MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_020229	CTTTA	2	10	2233555	2233564	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44002	NC_020229	ATT	2	6	2233571	2233576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44003	NC_020229	CCA	2	6	2233594	2233599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44004	NC_020229	ATG	2	6	2233620	2233625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44005	NC_020229	CCA	2	6	2233627	2233632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44006	NC_020229	CAC	2	6	2233730	2233735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821718
44007	NC_020229	TCC	2	6	2233743	2233748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448821718
44008	NC_020229	TCG	2	6	2233752	2233757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821718
44009	NC_020229	TGC	2	6	2233766	2233771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821718
44010	NC_020229	CGT	2	6	2233794	2233799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821718
44011	NC_020229	ATA	2	6	2233856	2233861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821718
44012	NC_020229	CTT	2	6	2233975	2233980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821718
44013	NC_020229	CAT	2	6	2233984	2233989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821718
44014	NC_020229	AAT	2	6	2234093	2234098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821718
44015	NC_020229	TAAT	2	8	2234158	2234165	50 %	50 %	0 %	0 %	448821718
44016	NC_020229	TAA	2	6	2234170	2234175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821718
44017	NC_020229	GCC	2	6	2234220	2234225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821718
44018	NC_020229	AAT	2	6	2234246	2234251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821718
44019	NC_020229	TCC	2	6	2234256	2234261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448821718
44020	NC_020229	CAT	2	6	2234279	2234284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821718
44021	NC_020229	CGA	2	6	2234302	2234307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821718
44022	NC_020229	CCA	2	6	2234308	2234313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821718
44023	NC_020229	TTG	2	6	2234357	2234362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821718
44024	NC_020229	AT	3	6	2234367	2234372	50 %	50 %	0 %	0 %	448821718
44025	NC_020229	GCT	2	6	2234395	2234400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821718
44026	NC_020229	GCC	2	6	2234463	2234468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821718
44027	NC_020229	TTC	2	6	2234469	2234474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821718
44028	NC_020229	ACTTG	2	10	2234562	2234571	20 %	40 %	20 %	20 %	448821718
44029	NC_020229	TCA	2	6	2234581	2234586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821718
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44031	NC_020229	CAAT	2	8	2234806	2234813	50 %	25 %	0 %	25 %	448821718
44032	NC_020229	TTCGA	2	10	2234834	2234843	20 %	40 %	20 %	20 %	448821718
44033	NC_020229	GTC	2	6	2234873	2234878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821718
44034	NC_020229	GAC	2	6	2234888	2234893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821718
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44036	NC_020229	GTT	2	6	2235000	2235005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821718
44037	NC_020229	CAT	2	6	2235103	2235108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821718
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44039	NC_020229	GCT	2	6	2235243	2235248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821718
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44041	NC_020229	GCT	2	6	2235288	2235293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821718
44042	NC_020229	GCT	2	6	2235316	2235321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821718
44043	NC_020229	GC	3	6	2235345	2235350	0 %	0 %	50 %	50 %	448821718
44044	NC_020229	TTG	2	6	2235353	2235358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821718
44045	NC_020229	CAG	2	6	2235577	2235582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821718
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44047	NC_020229	C	6	6	2235618	2235623	0 %	0 %	0 %	100 %	448821718
44048	NC_020229	GAA	2	6	2235725	2235730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821718
44049	NC_020229	ACC	2	6	2235740	2235745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821718
44050	NC_020229	CAC	2	6	2235750	2235755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821718
44051	NC_020229	AGTC	2	8	2235761	2235768	25 %	25 %	25 %	25 %	448821718
44052	NC_020229	ATC	2	6	2235786	2235791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821718
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44054	NC_020229	CTT	3	9	2235977	2235985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821718
44055	NC_020229	T	6	6	2236005	2236010	0 %	100 %	0 %	0 %	448821718
44056	NC_020229	GTT	2	6	2236011	2236016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821718
