MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 56398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020450	A	6	6	22784	22789	100 %	0 %	0 %	0 %	459284243
502	NC_020450	ATC	2	6	22791	22796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284243
503	NC_020450	A	6	6	22798	22803	100 %	0 %	0 %	0 %	459284243
504	NC_020450	CAAA	2	8	22813	22820	75 %	0 %	0 %	25 %	459284243
505	NC_020450	ACA	2	6	22827	22832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284243
506	NC_020450	T	6	6	22849	22854	0 %	100 %	0 %	0 %	459284243
507	NC_020450	AAGT	2	8	22874	22881	50 %	25 %	25 %	0 %	459284243
508	NC_020450	A	6	6	22885	22890	100 %	0 %	0 %	0 %	459284243
509	NC_020450	CAA	2	6	22924	22929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284243
510	NC_020450	ATTTT	2	10	22953	22962	20 %	80 %	0 %	0 %	459284243
511	NC_020450	A	6	6	22991	22996	100 %	0 %	0 %	0 %	459284243
512	NC_020450	TCA	2	6	23136	23141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284243
513	NC_020450	A	6	6	23143	23148	100 %	0 %	0 %	0 %	459284243
514	NC_020450	T	6	6	23158	23163	0 %	100 %	0 %	0 %	459284243
515	NC_020450	GA	3	6	23192	23197	50 %	0 %	50 %	0 %	459284243
516	NC_020450	A	6	6	23218	23223	100 %	0 %	0 %	0 %	459284243
517	NC_020450	AGA	2	6	23287	23292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284243
518	NC_020450	A	7	7	23340	23346	100 %	0 %	0 %	0 %	459284243
519	NC_020450	AGA	3	9	23380	23388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020450	A	6	6	23443	23448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020450	TTC	2	6	23466	23471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_020450	ATTG	2	8	23510	23517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020450	CGG	2	6	23557	23562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284244
524	NC_020450	TCT	2	6	23570	23575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284244
525	NC_020450	CAG	2	6	23607	23612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284244
526	NC_020450	TTG	2	6	23634	23639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284244
527	NC_020450	ATT	2	6	23645	23650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284244
528	NC_020450	CTT	2	6	23723	23728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284244
529	NC_020450	TTG	2	6	23748	23753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284244
530	NC_020450	ATT	2	6	23766	23771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284244
531	NC_020450	TGT	2	6	23797	23802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284244
532	NC_020450	TTTGG	2	10	23807	23816	0 %	60 %	40 %	0 %	459284244
533	NC_020450	GAA	2	6	23822	23827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284244
534	NC_020450	AAT	2	6	23880	23885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284244
535	NC_020450	A	6	6	23929	23934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020450	TACT	2	8	23946	23953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_020450	TTA	2	6	24018	24023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020450	AAG	2	6	24035	24040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020450	TAA	3	9	24058	24066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020450	AAC	2	6	24095	24100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284245
541	NC_020450	AAC	2	6	24102	24107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284245
542	NC_020450	A	6	6	24127	24132	100 %	0 %	0 %	0 %	459284245
543	NC_020450	TTG	4	12	24159	24170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284245
544	NC_020450	TCT	2	6	24183	24188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284245
545	NC_020450	AGT	2	6	24191	24196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
546	NC_020450	AATC	2	8	24197	24204	50 %	25 %	0 %	25 %	459284245
547	NC_020450	TGA	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
548	NC_020450	GTAAAA	2	12	24326	24337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	459284245
549	NC_020450	AAT	2	6	24344	24349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284245
550	NC_020450	TAG	2	6	24370	24375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
551	NC_020450	TAT	2	6	24400	24405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284245
552	NC_020450	ATG	2	6	24453	24458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
553	NC_020450	GTT	2	6	24470	24475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284245
554	NC_020450	TCA	2	6	24482	24487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284245
555	NC_020450	TC	3	6	24508	24513	0 %	50 %	0 %	50 %	459284245
556	NC_020450	AT	3	6	24514	24519	50 %	50 %	0 %	0 %	459284245
557	NC_020450	TTG	2	6	24537	24542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284245
558	NC_020450	TCT	2	6	24546	24551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284245
559	NC_020450	ATG	2	6	24557	24562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
560	NC_020450	GGC	2	6	24587	24592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284245
561	NC_020450	ACA	2	6	24631	24636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284245
562	NC_020450	GTT	2	6	24710	24715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284245
563	NC_020450	A	6	6	24734	24739	100 %	0 %	0 %	0 %	459284245
564	NC_020450	CAG	2	6	24765	24770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284245
565	NC_020450	TTC	2	6	24774	24779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284245
