MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020229	TAAA	2	8	246874	246881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_020229	GAT	2	6	246963	246968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_020229	ATATT	2	10	246995	247004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_020229	GCT	2	6	247006	247011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_020229	CTA	2	6	247044	247049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_020229	TGA	2	6	247063	247068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_020229	CGCT	2	8	247099	247106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_020229	AATG	2	8	247114	247121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_020229	A	6	6	247147	247152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_020229	TTA	2	6	247162	247167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_020229	TCA	2	6	247280	247285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_020229	A	6	6	247285	247290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_020229	TATAA	2	10	247295	247304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_020229	GT	4	8	247315	247322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_020229	AT	3	6	247404	247409	50 %	50 %	0 %	0 %	448819753
5016	NC_020229	CAT	2	6	247440	247445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819753
5017	NC_020229	GGT	2	6	247453	247458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819753
5018	NC_020229	AAC	2	6	247482	247487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819753
5019	NC_020229	GTTA	2	8	247491	247498	25 %	50 %	25 %	0 %	448819753
5020	NC_020229	GAT	2	6	247510	247515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819753
5021	NC_020229	CGG	2	6	247516	247521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819753
5022	NC_020229	TTGAAG	2	12	247550	247561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819753
5023	NC_020229	T	6	6	247573	247578	0 %	100 %	0 %	0 %	448819753
5024	NC_020229	CACCG	2	10	247762	247771	20 %	0 %	20 %	60 %	448819754
5025	NC_020229	AATT	2	8	247784	247791	50 %	50 %	0 %	0 %	448819754
5026	NC_020229	ACC	2	6	247801	247806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819754
5027	NC_020229	GCG	2	6	247872	247877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819754
5028	NC_020229	AGCG	2	8	247883	247890	25 %	0 %	50 %	25 %	448819754
5029	NC_020229	ATC	2	6	247898	247903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819754
5030	NC_020229	TATGGA	2	12	248010	248021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819754
5031	NC_020229	AAC	2	6	248081	248086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819754
5032	NC_020229	GCA	2	6	248115	248120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819754
5033	NC_020229	ATC	2	6	248182	248187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819754
5034	NC_020229	GCA	2	6	248208	248213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819754
5035	NC_020229	GTCG	2	8	248313	248320	0 %	25 %	50 %	25 %	448819754
5036	NC_020229	CAA	3	9	248356	248364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819754
5037	NC_020229	TTA	2	6	248392	248397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819754
5038	NC_020229	GAT	2	6	248410	248415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819754
5039	NC_020229	CAA	2	6	248467	248472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819754
5040	NC_020229	TGA	2	6	248513	248518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819754
5041	NC_020229	TTA	3	9	248545	248553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819754
5042	NC_020229	CTG	2	6	248596	248601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819754
5043	NC_020229	ATTA	2	8	248667	248674	50 %	50 %	0 %	0 %	448819754
5044	NC_020229	GAG	2	6	248716	248721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448819754
5045	NC_020229	CGAAAA	2	12	248735	248746	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	448819755
5046	NC_020229	ATG	2	6	248776	248781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819755
5047	NC_020229	ACG	2	6	248847	248852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819755
5048	NC_020229	CCA	2	6	248867	248872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819755
5049	NC_020229	TTG	2	6	248887	248892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819755
5050	NC_020229	TGA	2	6	248903	248908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819755
5051	NC_020229	ATA	2	6	248956	248961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819755
5052	NC_020229	A	6	6	249010	249015	100 %	0 %	0 %	0 %	448819755
5053	NC_020229	GGT	2	6	249060	249065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819755
5054	NC_020229	GGT	2	6	249072	249077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819755
5055	NC_020229	TGG	2	6	249095	249100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819755
5056	NC_020229	GTT	2	6	249123	249128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819755
5057	NC_020229	ATC	2	6	249137	249142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819755
5058	NC_020229	TTA	2	6	249179	249184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819755
5059	NC_020229	TGA	2	6	249242	249247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819755
