MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020229	TTA	2	6	25360	25365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819551
502	NC_020229	CTT	2	6	25379	25384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819551
503	NC_020229	TCA	2	6	25401	25406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819551
504	NC_020229	GCT	2	6	25408	25413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819551
505	NC_020229	TTGC	2	8	25480	25487	0 %	50 %	25 %	25 %	448819551
506	NC_020229	A	7	7	25501	25507	100 %	0 %	0 %	0 %	448819551
507	NC_020229	ACTA	2	8	25510	25517	50 %	25 %	0 %	25 %	448819551
508	NC_020229	AGC	2	6	25553	25558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_020229	T	7	7	25563	25569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020229	CGAT	2	8	25576	25583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_020229	AGT	2	6	25593	25598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020229	TCA	2	6	25612	25617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020229	ACT	2	6	25632	25637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020229	ATAA	2	8	25684	25691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020229	ATA	2	6	25728	25733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020229	GAG	2	6	25735	25740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020229	ATT	2	6	25775	25780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819552
518	NC_020229	CAT	2	6	25789	25794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819552
519	NC_020229	TG	3	6	25806	25811	0 %	50 %	50 %	0 %	448819552
520	NC_020229	TAC	2	6	25826	25831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819552
521	NC_020229	CAC	2	6	25835	25840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819552
522	NC_020229	CTGG	2	8	25895	25902	0 %	25 %	50 %	25 %	448819552
523	NC_020229	T	6	6	25904	25909	0 %	100 %	0 %	0 %	448819552
524	NC_020229	GTC	2	6	25916	25921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819552
525	NC_020229	TAAAC	2	10	25934	25943	60 %	20 %	0 %	20 %	448819552
526	NC_020229	GAG	2	6	25973	25978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020229	AGA	2	6	25996	26001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819553
528	NC_020229	CAA	2	6	26020	26025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819553
529	NC_020229	CAG	2	6	26105	26110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819553
530	NC_020229	CAAT	2	8	26157	26164	50 %	25 %	0 %	25 %	448819553
531	NC_020229	CGG	2	6	26207	26212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819553
532	NC_020229	CTTAG	2	10	26231	26240	20 %	40 %	20 %	20 %	448819553
533	NC_020229	AAGC	2	8	26251	26258	50 %	0 %	25 %	25 %	448819553
534	NC_020229	ATC	2	6	26262	26267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819553
535	NC_020229	TAT	2	6	26346	26351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020229	ATT	2	6	26375	26380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819554
537	NC_020229	CGC	2	6	26391	26396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819554
538	NC_020229	AT	3	6	26495	26500	50 %	50 %	0 %	0 %	448819554
539	NC_020229	TCT	2	6	26531	26536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819554
540	NC_020229	CCG	2	6	26569	26574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819554
541	NC_020229	AAGT	2	8	26600	26607	50 %	25 %	25 %	0 %	448819554
542	NC_020229	CAT	2	6	26625	26630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819554
543	NC_020229	CTT	2	6	26658	26663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819554
544	NC_020229	T	6	6	26662	26667	0 %	100 %	0 %	0 %	448819554
545	NC_020229	ATT	2	6	26701	26706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819554
546	NC_020229	CAT	2	6	26737	26742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819554
547	NC_020229	AAG	2	6	26915	26920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819555
548	NC_020229	ATA	2	6	26943	26948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819555
549	NC_020229	ATG	2	6	26968	26973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819555
550	NC_020229	GCC	2	6	27030	27035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819555
551	NC_020229	ATC	2	6	27062	27067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819555
552	NC_020229	A	6	6	27116	27121	100 %	0 %	0 %	0 %	448819555
553	NC_020229	GCC	2	6	27230	27235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819555
554	NC_020229	AGT	2	6	27281	27286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819555
555	NC_020229	TTA	2	6	27335	27340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819555
556	NC_020229	TCG	2	6	27375	27380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819555
557	NC_020229	CGC	2	6	27511	27516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819555
558	NC_020229	ATCC	2	8	27523	27530	25 %	25 %	0 %	50 %	448819555
559	NC_020229	CCG	2	6	27537	27542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819555
560	NC_020229	ACG	2	6	27605	27610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819555
561	NC_020229	AAT	2	6	27643	27648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819555
562	NC_020229	ATC	2	6	27662	27667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819555
563	NC_020229	ACCG	2	8	27671	27678	25 %	0 %	25 %	50 %	448819555
564	NC_020229	GACC	2	8	27681	27688	25 %	0 %	25 %	50 %	448819555
565	NC_020229	AC	3	6	27708	27713	50 %	0 %	0 %	50 %	448819555
566	NC_020229	AAT	2	6	27721	27726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819555
567	NC_020229	GCCA	2	8	27771	27778	25 %	0 %	25 %	50 %	448819555
568	NC_020229	TAA	2	6	27790	27795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819555
569	NC_020229	TGC	2	6	27811	27816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819555
570	NC_020229	TCG	2	6	27918	27923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819555
571	NC_020229	ACC	2	6	28036	28041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819555
572	NC_020229	ATT	2	6	28057	28062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819555
573	NC_020229	CCA	2	6	28125	28130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819555
574	NC_020229	TGC	2	6	28154	28159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819555
