MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020229	A	7	7	50118	50124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020229	AAT	2	6	50207	50212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819575
1003	NC_020229	ACC	2	6	50229	50234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819575
1004	NC_020229	ATT	2	6	50253	50258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819575
1005	NC_020229	TTG	2	6	50271	50276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819575
1006	NC_020229	CCG	2	6	50399	50404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819575
1007	NC_020229	TTG	2	6	50418	50423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819575
1008	NC_020229	CAC	2	6	50456	50461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819575
1009	NC_020229	AAC	2	6	50466	50471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819575
1010	NC_020229	CGTT	2	8	50477	50484	0 %	50 %	25 %	25 %	448819575
1011	NC_020229	GCCA	2	8	50534	50541	25 %	0 %	25 %	50 %	448819575
1012	NC_020229	GTC	2	6	50608	50613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819575
1013	NC_020229	ATC	2	6	50628	50633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819575
1014	NC_020229	AAAGT	2	10	50672	50681	60 %	20 %	20 %	0 %	448819575
1015	NC_020229	GTT	2	6	50760	50765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819575
1016	NC_020229	ACC	2	6	50772	50777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819575
1017	NC_020229	GCC	2	6	50778	50783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819575
1018	NC_020229	ACC	2	6	50823	50828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819575
1019	NC_020229	ATT	2	6	50898	50903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819575
1020	NC_020229	TCT	2	6	51009	51014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_020229	TCA	2	6	51015	51020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_020229	TAA	2	6	51088	51093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020229	GAA	2	6	51115	51120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020229	TAT	2	6	51207	51212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020229	GGA	2	6	51260	51265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020229	ATTTTG	2	12	51320	51331	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	448819576
1027	NC_020229	T	6	6	51357	51362	0 %	100 %	0 %	0 %	448819576
1028	NC_020229	AAG	2	6	51458	51463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819576
1029	NC_020229	ATT	2	6	51509	51514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819576
1030	NC_020229	CAA	3	9	51566	51574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819576
1031	NC_020229	ATG	2	6	51584	51589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819576
1032	NC_020229	CAA	2	6	51618	51623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819576
1033	NC_020229	CT	3	6	51673	51678	0 %	50 %	0 %	50 %	448819576
1034	NC_020229	TAT	2	6	51700	51705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819576
1035	NC_020229	TGA	2	6	51720	51725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819576
1036	NC_020229	AGA	2	6	51750	51755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819576
1037	NC_020229	AGCAA	2	10	51849	51858	60 %	0 %	20 %	20 %	448819576
1038	NC_020229	TTA	2	6	51859	51864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819576
1039	NC_020229	AGAA	2	8	51897	51904	75 %	0 %	25 %	0 %	448819576
1040	NC_020229	T	6	6	51992	51997	0 %	100 %	0 %	0 %	448819576
1041	NC_020229	AGA	2	6	52002	52007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819576
1042	NC_020229	T	7	7	52041	52047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020229	CAAG	2	8	52109	52116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_020229	TTAT	2	8	52200	52207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020229	CAAT	2	8	52218	52225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_020229	ACT	2	6	52229	52234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_020229	AAT	2	6	52266	52271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020229	TAA	2	6	52275	52280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020229	AAC	2	6	52323	52328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_020229	AAC	2	6	52419	52424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_020229	GTT	2	6	52453	52458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020229	TGCT	2	8	52545	52552	0 %	50 %	25 %	25 %	448819577
1053	NC_020229	ACG	2	6	52721	52726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819577
1054	NC_020229	CTT	2	6	52741	52746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819577
1055	NC_020229	TAA	2	6	52766	52771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819577
1056	NC_020229	A	6	6	52973	52978	100 %	0 %	0 %	0 %	448819577
1057	NC_020229	TTCA	2	8	52988	52995	25 %	50 %	0 %	25 %	448819577
1058	NC_020229	T	6	6	53061	53066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020229	CGT	2	6	53081	53086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_020229	TCAAG	2	10	53177	53186	40 %	20 %	20 %	20 %	448819578
1061	NC_020229	TGA	2	6	53210	53215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819578
1062	NC_020229	ATA	3	9	53223	53231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819578
1063	NC_020229	TAT	2	6	53237	53242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819578
1064	NC_020229	AAAT	2	8	53257	53264	75 %	25 %	0 %	0 %	448819578
1065	NC_020229	TAA	2	6	53292	53297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819578
1066	NC_020229	A	7	7	53365	53371	100 %	0 %	0 %	0 %	448819578