5060	NC_020229	CGG	2	6	249259	249264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819755
5061	NC_020229	ACC	2	6	249303	249308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819755
5062	NC_020229	GAC	2	6	249326	249331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819755
5063	NC_020229	TGA	2	6	249395	249400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819755
5064	NC_020229	ATAAGA	2	12	249460	249471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	448819755
5065	NC_020229	GTTGC	2	10	249531	249540	0 %	40 %	40 %	20 %	448819755
5066	NC_020229	GAC	2	6	249549	249554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819755
5067	NC_020229	TGA	2	6	249568	249573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819755
5068	NC_020229	CAA	2	6	249581	249586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819755
5069	NC_020229	TACG	2	8	249593	249600	25 %	25 %	25 %	25 %	448819755
5070	NC_020229	GAA	2	6	249615	249620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819755
5071	NC_020229	TCA	2	6	249646	249651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819755
5072	NC_020229	TTG	2	6	249675	249680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819755
5073	NC_020229	TGT	2	6	249734	249739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819755
5074	NC_020229	GCA	2	6	249810	249815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819755
5075	NC_020229	GCT	2	6	249921	249926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819755
5076	NC_020229	A	6	6	249950	249955	100 %	0 %	0 %	0 %	448819755
5077	NC_020229	ACA	2	6	249997	250002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819755
5078	NC_020229	GTA	2	6	250003	250008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819755
5079	NC_020229	GTT	2	6	250028	250033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819755
5080	NC_020229	GAA	2	6	250164	250169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819755
5081	NC_020229	GGT	2	6	250206	250211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819755
5082	NC_020229	ATTA	2	8	250244	250251	50 %	50 %	0 %	0 %	448819755
5083	NC_020229	GTT	2	6	250304	250309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819755
5084	NC_020229	ACC	2	6	250361	250366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819755
5085	NC_020229	GAA	2	6	250416	250421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819755
5086	NC_020229	TGAG	2	8	250423	250430	25 %	25 %	50 %	0 %	448819755
5087	NC_020229	GTT	2	6	250464	250469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819755
5088	NC_020229	GCG	2	6	250538	250543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819755
5089	NC_020229	TGA	2	6	250559	250564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819755
5090	NC_020229	TCT	2	6	250588	250593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819755
5091	NC_020229	GT	3	6	250676	250681	0 %	50 %	50 %	0 %	448819755
5092	NC_020229	ACG	2	6	250748	250753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_020229	AGG	2	6	250826	250831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_020229	ACGT	2	8	250956	250963	25 %	25 %	25 %	25 %	448819756
5095	NC_020229	CGG	2	6	250985	250990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819756
5096	NC_020229	AAG	2	6	251039	251044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819756
5097	NC_020229	TTG	2	6	251055	251060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819756
5098	NC_020229	ATC	2	6	251079	251084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819756
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5100	NC_020229	CAG	2	6	251316	251321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819756
5101	NC_020229	ACA	2	6	251384	251389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819756
5102	NC_020229	ATT	2	6	251567	251572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819756
5103	NC_020229	AT	3	6	251641	251646	50 %	50 %	0 %	0 %	448819756
5104	NC_020229	ATG	2	6	251724	251729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819756
5105	NC_020229	CGG	2	6	251768	251773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819756
5106	NC_020229	GAA	2	6	251956	251961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819756
5107	NC_020229	TGA	2	6	252016	252021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819756
5108	NC_020229	ATT	2	6	252032	252037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819756
5109	NC_020229	GAA	2	6	252064	252069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819756
5110	NC_020229	ATT	2	6	252245	252250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819756
5111	NC_020229	GAA	2	6	252254	252259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819756
5112	NC_020229	TGAAGA	2	12	252331	252342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	448819756
5113	NC_020229	GAA	4	12	252350	252361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819756
5114	NC_020229	GTG	2	6	252432	252437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819756
5115	NC_020229	ATG	3	9	252465	252473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819756
5116	NC_020229	GAC	2	6	252493	252498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819756
5117	NC_020229	ATG	2	6	252507	252512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819756
