MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 56398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020450	TGAT	2	8	218614	218621	25 %	50 %	25 %	0 %	459284427
5002	NC_020450	T	6	6	218621	218626	0 %	100 %	0 %	0 %	459284427
5003	NC_020450	AAAG	2	8	218636	218643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_020450	AGG	2	6	218717	218722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_020450	A	7	7	218733	218739	100 %	0 %	0 %	0 %	459284428
5006	NC_020450	TTA	2	6	218740	218745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284428
5007	NC_020450	TTGA	2	8	218805	218812	25 %	50 %	25 %	0 %	459284428
5008	NC_020450	ATT	2	6	218832	218837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284428
5009	NC_020450	GGAA	2	8	218924	218931	50 %	0 %	50 %	0 %	459284428
5010	NC_020450	CAG	2	6	218938	218943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284428
5011	NC_020450	CTG	2	6	219004	219009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284428
5012	NC_020450	ATT	2	6	219043	219048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284428
5013	NC_020450	TGA	2	6	219058	219063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284428
5014	NC_020450	ATT	2	6	219117	219122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284428
5015	NC_020450	GAT	2	6	219129	219134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284428
5016	NC_020450	GAG	2	6	219172	219177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284428
5017	NC_020450	CTT	2	6	219232	219237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284428
5018	NC_020450	GTC	2	6	219267	219272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284428
5019	NC_020450	TGA	2	6	219347	219352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284428
5020	NC_020450	A	6	6	219406	219411	100 %	0 %	0 %	0 %	459284428
5021	NC_020450	CTT	2	6	219418	219423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284428
5022	NC_020450	AGA	2	6	219458	219463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284428
5023	NC_020450	ATGA	2	8	219546	219553	50 %	25 %	25 %	0 %	459284428
5024	NC_020450	AGA	2	6	219572	219577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284428
5025	NC_020450	A	6	6	219577	219582	100 %	0 %	0 %	0 %	459284428
5026	NC_020450	A	6	6	219597	219602	100 %	0 %	0 %	0 %	459284428
5027	NC_020450	GA	4	8	219724	219731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_020450	A	6	6	219778	219783	100 %	0 %	0 %	0 %	459284429
5029	NC_020450	A	6	6	219924	219929	100 %	0 %	0 %	0 %	459284429
5030	NC_020450	AGG	2	6	219956	219961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284429
5031	NC_020450	AATT	2	8	220036	220043	50 %	50 %	0 %	0 %	459284429
5032	NC_020450	A	6	6	220066	220071	100 %	0 %	0 %	0 %	459284429
5033	NC_020450	A	6	6	220093	220098	100 %	0 %	0 %	0 %	459284429
5034	NC_020450	GTT	2	6	220173	220178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284429
5035	NC_020450	CTT	2	6	220216	220221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284429
5036	NC_020450	TTAT	2	8	220274	220281	25 %	75 %	0 %	0 %	459284429
5037	NC_020450	GTA	2	6	220299	220304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284429
5038	NC_020450	A	7	7	220360	220366	100 %	0 %	0 %	0 %	459284430
5039	NC_020450	GGT	2	6	220409	220414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284430
5040	NC_020450	GAA	2	6	220466	220471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284430
5041	NC_020450	T	6	6	220496	220501	0 %	100 %	0 %	0 %	459284430
5042	NC_020450	GAAT	2	8	220518	220525	50 %	25 %	25 %	0 %	459284430
5043	NC_020450	GACA	2	8	220546	220553	50 %	0 %	25 %	25 %	459284430
5044	NC_020450	CT	3	6	220608	220613	0 %	50 %	0 %	50 %	459284430
5045	NC_020450	A	6	6	220656	220661	100 %	0 %	0 %	0 %	459284430
5046	NC_020450	TAT	2	6	220734	220739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284431
5047	NC_020450	GCA	2	6	220757	220762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284431
5048	NC_020450	TTGG	2	8	220815	220822	0 %	50 %	50 %	0 %	459284431
5049	NC_020450	GCTGTC	2	12	220835	220846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284431
5050	NC_020450	CTT	2	6	220858	220863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284431
5051	NC_020450	ATT	2	6	220998	221003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284431
5052	NC_020450	GAA	2	6	221015	221020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284431
5053	NC_020450	TTC	2	6	221029	221034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284431
5054	NC_020450	ATT	2	6	221088	221093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284431
5055	NC_020450	GGT	2	6	221162	221167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284431
5056	NC_020450	AAT	2	6	221176	221181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284431
5057	NC_020450	TTA	2	6	221193	221198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284431
5058	NC_020450	CAA	2	6	221223	221228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284431
5059	NC_020450	AAT	2	6	221269	221274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284431
5060	NC_020450	TTG	2	6	221349	221354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284431
5061	NC_020450	ACT	2	6	221371	221376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284431
5062	NC_020450	A	7	7	221413	221419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_020450	ATCC	2	8	221428	221435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_020450	T	7	7	221439	221445	0 %	100 %	0 %	0 %	459284432
5065	NC_020450	AAG	2	6	221504	221509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284432
5066	NC_020450	TTGG	2	8	221709	221716	0 %	50 %	50 %	0 %	459284432
5067	NC_020450	AATG	2	8	221818	221825	50 %	25 %	25 %	0 %	459284432
5068	NC_020450	GCG	2	6	221919	221924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284432
5069	NC_020450	TGACA	2	10	221972	221981	40 %	20 %	20 %	20 %	459284432
5070	NC_020450	TTC	2	6	221990	221995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284432