1067	NC_020229	ACC	2	6	53379	53384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819578
1068	NC_020229	AGC	2	6	53418	53423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819578
1069	NC_020229	GTC	2	6	53479	53484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819578
1070	NC_020229	TAA	2	6	53658	53663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819578
1071	NC_020229	TTC	2	6	53671	53676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819578
1072	NC_020229	GGCAAT	2	12	53715	53726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	448819578
1073	NC_020229	CTT	2	6	53812	53817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819578
1074	NC_020229	TAA	2	6	53867	53872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020229	TAATT	2	10	53904	53913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020229	TTAA	2	8	53920	53927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020229	AGTT	2	8	53993	54000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020229	AAC	2	6	54001	54006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_020229	AGC	2	6	54043	54048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_020229	TCA	2	6	54052	54057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_020229	A	6	6	54061	54066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020229	GTC	2	6	54170	54175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819579
1083	NC_020229	CAC	2	6	54238	54243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819579
1084	NC_020229	TGA	2	6	54246	54251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819579
1085	NC_020229	CGC	3	9	54255	54263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819579
1086	NC_020229	ACC	2	6	54266	54271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819579
1087	NC_020229	CCA	2	6	54275	54280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819579
1088	NC_020229	TTA	2	6	54296	54301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819579
1089	NC_020229	GTT	2	6	54379	54384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819579
1090	NC_020229	GC	3	6	54400	54405	0 %	0 %	50 %	50 %	448819579
1091	NC_020229	TCA	2	6	54491	54496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819579
1092	NC_020229	GACG	2	8	54498	54505	25 %	0 %	50 %	25 %	448819579
1093	NC_020229	AAT	2	6	54571	54576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819579
1094	NC_020229	CAC	2	6	54609	54614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819579
1095	NC_020229	ATTTAC	2	12	54664	54675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	448819579
1096	NC_020229	ATA	2	6	54737	54742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819579
1097	NC_020229	GAA	2	6	54780	54785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819579
1098	NC_020229	CAAG	2	8	54873	54880	50 %	0 %	25 %	25 %	448819579
1099	NC_020229	ACG	3	9	54974	54982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819579
1100	NC_020229	TCA	2	6	54989	54994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819579
1101	NC_020229	CTT	2	6	55028	55033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819579
1102	NC_020229	TCT	2	6	55238	55243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819579
1103	NC_020229	GAT	2	6	55255	55260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819579
1104	NC_020229	ACC	2	6	55266	55271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819579
1105	NC_020229	GAT	2	6	55285	55290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819579
1106	NC_020229	AGC	2	6	55299	55304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819579
1107	NC_020229	ATT	2	6	55351	55356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819579
1108	NC_020229	AGA	2	6	55425	55430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819579
1109	NC_020229	GAA	2	6	55456	55461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819579
1110	NC_020229	CTT	2	6	55494	55499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819579
1111	NC_020229	AAG	2	6	55507	55512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819579
1112	NC_020229	CAACA	2	10	55705	55714	60 %	0 %	0 %	40 %	448819579
1113	NC_020229	AAC	2	6	55775	55780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819579
1114	NC_020229	TAA	2	6	55833	55838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020229	GAG	2	6	55889	55894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020229	TCA	2	6	55930	55935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819580
1117	NC_020229	GAA	2	6	56043	56048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819580
1118	NC_020229	GAA	2	6	56060	56065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819580
1119	NC_020229	CAAAGC	2	12	56078	56089	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	448819580
1120	NC_020229	GTC	2	6	56147	56152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_020229	T	7	7	56164	56170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020229	TACC	2	8	56173	56180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_020229	GAA	2	6	56296	56301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819581
1124	NC_020229	AAC	2	6	56333	56338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819581
1125	NC_020229	CATT	2	8	56368	56375	25 %	50 %	0 %	25 %	448819581
1126	NC_020229	TGA	2	6	56406	56411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819581
1127	NC_020229	ATT	2	6	56412	56417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819581
1128	NC_020229	TGA	2	6	56489	56494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819581
1129	NC_020229	GT	3	6	56562	56567	0 %	50 %	50 %	0 %	448819581
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