5118	NC_020229	TCA	2	6	252603	252608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819756
5119	NC_020229	A	6	6	252633	252638	100 %	0 %	0 %	0 %	448819756
5120	NC_020229	GAT	3	9	252785	252793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819756
5121	NC_020229	ATC	2	6	252836	252841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819756
5122	NC_020229	ACG	2	6	252849	252854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819756
5123	NC_020229	CGA	2	6	252871	252876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819756
5124	NC_020229	GAT	2	6	252935	252940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819756
5125	NC_020229	TCA	3	9	252987	252995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819756
5126	NC_020229	AAAC	2	8	253013	253020	75 %	0 %	0 %	25 %	448819756
5127	NC_020229	GTG	2	6	253050	253055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819756
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5129	NC_020229	GAC	2	6	253111	253116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819756
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5131	NC_020229	GAT	2	6	253238	253243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819756
5132	NC_020229	TGA	2	6	253288	253293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819756
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5135	NC_020229	ATT	2	6	253466	253471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819757
5136	NC_020229	GT	3	6	253485	253490	0 %	50 %	50 %	0 %	448819757
5137	NC_020229	GAA	2	6	253562	253567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_020229	CTG	2	6	253576	253581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5139	NC_020229	TCA	2	6	253587	253592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5141	NC_020229	CAG	2	6	253712	253717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_020229	TG	3	6	253757	253762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_020229	GGA	2	6	253787	253792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_020229	A	6	6	253799	253804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_020229	ATTG	2	8	253851	253858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_020229	CAA	2	6	253909	253914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5147	NC_020229	AAG	2	6	253987	253992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_020229	AGG	2	6	254008	254013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_020229	TTAC	2	8	254049	254056	25 %	50 %	0 %	25 %	448819758
5150	NC_020229	CGA	2	6	254074	254079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819758
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5152	NC_020229	CGT	2	6	254168	254173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819758
5153	NC_020229	TTAAC	2	10	254220	254229	40 %	40 %	0 %	20 %	448819758
5154	NC_020229	TGC	2	6	254242	254247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819758
5155	NC_020229	ATG	2	6	254280	254285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819758
5156	NC_020229	AG	3	6	254342	254347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_020229	TGG	2	6	254422	254427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819759
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5163	NC_020229	TCA	2	6	254692	254697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819759
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5188	NC_020229	A	6	6	255419	255424	100 %	0 %	0 %	0 %	448819761
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5231	NC_020229	GAGT	2	8	257410	257417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5232	NC_020229	T	7	7	257432	257438	0 %	100 %	0 %	0 %	448819762
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5235	NC_020229	CAAT	2	8	257549	257556	50 %	25 %	0 %	25 %	448819762
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5240	NC_020229	CAAA	2	8	257712	257719	75 %	0 %	0 %	25 %	448819762
5241	NC_020229	AAC	2	6	257893	257898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819763
5242	NC_020229	CAC	2	6	257918	257923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819763
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5244	NC_020229	TTA	2	6	258106	258111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819763
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5490	NC_020229	TTG	2	6	271135	271140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819772
5491	NC_020229	GAC	2	6	271155	271160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819772
5492	NC_020229	A	7	7	271164	271170	100 %	0 %	0 %	0 %	448819772
5493	NC_020229	TCAG	2	8	271205	271212	25 %	25 %	25 %	25 %	448819772
5494	NC_020229	GGA	2	6	271240	271245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448819772
5495	NC_020229	ATGG	2	8	271351	271358	25 %	25 %	50 %	0 %	448819772
5496	NC_020229	GAT	2	6	271378	271383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819772
5497	NC_020229	CAT	2	6	271390	271395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819772
5498	NC_020229	CGG	2	6	271446	271451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819772
5499	NC_020229	TG	3	6	271455	271460	0 %	50 %	50 %	0 %	448819772
5500	NC_020229	ACG	2	6	271532	271537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819772

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