MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020130	AT	3	6	116	121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020130	TA	4	8	125	132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020130	AT	3	6	435	440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020130	AT	3	6	455	460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020130	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020130	AT	3	6	2016	2021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020130	TA	7	14	2561	2574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020130	TA	3	6	2642	2647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020130	CA	3	6	2802	2807	50 %	0 %	0 %	50 %	442556537
10	NC_020130	AT	3	6	3024	3029	50 %	50 %	0 %	0 %	442556537
11	NC_020130	AT	3	6	3108	3113	50 %	50 %	0 %	0 %	442556537
12	NC_020130	TA	3	6	3232	3237	50 %	50 %	0 %	0 %	442556537
13	NC_020130	TG	3	6	3564	3569	0 %	50 %	50 %	0 %	442556537
14	NC_020130	TA	3	6	3654	3659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020130	AT	3	6	3724	3729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020130	TG	3	6	4112	4117	0 %	50 %	50 %	0 %	442556538
17	NC_020130	CT	3	6	4547	4552	0 %	50 %	0 %	50 %	442556538
18	NC_020130	GT	3	6	4620	4625	0 %	50 %	50 %	0 %	442556538
19	NC_020130	CA	3	6	5633	5638	50 %	0 %	0 %	50 %	442556539
20	NC_020130	TG	3	6	6241	6246	0 %	50 %	50 %	0 %	442556540
21	NC_020130	TA	3	6	6514	6519	50 %	50 %	0 %	0 %	442556540
22	NC_020130	AT	3	6	6584	6589	50 %	50 %	0 %	0 %	442556540
23	NC_020130	TA	4	8	6627	6634	50 %	50 %	0 %	0 %	442556540
24	NC_020130	AG	3	6	6685	6690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020130	TA	3	6	7125	7130	50 %	50 %	0 %	0 %	442556541
26	NC_020130	TG	3	6	7586	7591	0 %	50 %	50 %	0 %	442556541
27	NC_020130	TA	3	6	7644	7649	50 %	50 %	0 %	0 %	442556541
28	NC_020130	TA	3	6	7660	7665	50 %	50 %	0 %	0 %	442556541
29	NC_020130	AT	3	6	7863	7868	50 %	50 %	0 %	0 %	442556542
30	NC_020130	TA	3	6	7873	7878	50 %	50 %	0 %	0 %	442556542
31	NC_020130	TA	4	8	7902	7909	50 %	50 %	0 %	0 %	442556542
32	NC_020130	AT	3	6	8508	8513	50 %	50 %	0 %	0 %	442556542
33	NC_020130	AT	3	6	9270	9275	50 %	50 %	0 %	0 %	442556542
34	NC_020130	TA	3	6	9392	9397	50 %	50 %	0 %	0 %	442556542
35	NC_020130	TA	3	6	11507	11512	50 %	50 %	0 %	0 %	442556544
36	NC_020130	TA	3	6	12052	12057	50 %	50 %	0 %	0 %	442556544
37	NC_020130	TA	3	6	12424	12429	50 %	50 %	0 %	0 %	442556544
38	NC_020130	TA	3	6	12757	12762	50 %	50 %	0 %	0 %	442556544
39	NC_020130	AT	3	6	13415	13420	50 %	50 %	0 %	0 %	442556544
40	NC_020130	AT	3	6	13980	13985	50 %	50 %	0 %	0 %	442556544
41	NC_020130	AC	3	6	14229	14234	50 %	0 %	0 %	50 %	442556544
42	NC_020130	TA	3	6	14491	14496	50 %	50 %	0 %	0 %	442556544
43	NC_020130	TA	3	6	14729	14734	50 %	50 %	0 %	0 %	442556545
44	NC_020130	AG	3	6	14739	14744	50 %	0 %	50 %	0 %	442556545
45	NC_020130	TA	3	6	14808	14813	50 %	50 %	0 %	0 %	442556545
46	NC_020130	TG	4	8	15252	15259	0 %	50 %	50 %	0 %	442556545
47	NC_020130	AT	3	6	15840	15845	50 %	50 %	0 %	0 %	442556546
48	NC_020130	GA	4	8	16130	16137	50 %	0 %	50 %	0 %	442556546
49	NC_020130	TA	3	6	16383	16388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020130	AT	3	6	18363	18368	50 %	50 %	0 %	0 %	442556548
51	NC_020130	GA	3	6	18800	18805	50 %	0 %	50 %	0 %	442556549
52	NC_020130	TA	6	12	18817	18828	50 %	50 %	0 %	0 %	442556549
53	NC_020130	GT	3	6	18890	18895	0 %	50 %	50 %	0 %	442556549
54	NC_020130	GT	3	6	19227	19232	0 %	50 %	50 %	0 %	442556549
55	NC_020130	AG	3	6	20197	20202	50 %	0 %	50 %	0 %	442556550
56	NC_020130	CA	3	6	20249	20254	50 %	0 %	0 %	50 %	442556550
57	NC_020130	AT	3	6	20437	20442	50 %	50 %	0 %	0 %	442556550
58	NC_020130	AG	3	6	20556	20561	50 %	0 %	50 %	0 %	442556550
59	NC_020130	AG	4	8	20752	20759	50 %	0 %	50 %	0 %	442556550
60	NC_020130	TA	3	6	21799	21804	50 %	50 %	0 %	0 %	442556552
61	NC_020130	TA	3	6	22956	22961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020130	TA	3	6	23166	23171	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
63	NC_020130	GT	3	6	23424	23429	0 %	50 %	50 %	0 %	442556554
64	NC_020130	AT	3	6	23837	23842	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
65	NC_020130	GA	3	6	24470	24475	50 %	0 %	50 %	0 %	442556554
66	NC_020130	AT	3	6	25559	25564	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
67	NC_020130	TA	3	6	25668	25673	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
68	NC_020130	AT	3	6	25866	25871	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
69	NC_020130	AG	3	6	26027	26032	50 %	0 %	50 %	0 %	442556554
70	NC_020130	TA	3	6	26123	26128	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
