MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 5701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020130	TAGA	2	8	140224	140231	50 %	25 %	25 %	0 %	442556610
4002	NC_020130	GAT	2	6	140270	140275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556610
4003	NC_020130	TCT	2	6	140402	140407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556610
4004	NC_020130	TAC	2	6	140413	140418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556610
4005	NC_020130	ATT	2	6	140476	140481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020130	ATAGTT	2	12	140483	140494	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020130	ATGG	2	8	140514	140521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020130	T	7	7	140522	140528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020130	ATA	2	6	140530	140535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020130	A	9	9	140535	140543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020130	T	8	8	140562	140569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020130	AGA	2	6	140576	140581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020130	T	6	6	140589	140594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_020130	T	6	6	140606	140611	0 %	100 %	0 %	0 %	442556611
4015	NC_020130	A	6	6	140613	140618	100 %	0 %	0 %	0 %	442556611
4016	NC_020130	TAA	2	6	140654	140659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556611
4017	NC_020130	AGA	2	6	140673	140678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556611
4018	NC_020130	TTA	2	6	140709	140714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556611
4019	NC_020130	T	6	6	140731	140736	0 %	100 %	0 %	0 %	442556611
4020	NC_020130	CTAT	2	8	140846	140853	25 %	50 %	0 %	25 %	442556611
4021	NC_020130	A	6	6	140926	140931	100 %	0 %	0 %	0 %	442556611
4022	NC_020130	AGC	2	6	140957	140962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556611
4023	NC_020130	TTG	2	6	140965	140970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556611
4024	NC_020130	T	6	6	141007	141012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020130	CAG	2	6	141025	141030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_020130	CTC	2	6	141068	141073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_020130	AGT	2	6	141114	141119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556612
4028	NC_020130	GA	3	6	141124	141129	50 %	0 %	50 %	0 %	442556612
4029	NC_020130	AGAA	2	8	141163	141170	75 %	0 %	25 %	0 %	442556612
4030	NC_020130	T	6	6	141175	141180	0 %	100 %	0 %	0 %	442556612
4031	NC_020130	GAA	2	6	141186	141191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556612
4032	NC_020130	AAGGTT	2	12	141196	141207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556612
4033	NC_020130	T	6	6	141260	141265	0 %	100 %	0 %	0 %	442556612
4034	NC_020130	AGC	2	6	141274	141279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556612
4035	NC_020130	T	8	8	141317	141324	0 %	100 %	0 %	0 %	442556612
4036	NC_020130	TAG	2	6	141339	141344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556612
4037	NC_020130	T	6	6	141358	141363	0 %	100 %	0 %	0 %	442556612
4038	NC_020130	ATA	2	6	141367	141372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556612
4039	NC_020130	T	6	6	141404	141409	0 %	100 %	0 %	0 %	442556612
4040	NC_020130	ATA	2	6	141433	141438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556612
4041	NC_020130	TGGGAT	2	12	141445	141456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	442556612
4042	NC_020130	GAT	2	6	141476	141481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556612
4043	NC_020130	TCT	2	6	141527	141532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556612
4044	NC_020130	AAG	2	6	141538	141543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556612
4045	NC_020130	CAA	2	6	141585	141590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556612
4046	NC_020130	GAA	2	6	141621	141626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556612
4047	NC_020130	AT	3	6	141636	141641	50 %	50 %	0 %	0 %	442556612
4048	NC_020130	C	6	6	141660	141665	0 %	0 %	0 %	100 %	442556612
4049	NC_020130	T	9	9	141676	141684	0 %	100 %	0 %	0 %	442556612
4050	NC_020130	ATT	2	6	141761	141766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556612
4051	NC_020130	ATC	2	6	141790	141795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556612
4052	NC_020130	AT	3	6	141812	141817	50 %	50 %	0 %	0 %	442556612
4053	NC_020130	AGC	2	6	141850	141855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556612
4054	NC_020130	GAA	2	6	141879	141884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556612
4055	NC_020130	TAG	2	6	141915	141920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556612
4056	NC_020130	TAT	2	6	141927	141932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556612
4057	NC_020130	CAT	2	6	141942	141947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556612
4058	NC_020130	AAT	2	6	141949	141954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556612
4059	NC_020130	AC	3	6	141987	141992	50 %	0 %	0 %	50 %	442556612
4060	NC_020130	TAGG	2	8	142028	142035	25 %	25 %	50 %	0 %	442556612
4061	NC_020130	TAA	2	6	142038	142043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556612
4062	NC_020130	ATT	2	6	142049	142054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556612
4063	NC_020130	GTTTG	2	10	142073	142082	0 %	60 %	40 %	0 %	442556613
4064	NC_020130	GCA	2	6	142123	142128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556613
4065	NC_020130	AAC	2	6	142235	142240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556613
4066	NC_020130	AAT	2	6	142245	142250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556613
4067	NC_020130	GT	3	6	142263	142268	0 %	50 %	50 %	0 %	442556613
4068	NC_020130	TTC	2	6	142281	142286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556613
4069	NC_020130	TGA	2	6	142389	142394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556613
4070	NC_020130	AAT	2	6	142499	142504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556613
4071	NC_020130	TCA	2	6	142537	142542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556613
4072	NC_020130	CTA	2	6	142570	142575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556613
4073	NC_020130	TTG	2	6	142601	142606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556613
4074	NC_020130	TGG	2	6	142627	142632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556613
4075	NC_020130	AGC	2	6	142647	142652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556613
4076	NC_020130	T	6	6	142683	142688	0 %	100 %	0 %	0 %	442556613
4077	NC_020130	GAT	2	6	142690	142695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556613
4078	NC_020130	TAT	2	6	142697	142702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556613
4079	NC_020130	TAT	2	6	142706	142711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556613
4080	NC_020130	T	6	6	142782	142787	0 %	100 %	0 %	0 %	442556613
4081	NC_020130	ACC	2	6	142820	142825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556613
4082	NC_020130	GGA	2	6	142828	142833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556613
4083	NC_020130	ATT	2	6	142845	142850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556613