575	NC_020229	T	7	7	28197	28203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020229	AGTT	2	8	28233	28240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020229	TAA	2	6	28277	28282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020229	TTAA	2	8	28284	28291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020229	T	7	7	28482	28488	0 %	100 %	0 %	0 %	448819556
580	NC_020229	GTC	2	6	28489	28494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819556
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583	NC_020229	TTC	2	6	28560	28565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819556
584	NC_020229	TG	3	6	28649	28654	0 %	50 %	50 %	0 %	448819556
585	NC_020229	AGT	2	6	28708	28713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819556
586	NC_020229	AAC	2	6	28734	28739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819556
587	NC_020229	GAT	2	6	28977	28982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819556
588	NC_020229	AAT	2	6	28996	29001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819556
589	NC_020229	ATT	2	6	29014	29019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819556
590	NC_020229	CGT	2	6	29064	29069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819556
591	NC_020229	TAT	2	6	29108	29113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819556
592	NC_020229	G	6	6	29147	29152	0 %	0 %	100 %	0 %	448819556
593	NC_020229	GT	3	6	29222	29227	0 %	50 %	50 %	0 %	448819556
594	NC_020229	ATT	2	6	29295	29300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819556
595	NC_020229	AATC	2	8	29347	29354	50 %	25 %	0 %	25 %	448819556
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597	NC_020229	GCA	2	6	29369	29374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819556
598	NC_020229	TGG	2	6	29391	29396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819556
599	NC_020229	ATA	2	6	29632	29637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020229	GCT	2	6	29658	29663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_020229	TATTC	2	10	29681	29690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
602	NC_020229	TTG	2	6	29736	29741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819557
603	NC_020229	CGT	2	6	29817	29822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819557
604	NC_020229	AGA	2	6	29885	29890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819557
605	NC_020229	TTC	2	6	29902	29907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819557
606	NC_020229	CAG	2	6	29982	29987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819557
607	NC_020229	TCA	2	6	30034	30039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819557
608	NC_020229	AAT	2	6	30066	30071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819557
609	NC_020229	TCA	3	9	30104	30112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819557
610	NC_020229	CAC	2	6	30122	30127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819557
611	NC_020229	CCAA	2	8	30219	30226	50 %	0 %	0 %	50 %	448819557
612	NC_020229	ATC	2	6	30264	30269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819557
613	NC_020229	AAT	2	6	30357	30362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819557
614	NC_020229	TGG	2	6	30368	30373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819557
615	NC_020229	AACT	2	8	30402	30409	50 %	25 %	0 %	25 %	448819557
616	NC_020229	TTG	2	6	30448	30453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819557
617	NC_020229	ACTT	2	8	30485	30492	25 %	50 %	0 %	25 %	448819557
618	NC_020229	GGGT	2	8	30527	30534	0 %	25 %	75 %	0 %	448819557
619	NC_020229	ATAA	2	8	30551	30558	75 %	25 %	0 %	0 %	448819557
620	NC_020229	CCGC	2	8	30565	30572	0 %	0 %	25 %	75 %	448819557
621	NC_020229	T	6	6	30621	30626	0 %	100 %	0 %	0 %	448819557
622	NC_020229	TTCTCT	2	12	30640	30651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020229	AGC	2	6	30709	30714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_020229	TAA	2	6	30796	30801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819558
625	NC_020229	GCC	2	6	30806	30811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819558
626	NC_020229	GCT	2	6	30821	30826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819558
627	NC_020229	AATTG	2	10	30827	30836	40 %	40 %	20 %	0 %	448819558
628	NC_020229	GAC	2	6	30865	30870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819558
629	NC_020229	A	6	6	31061	31066	100 %	0 %	0 %	0 %	448819558
630	NC_020229	TGT	2	6	31067	31072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819558
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634	NC_020229	ATC	2	6	31229	31234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819558
635	NC_020229	TCC	2	6	31238	31243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_020229	ATTTA	2	10	31254	31263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020229	CAA	2	6	31284	31289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_020229	ATC	2	6	31296	31301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_020229	TA	3	6	31328	31333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020229	ATT	3	9	31346	31354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020229	ATT	2	6	31365	31370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_020229	TGA	2	6	31727	31732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
647	NC_020229	ACTTA	2	10	31739	31748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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652	NC_020229	ACCA	2	8	32138	32145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
653	NC_020229	TAA	2	6	32227	32232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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664	NC_020229	A	6	6	32817	32822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_020229	TCC	2	6	36939	36944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448819562
760	NC_020229	GTC	2	6	37064	37069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819562
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766	NC_020229	CCT	2	6	37439	37444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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781	NC_020229	CAA	2	6	38497	38502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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785	NC_020229	TAA	2	6	38670	38675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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