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44068	NC_020229	TTCA	2	8	2236696	2236703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44069	NC_020229	A	6	6	2236758	2236763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44070	NC_020229	TCA	2	6	2236875	2236880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44071	NC_020229	GCA	2	6	2236909	2236914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44072	NC_020229	GAG	2	6	2236935	2236940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44073	NC_020229	ATT	2	6	2236962	2236967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821720
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44089	NC_020229	TC	3	6	2237784	2237789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44090	NC_020229	GTTG	2	8	2237828	2237835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44091	NC_020229	TAAT	2	8	2237870	2237877	50 %	50 %	0 %	0 %	448821721
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44108	NC_020229	GCTT	2	8	2238811	2238818	0 %	50 %	25 %	25 %	448821722
44109	NC_020229	GCATG	2	10	2238861	2238870	20 %	20 %	40 %	20 %	448821722
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44112	NC_020229	ATT	2	6	2239409	2239414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44113	NC_020229	A	7	7	2239478	2239484	100 %	0 %	0 %	0 %	448821723
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44117	NC_020229	TAA	2	6	2239743	2239748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821724
44118	NC_020229	ATACTG	2	12	2239851	2239862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	448821724
44119	NC_020229	CA	3	6	2240046	2240051	50 %	0 %	0 %	50 %	448821724
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44126	NC_020229	T	7	7	2240340	2240346	0 %	100 %	0 %	0 %	448821724
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44129	NC_020229	T	7	7	2240474	2240480	0 %	100 %	0 %	0 %	448821724
44130	NC_020229	ACA	2	6	2240575	2240580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44131	NC_020229	TAG	2	6	2240629	2240634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44132	NC_020229	TTA	2	6	2240659	2240664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44133	NC_020229	GAAA	2	8	2240773	2240780	75 %	0 %	25 %	0 %	448821725
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44138	NC_020229	TTAAA	2	10	2241070	2241079	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44175	NC_020229	TATC	2	8	2242817	2242824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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44202	NC_020229	A	6	6	2244576	2244581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44203	NC_020229	TCA	3	9	2244709	2244717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44227	NC_020229	CTG	2	6	2245829	2245834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821731
44228	NC_020229	GTT	2	6	2245904	2245909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821731
44229	NC_020229	ATGA	2	8	2245952	2245959	50 %	25 %	25 %	0 %	448821731
44230	NC_020229	CAC	2	6	2245963	2245968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821731
44231	NC_020229	TTA	2	6	2245977	2245982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821731
44232	NC_020229	TGGAG	2	10	2246000	2246009	20 %	20 %	60 %	0 %	448821731
44233	NC_020229	CTT	2	6	2246087	2246092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821731
44234	NC_020229	AAT	2	6	2246116	2246121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821731
44235	NC_020229	CAA	2	6	2246275	2246280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821731
44236	NC_020229	GTG	2	6	2246309	2246314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821731
44237	NC_020229	CGC	2	6	2246318	2246323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821731
44238	NC_020229	CCT	2	6	2246340	2246345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448821731
44239	NC_020229	TCA	3	9	2246370	2246378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821731
44240	NC_020229	CAGC	2	8	2246392	2246399	25 %	0 %	25 %	50 %	448821731
44241	NC_020229	TCTTGG	2	12	2246428	2246439	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	448821731
44242	NC_020229	CTT	2	6	2246544	2246549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821732
44243	NC_020229	GGC	2	6	2246593	2246598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821732
44244	NC_020229	TTTTC	2	10	2246727	2246736	0 %	80 %	0 %	20 %	448821732
44245	NC_020229	ACC	2	6	2246737	2246742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821732
44246	NC_020229	TTC	2	6	2246821	2246826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821732
44247	NC_020229	TCCG	2	8	2246840	2246847	0 %	25 %	25 %	50 %	448821732
44248	NC_020229	GATA	2	8	2246871	2246878	50 %	25 %	25 %	0 %	448821732
44249	NC_020229	TCT	2	6	2246942	2246947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821732
44250	NC_020229	TCA	2	6	2247080	2247085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821732
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44252	NC_020229	TCG	2	6	2247175	2247180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44253	NC_020229	T	7	7	2247223	2247229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44254	NC_020229	A	6	6	2247331	2247336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44255	NC_020229	ATGAA	2	10	2247340	2247349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44256	NC_020229	GGA	2	6	2247408	2247413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44257	NC_020229	TATT	2	8	2247434	2247441	25 %	75 %	0 %	0 %	448821733