566	NC_020450	CAGGTA	2	12	24792	24803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	459284245
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568	NC_020450	TGTCGG	2	12	24886	24897	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	459284245
569	NC_020450	TGA	2	6	24961	24966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
570	NC_020450	GTC	2	6	24981	24986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284245
571	NC_020450	GTG	2	6	24990	24995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284245
572	NC_020450	TGG	3	9	25003	25011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284245
573	NC_020450	ATGG	2	8	25055	25062	25 %	25 %	50 %	0 %	459284245
574	NC_020450	GAT	2	6	25070	25075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
575	NC_020450	TGC	2	6	25096	25101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284245
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577	NC_020450	TGAA	2	8	25308	25315	50 %	25 %	25 %	0 %	459284245
578	NC_020450	TTG	2	6	25323	25328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284245
579	NC_020450	A	6	6	25343	25348	100 %	0 %	0 %	0 %	459284245
580	NC_020450	TGC	2	6	25357	25362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284245
581	NC_020450	TGA	2	6	25369	25374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
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588	NC_020450	GAA	2	6	25568	25573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284245
589	NC_020450	CAAC	2	8	25580	25587	50 %	0 %	0 %	50 %	459284245
590	NC_020450	GAC	2	6	25629	25634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284245
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592	NC_020450	AC	3	6	25697	25702	50 %	0 %	0 %	50 %	459284245
593	NC_020450	TGGTA	2	10	25747	25756	20 %	40 %	40 %	0 %	459284245
594	NC_020450	TATT	2	8	25779	25786	25 %	75 %	0 %	0 %	459284245
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599	NC_020450	AC	3	6	25901	25906	50 %	0 %	0 %	50 %	459284245
600	NC_020450	TGA	2	6	26002	26007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
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604	NC_020450	TC	3	6	26051	26056	0 %	50 %	0 %	50 %	459284245
605	NC_020450	TGA	2	6	26077	26082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
606	NC_020450	TGA	2	6	26110	26115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284245
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609	NC_020450	AGA	2	6	26155	26160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284245
610	NC_020450	T	9	9	26188	26196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020450	A	6	6	26232	26237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020450	GAC	2	6	26273	26278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_020450	TTA	2	6	26287	26292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020450	ATT	2	6	26305	26310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020450	A	7	7	26340	26346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020450	ATA	2	6	26358	26363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020450	CAA	2	6	26387	26392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_020450	CGG	2	6	26435	26440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_020450	GGA	2	6	26475	26480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020450	GCGT	2	8	26534	26541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_020450	TCC	2	6	26558	26563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_020450	AGC	2	6	26585	26590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020450	TCG	2	6	26599	26604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_020450	CGG	2	6	26700	26705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020450	CTTAA	2	10	26806	26815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
626	NC_020450	TATT	2	8	26903	26910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020450	AAGTC	2	10	26947	26956	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
628	NC_020450	GTA	2	6	27038	27043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020450	ATG	2	6	27061	27066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020450	T	7	7	27117	27123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_020450	TTTA	2	8	27175	27182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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764	NC_020450	T	6	6	32857	32862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
765	NC_020450	A	8	8	32905	32912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
766	NC_020450	TTA	2	6	32924	32929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284250
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772	NC_020450	GTT	2	6	33221	33226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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774	NC_020450	AAT	2	6	33317	33322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
775	NC_020450	TTTG	2	8	33339	33346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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786	NC_020450	A	6	6	33835	33840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
787	NC_020450	A	6	6	33886	33891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
788	NC_020450	GTT	2	6	33892	33897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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799	NC_020450	T	6	6	34299	34304	0 %	100 %	0 %	0 %	459284252
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