	45265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284261
1050	NC_020450	GCT	2	6	45395	45400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284261
1051	NC_020450	TCA	2	6	45416	45421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284261
1052	NC_020450	GA	3	6	45430	45435	50 %	0 %	50 %	0 %	459284261
1053	NC_020450	AGG	2	6	45467	45472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284261
1054	NC_020450	T	6	6	45616	45621	0 %	100 %	0 %	0 %	459284261
1055	NC_020450	A	6	6	45655	45660	100 %	0 %	0 %	0 %	459284261
1056	NC_020450	TCA	2	6	45680	45685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284261
1057	NC_020450	CAC	2	6	45696	45701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284261
1058	NC_020450	CGA	2	6	45713	45718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284261
1059	NC_020450	CAT	2	6	45729	45734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284261
1060	NC_020450	TAA	2	6	45903	45908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284261
1061	NC_020450	A	8	8	46101	46108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020450	CGA	2	6	46141	46146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284262
1063	NC_020450	TGA	2	6	46175	46180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284262
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1066	NC_020450	TTC	2	6	46295	46300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284262
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1073	NC_020450	TGT	2	6	46695	46700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284262
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1076	NC_020450	ATT	2	6	46893	46898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284262
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1086	NC_020450	AG	3	6	47360	47365	50 %	0 %	50 %	0 %	459284263
1087	NC_020450	TC	3	6	47372	47377	0 %	50 %	0 %	50 %	459284263
1088	NC_020450	AATTA	2	10	47378	47387	60 %	40 %	0 %	0 %	459284263
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1093	NC_020450	TCA	2	6	47511	47516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284263
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1096	NC_020450	GAGCAA	2	12	47590	47601	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	459284263
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1099	NC_020450	AAAT	2	8	47705	47712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020450	TAG	2	6	47775	47780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020450	ATT	2	6	47808	47813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284264
1102	NC_020450	GACTT	2	10	47837	47846	20 %	40 %	20 %	20 %	459284264
1103	NC_020450	T	6	6	47921	47926	0 %	100 %	0 %	0 %	459284264
1104	NC_020450	ACG	2	6	47938	47943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284264
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1106	NC_020450	GTTTT	2	10	47991	48000	0 %	80 %	20 %	0 %	459284264
1107	NC_020450	ACC	2	6	48013	48018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284264
1108	NC_020450	TTTCA	2	10	48034	48043	20 %	60 %	0 %	20 %	459284264
1109	NC_020450	GGTCAG	2	12	48138	48149	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	459284264
1110	NC_020450	T	6	6	48166	48171	0 %	100 %	0 %	0 %	459284264
1111	NC_020450	GT	3	6	48177	48182	0 %	50 %	50 %	0 %	459284264
1112	NC_020450	TCA	2	6	48188	48193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284264
1113	NC_020450	CAG	2	6	48261	48266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284264
1114	NC_020450	TG	3	6	48310	48315	0 %	50 %	50 %	0 %	459284264
1115	NC_020450	ATT	2	6	48322	48327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284264
1116	NC_020450	CAG	2	6	48417	48422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284264
1117	NC_020450	CAG	2	6	48450	48455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284264
1118	NC_020450	GATT	2	8	48457	48464	25 %	50 %	25 %	0 %	459284264
1119	NC_020450	ATA	2	6	48541	48546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284264
1120	NC_020450	TGAA	2	8	48581	48588	50 %	25 %	25 %	0 %	459284264
1121	NC_020450	CTG	2	6	48615	48620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284264
1122	NC_020450	AGT	2	6	48624	48629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284264
1123	NC_020450	TTG	2	6	48694	48699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284264
1124	NC_020450	TG	3	6	48848	48853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020450	ATT	2	6	48868	48873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020450	TAAA	2	8	48897	48904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_020450	A	7	7	48909	48915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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