71	NC_020130	TA	3	6	26455	26460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020130	CT	3	6	26523	26528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020130	TA	3	6	26582	26587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020130	AT	3	6	26696	26701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020130	AT	3	6	26791	26796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020130	CT	3	6	26882	26887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020130	TA	3	6	27004	27009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020130	AT	3	6	27715	27720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020130	TA	3	6	28015	28020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020130	AG	3	6	28102	28107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020130	AG	3	6	28368	28373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020130	TA	6	12	29259	29270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020130	TA	3	6	29347	29352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020130	TA	3	6	29526	29531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020130	AG	3	6	29974	29979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020130	GT	4	8	30608	30615	0 %	50 %	50 %	0 %	442556555
87	NC_020130	TG	4	8	30850	30857	0 %	50 %	50 %	0 %	442556555
88	NC_020130	TC	3	6	31156	31161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020130	GA	3	6	31283	31288	50 %	0 %	50 %	0 %	442556556
90	NC_020130	GA	3	6	32043	32048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020130	TA	3	6	32065	32070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020130	TA	3	6	32115	32120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020130	TA	3	6	32181	32186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020130	TA	3	6	32192	32197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020130	TA	3	6	32215	32220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020130	TA	3	6	32236	32241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020130	GT	3	6	34207	34212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020130	AT	3	6	34601	34606	50 %	50 %	0 %	0 %	442556559
99	NC_020130	AT	3	6	35453	35458	50 %	50 %	0 %	0 %	442556559
100	NC_020130	TA	7	14	35498	35511	50 %	50 %	0 %	0 %	442556559
101	NC_020130	AT	3	6	35605	35610	50 %	50 %	0 %	0 %	442556559
102	NC_020130	GT	3	6	35635	35640	0 %	50 %	50 %	0 %	442556559
103	NC_020130	TA	3	6	35725	35730	50 %	50 %	0 %	0 %	442556559
104	NC_020130	TA	3	6	35898	35903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020130	TA	3	6	36094	36099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020130	TA	4	8	36188	36195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020130	AC	3	6	36344	36349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020130	CT	3	6	36422	36427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020130	AC	4	8	37368	37375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020130	TA	7	14	37411	37424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020130	AT	3	6	37567	37572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020130	AC	3	6	38188	38193	50 %	0 %	0 %	50 %	442556560
113	NC_020130	AT	3	6	38377	38382	50 %	50 %	0 %	0 %	442556560
114	NC_020130	AT	3	6	38538	38543	50 %	50 %	0 %	0 %	442556560
115	NC_020130	AT	3	6	39162	39167	50 %	50 %	0 %	0 %	442556560
116	NC_020130	AG	3	6	39583	39588	50 %	0 %	50 %	0 %	442556560
117	NC_020130	TA	3	6	40045	40050	50 %	50 %	0 %	0 %	442556561
118	NC_020130	TA	3	6	41291	41296	50 %	50 %	0 %	0 %	442556562
119	NC_020130	AC	3	6	41352	41357	50 %	0 %	0 %	50 %	442556562
120	NC_020130	TA	3	6	41486	41491	50 %	50 %	0 %	0 %	442556562
121	NC_020130	TA	3	6	41686	41691	50 %	50 %	0 %	0 %	442556562
122	NC_020130	TA	3	6	41773	41778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020130	TA	3	6	41829	41834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020130	TA	3	6	42794	42799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020130	TC	3	6	42870	42875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020130	AT	3	6	43376	43381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020130	TG	3	6	43827	43832	0 %	50 %	50 %	0 %	442556563
128	NC_020130	AT	4	8	44247	44254	50 %	50 %	0 %	0 %	442556563
129	NC_020130	TA	3	6	44307	44312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020130	TG	3	6	44639	44644	0 %	50 %	50 %	0 %	442556564
131	NC_020130	AT	3	6	46211	46216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020130	TA	3	6	46679	46684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020130	TA	3	6	46917	46922	50 %	50 %	0 %	0 %	442556566
134	NC_020130	TA	3	6	46934	46939	50 %	50 %	0 %	0 %	442556566
135	NC_020130	CT	3	6	47075	47080	0 %	50 %	0 %	50 %	442556566
136	NC_020130	AT	3	6	47274	47279	50 %	50 %	0 %	0 %	442556566
137	NC_020130	TA	3	6	48047	48052	50 %	50 %	0 %	0 %	442556566
138	NC_020130	AC	3	6	48856	48861	50 %	0 %	0 %	50 %	442556566
139	NC_020130	TC	3	6	50020	50025	0 %	50 %	0 %	50 %	442556566
140	NC_020130	AT	3	6	51397	51402	50 %	50 %	0 %	0 %	442556566
141	NC_020130	AT	3	6	51613	51618	50 %	50 %	0 %	0 %	442556566
142	NC_020130	AC	3	6	51755	51760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020130	AT	3	6	51846	51851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020130	AT	3	6	52560	52565	50 %	50 %	0 %	0 %	442556567
145	NC_020130	CA	4	8	53205	53212	50 %	0 %	0 %	50 %	442556567
146	NC_020130	AC	3	6	53545	53550	50 %	0 %	0 %	50 %	442556568
147	NC_020130	CT	3	6	54805	54810	0 %	50 %	0 %	50 %	442556568
148	NC_020130	TA	3	6	55717	55722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020130	TA	3	6	55827	55832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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