44258	NC_020229	TGA	2	6	2247472	2247477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821733
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44260	NC_020229	A	6	6	2247674	2247679	100 %	0 %	0 %	0 %	448821733
44261	NC_020229	AACT	2	8	2247766	2247773	50 %	25 %	0 %	25 %	448821733
44262	NC_020229	TCG	2	6	2247881	2247886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821733
44263	NC_020229	CGT	2	6	2247889	2247894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821733
44264	NC_020229	ATT	2	6	2248072	2248077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44265	NC_020229	CGA	2	6	2248105	2248110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44266	NC_020229	TGCT	2	8	2248253	2248260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44267	NC_020229	TTC	2	6	2248311	2248316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821734
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44269	NC_020229	ATA	2	6	2248512	2248517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821734
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44271	NC_020229	TCG	2	6	2248549	2248554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821734
44272	NC_020229	GAC	2	6	2248572	2248577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821734
44273	NC_020229	TAG	2	6	2248588	2248593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821734
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44280	NC_020229	CCA	2	6	2249018	2249023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821734
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44283	NC_020229	CATA	2	8	2249168	2249175	50 %	25 %	0 %	25 %	448821734
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44292	NC_020229	CTT	2	6	2249606	2249611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821734
44293	NC_020229	CAGA	2	8	2249618	2249625	50 %	0 %	25 %	25 %	448821734
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44300	NC_020229	TAC	2	6	2250075	2250080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821734
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44302	NC_020229	ATT	2	6	2250097	2250102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44303	NC_020229	TGC	2	6	2250228	2250233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821735
44304	NC_020229	GTT	2	6	2250265	2250270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821735
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44339	NC_020229	ATC	2	6	2252106	2252111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821736
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44342	NC_020229	TTG	2	6	2252313	2252318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821737
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44348	NC_020229	TTC	2	6	2252532	2252537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821737
44349	NC_020229	TCAG	2	8	2252548	2252555	25 %	25 %	25 %	25 %	448821737
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44477	NC_020229	TTC	2	6	2260355	2260360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44478	NC_020229	GCA	2	6	2260474	2260479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44479	NC_020229	CAGAC	2	10	2260588	2260597	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44480	NC_020229	GCC	2	6	2260599	2260604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44481	NC_020229	TTC	2	6	2260618	2260623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44482	NC_020229	AT	3	6	2260625	2260630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44483	NC_020229	CTT	2	6	2260703	2260708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44484	NC_020229	A	6	6	2260740	2260745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44485	NC_020229	GCT	2	6	2260809	2260814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44486	NC_020229	TTC	2	6	2260882	2260887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44487	NC_020229	AAC	2	6	2260891	2260896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44488	NC_020229	CTT	2	6	2260918	2260923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44489	NC_020229	CTG	2	6	2260977	2260982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44490	NC_020229	CGC	2	6	2261093	2261098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44491	NC_020229	GTT	2	6	2261157	2261162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44492	NC_020229	CACT	2	8	2261240	2261247	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44493	NC_020229	ATG	2	6	2261260	2261265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44494	NC_020229	CAAT	2	8	2261273	2261280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44495	NC_020229	GTTC	2	8	2261287	2261294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44496	NC_020229	CGC	2	6	2261314	2261319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44497	NC_020229	ATG	2	6	2261358	2261363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44498	NC_020229	TGT	2	6	2261385	2261390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44499	NC_020229	ATTT	2	8	2261397	2261404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44500	NC_020229	TCG	2	6	2261471	2261476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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