4084	NC_020130	GAT	2	6	142857	142862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556613
4085	NC_020130	T	6	6	142878	142883	0 %	100 %	0 %	0 %	442556613
4086	NC_020130	ATT	2	6	142893	142898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556613
4087	NC_020130	T	8	8	142918	142925	0 %	100 %	0 %	0 %	442556613
4088	NC_020130	CTA	2	6	143000	143005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556613
4089	NC_020130	AAT	2	6	143007	143012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556613
4090	NC_020130	GTT	2	6	143029	143034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556613
4091	NC_020130	ATG	2	6	143066	143071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556613
4092	NC_020130	AAT	2	6	143094	143099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556613
4093	NC_020130	AGT	2	6	143184	143189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_020130	ATC	2	6	143248	143253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_020130	TAAA	2	8	143296	143303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_020130	A	8	8	143307	143314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_020130	ATTA	2	8	143318	143325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_020130	ATA	2	6	143349	143354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_020130	T	9	9	143384	143392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_020130	ATCAA	2	10	143462	143471	60 %	20 %	0 %	20 %	442556614
4101	NC_020130	TA	3	6	143489	143494	50 %	50 %	0 %	0 %	442556614
4102	NC_020130	TGA	2	6	143501	143506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556614
4103	NC_020130	TGG	2	6	143521	143526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556614
4104	NC_020130	GAA	2	6	143614	143619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556614
4105	NC_020130	TTA	2	6	143632	143637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556614
4106	NC_020130	TTG	2	6	143660	143665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556614
4107	NC_020130	CAG	2	6	143669	143674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556614
4108	NC_020130	CTG	2	6	143684	143689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556614
4109	NC_020130	TA	4	8	143702	143709	50 %	50 %	0 %	0 %	442556614
4110	NC_020130	TA	3	6	143871	143876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_020130	CTG	2	6	143896	143901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_020130	ATC	2	6	143917	143922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_020130	TTA	2	6	144037	144042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_020130	GTT	2	6	144063	144068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020130	CA	3	6	144077	144082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_020130	AAC	2	6	144113	144118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_020130	TGT	2	6	144125	144130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020130	GTT	2	6	144180	144185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020130	TTG	2	6	144244	144249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020130	CCT	2	6	144252	144257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_020130	CTT	2	6	144279	144284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_020130	GGT	2	6	144294	144299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020130	CTT	2	6	144336	144341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_020130	CCA	2	6	144357	144362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_020130	GGA	3	9	144363	144371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020130	TTA	2	6	144469	144474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020130	TGT	2	6	144563	144568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_020130	TGC	2	6	144572	144577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_020130	GTT	2	6	144651	144656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_020130	ACA	2	6	144668	144673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_020130	GTG	2	6	144700	144705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_020130	TTA	2	6	144763	144768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_020130	CTTT	2	8	144922	144929	0 %	75 %	0 %	25 %	442556615
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4142	NC_020130	T	7	7	145395	145401	0 %	100 %	0 %	0 %	442556615
4143	NC_020130	GTA	2	6	145449	145454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_020130	TTTTA	2	10	145471	145480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_020130	CTT	2	6	145489	145494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4148	NC_020130	TTA	2	6	145612	145617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_020130	TA	3	6	145625	145630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_020130	ATT	2	6	145641	145646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4152	NC_020130	AAG	3	9	145691	145699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_020130	AGGA	2	8	145713	145720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_020130	TGT	3	9	145748	145756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_020130	TCC	2	6	145779	145784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4156	NC_020130	CTA	2	6	145789	145794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4158	NC_020130	AATA	2	8	145901	145908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_020130	AGT	3	9	145923	145931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4161	NC_020130	ATT	2	6	146047	146052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_020130	TAA	2	6	146091	146096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_020130	T	6	6	146107	146112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_020130	T	6	6	146118	146123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_020130	TAG	2	6	146142	146147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4168	NC_020130	TAA	2	6	146235	146240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4222	NC_020130	A	6	6	148237	148242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_020130	TA	3	6	148950	148955	50 %	50 %	0 %	0 %	442556617
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4254	NC_020130	A	6	6	149065	149070	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
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4366	NC_020130	TATCA	2	10	152950	152959	40 %	40 %	0 %	20 %	442556617
4367	NC_020130	T	6	6	152967	152972	0 %	100 %	0 %	0 %	442556617
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4372	NC_020130	A	7	7	153084	153090	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
4373	NC_020130	GAG	2	6	153097	153102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556617
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4375	NC_020130	AGAA	2	8	153155	153162	75 %	0 %	25 %	0 %	442556617
4376	NC_020130	TCT	2	6	153171	153176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556617
4377	NC_020130	GAA	2	6	153190	153195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
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4379	NC_020130	GAA	2	6	153232	153237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
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