5071	NC_020450	TGGCA	2	10	222013	222022	20 %	20 %	40 %	20 %	459284432
5072	NC_020450	TTG	2	6	222108	222113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284432
5073	NC_020450	CGT	2	6	222289	222294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284432
5074	NC_020450	ACC	2	6	222340	222345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284432
5075	NC_020450	TTG	2	6	222463	222468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284432
5076	NC_020450	TCT	2	6	222474	222479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284432
5077	NC_020450	TGT	2	6	222530	222535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284432
5078	NC_020450	TGA	2	6	222709	222714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284432
5079	NC_020450	CAA	2	6	222715	222720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284432
5080	NC_020450	CCA	2	6	222744	222749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284432
5081	NC_020450	TTCGT	2	10	222752	222761	0 %	60 %	20 %	20 %	459284432
5082	NC_020450	T	6	6	222791	222796	0 %	100 %	0 %	0 %	459284432
5083	NC_020450	CGA	2	6	222799	222804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284432
5084	NC_020450	TGT	2	6	222809	222814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284432
5085	NC_020450	TAC	2	6	222892	222897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_020450	AAAG	2	8	222984	222991	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_020450	GAA	2	6	223009	223014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_020450	ATT	2	6	223109	223114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284433
5089	NC_020450	TTG	2	6	223164	223169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284433
5090	NC_020450	GAAA	2	8	223208	223215	75 %	0 %	25 %	0 %	459284433
5091	NC_020450	AAG	2	6	223260	223265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284433
5092	NC_020450	TTTA	2	8	223270	223277	25 %	75 %	0 %	0 %	459284433
5093	NC_020450	CAAA	2	8	223291	223298	75 %	0 %	0 %	25 %	459284433
5094	NC_020450	T	6	6	223307	223312	0 %	100 %	0 %	0 %	459284433
5095	NC_020450	A	7	7	223332	223338	100 %	0 %	0 %	0 %	459284433
5096	NC_020450	GCT	2	6	223367	223372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284433
5097	NC_020450	ATCA	2	8	223398	223405	50 %	25 %	0 %	25 %	459284433
5098	NC_020450	ATT	2	6	223413	223418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284433
5099	NC_020450	AGG	2	6	223420	223425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284433
5100	NC_020450	ATTA	2	8	223573	223580	50 %	50 %	0 %	0 %	459284433
5101	NC_020450	TTG	2	6	223713	223718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284433
5102	NC_020450	A	6	6	223723	223728	100 %	0 %	0 %	0 %	459284433
5103	NC_020450	GTG	2	6	223802	223807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284434
5104	NC_020450	ATG	2	6	223825	223830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284434
5105	NC_020450	ATTT	2	8	223845	223852	25 %	75 %	0 %	0 %	459284434
5106	NC_020450	ATA	2	6	223919	223924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284434
5107	NC_020450	GAT	2	6	223957	223962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284434
5108	NC_020450	AAT	2	6	223996	224001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284434
5109	NC_020450	CAA	2	6	224006	224011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284434
5110	NC_020450	A	6	6	224052	224057	100 %	0 %	0 %	0 %	459284434
5111	NC_020450	GTTA	2	8	224065	224072	25 %	50 %	25 %	0 %	459284434
5112	NC_020450	TAAG	2	8	224189	224196	50 %	25 %	25 %	0 %	459284434
5113	NC_020450	CAA	2	6	224225	224230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284434
5114	NC_020450	TAG	2	6	224289	224294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284434
5115	NC_020450	TGA	2	6	224310	224315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284434
5116	NC_020450	TCT	2	6	224348	224353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284434
5117	NC_020450	GTT	2	6	224506	224511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284434
5118	NC_020450	ATA	2	6	224537	224542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284434
5119	NC_020450	TTGG	2	8	224552	224559	0 %	50 %	50 %	0 %	459284434
5120	NC_020450	CAT	2	6	224586	224591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284434
5121	NC_020450	GAT	2	6	224652	224657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284434
5122	NC_020450	TTC	2	6	224723	224728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284434
5123	NC_020450	TAT	2	6	224755	224760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284434
5124	NC_020450	GCTCT	2	10	224848	224857	0 %	40 %	20 %	40 %	459284434
5125	NC_020450	TCG	2	6	224889	224894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284434
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5128	NC_020450	AAAAGA	2	12	224961	224972	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_020450	T	6	6	224979	224984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5245	NC_020450	TTTAA	2	10	229488	229497	40 %	60 %	0 %	0 %	459284437
5246	NC_020450	A	6	6	229511	229516	100 %	0 %	0 %	0 %	459284437
5247	NC_020450	ATA	2	6	229521	229526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284437
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5250	NC_020450	T	7	7	229652	229658	0 %	100 %	0 %	0 %	459284437
5251	NC_020450	TTTTAT	2	12	229666	229677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	459284437
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5372	NC_020450	TGAT	2	8	235221	235228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_020450	T	7	7	235228	235234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_020450	TTA	2	6	235237	235242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5375	NC_020450	GAG	2	6	235352	235357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284442
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5500	NC_020450	TCA	2	6	240512	240517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284448

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