MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 5701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020130	A	8	8	120784	120791	100 %	0 %	0 %	0 %	442556593
3502	NC_020130	GTAATA	2	12	120793	120804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442556593
3503	NC_020130	TTGT	2	8	120811	120818	0 %	75 %	25 %	0 %	442556593
3504	NC_020130	T	7	7	120874	120880	0 %	100 %	0 %	0 %	442556593
3505	NC_020130	TGTA	2	8	120890	120897	25 %	50 %	25 %	0 %	442556593
3506	NC_020130	TA	4	8	120922	120929	50 %	50 %	0 %	0 %	442556593
3507	NC_020130	ATA	2	6	120972	120977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556593
3508	NC_020130	GT	3	6	121033	121038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_020130	ATTTT	2	10	121046	121055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_020130	T	6	6	121052	121057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_020130	AT	3	6	121059	121064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_020130	ATATT	2	10	121073	121082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_020130	TTTA	2	8	121086	121093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020130	TAA	2	6	121112	121117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_020130	T	6	6	121149	121154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_020130	GATA	2	8	121174	121181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_020130	A	6	6	121181	121186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_020130	GAA	2	6	121187	121192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_020130	GTA	2	6	121218	121223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_020130	T	6	6	121230	121235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_020130	A	6	6	121239	121244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020130	ATA	2	6	121294	121299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_020130	TCTA	2	8	121310	121317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_020130	ATA	2	6	121319	121324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020130	AGT	2	6	121384	121389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020130	AGG	2	6	121393	121398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020130	T	6	6	121399	121404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_020130	TTG	2	6	121434	121439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020130	AAT	2	6	121442	121447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_020130	AT	3	6	121464	121469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020130	TAT	2	6	121476	121481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020130	AT	3	6	121486	121491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020130	AGA	2	6	121522	121527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020130	ATG	2	6	121564	121569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020130	AT	3	6	121577	121582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_020130	ATA	2	6	121590	121595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_020130	TTAT	2	8	121626	121633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_020130	TAT	2	6	121637	121642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_020130	T	6	6	121644	121649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_020130	T	6	6	121662	121667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_020130	ACA	2	6	121690	121695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_020130	TAT	2	6	121714	121719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_020130	TA	3	6	121741	121746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_020130	A	6	6	121758	121763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_020130	CTTTAT	2	12	121791	121802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3546	NC_020130	T	7	7	121805	121811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_020130	TTC	2	6	121825	121830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_020130	T	6	6	121835	121840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_020130	ATT	2	6	121960	121965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_020130	GAAA	2	8	121966	121973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_020130	G	6	6	121996	122001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_020130	AGA	2	6	122055	122060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556594
3553	NC_020130	CCT	2	6	122116	122121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556594
3554	NC_020130	AGG	2	6	122174	122179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556594
3555	NC_020130	ACG	2	6	122184	122189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556594
3556	NC_020130	TGAT	2	8	122216	122223	25 %	50 %	25 %	0 %	442556594
3557	NC_020130	CTG	3	9	122270	122278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556594
3558	NC_020130	CTT	2	6	122296	122301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556594
3559	NC_020130	GAATG	2	10	122307	122316	40 %	20 %	40 %	0 %	442556594
3560	NC_020130	ATAC	2	8	122352	122359	50 %	25 %	0 %	25 %	442556594
3561	NC_020130	AATATA	2	12	122369	122380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556594
3562	NC_020130	CAA	2	6	122405	122410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556594
3563	NC_020130	GCA	2	6	122437	122442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556594
3564	NC_020130	ATGGA	2	10	122465	122474	40 %	20 %	40 %	0 %	442556594
3565	NC_020130	TAC	2	6	122496	122501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556594
3566	NC_020130	AAG	2	6	122515	122520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556594
3567	NC_020130	TCT	2	6	122629	122634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556594
3568	NC_020130	A	8	8	122670	122677	100 %	0 %	0 %	0 %	442556594
3569	NC_020130	ACA	2	6	122685	122690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556594
3570	NC_020130	AAG	2	6	122798	122803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556594
3571	NC_020130	GAA	2	6	122845	122850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556594
3572	NC_020130	CGTG	2	8	122926	122933	0 %	25 %	50 %	25 %	442556594
3573	NC_020130	AGG	2	6	123071	123076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556594
3574	NC_020130	TTA	2	6	123116	123121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556594
3575	NC_020130	AAG	2	6	123127	123132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556594
3576	NC_020130	AAT	2	6	123140	123145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556594
3577	NC_020130	GAA	2	6	123204	123209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_020130	GCA	2	6	123243	123248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556595
3579	NC_020130	TGGC	2	8	123284	123291	0 %	25 %	50 %	25 %	442556595
3580	NC_020130	AGTA	2	8	123392	123399	50 %	25 %	25 %	0 %	442556595
3581	NC_020130	GAT	2	6	123420	123425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556595
3582	NC_020130	TA	3	6	123436	123441	50 %	50 %	0 %	0 %	442556595
3583	NC_020130	GCA	2	6	123468	123473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556595
3584	NC_020130	TGA	2	6	123485	123490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556595
3585	NC_020130	CTT	2	6	123504	123509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556595
3586	NC_020130	ACA	2	6	123522	123527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556595
3587	NC_020130	T	7	7	123548	123554	0 %	100 %	0 %	0 %	442556595
3588	NC_020130	AAC	2	6	123602	123607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556595
3589	NC_020130	TGT	5	15	123650	123664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556595
3590	NC_020130	TTG	2	6	123687	123692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556595
3591	NC_020130	GTTC	2	8	123855	123862	0 %	50 %	25 %	25 %	442556595
3592	NC_020130	GGA	2	6	123930	123935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556595
3593	NC_020130	CTTGGT	2	12	123942	123953	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	442556595
3594	NC_020130	AAG	2	6	123964	123969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556595
3595	NC_020130	GTT	2	6	123981	123986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556595
3596	NC_020130	CAA	2	6	124072	124077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556595
3597	NC_020130	ATTG	2	8	124080	124087	25 %	50 %	25 %	0 %	442556595
3598	NC_020130	TTGG	2	8	124091	124098	0 %	50 %	50 %	0 %	442556595
3599	NC_020130	TGA	2	6	124171	124176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556596
3600	NC_020130	ATCA	2	8	124214	124221	50 %	25 %	0 %	25 %	442556596
3601	NC_020130	ACC	2	6	124282	124287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556596
3602	NC_020130	TTC	2	6	124290	124295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556596
3603	NC_020130	TAG	2	6	124302	124307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556596
3604	NC_020130	CGT	2	6	124353	124358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556596
3605	NC_020130	GTC	2	6	124460	124465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556596
3606	NC_020130	AGCAT	2	10	124555	124564	40 %	20 %	20 %	20 %	442556596
3607	NC_020130	AT	3	6	124563	124568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_020130	TGT	2	6	124579	124584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556597
3609	NC_020130	AGA	2	6	124592	124597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556597
3610	NC_020130	TGG	2	6	124658	124663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556597
3611	NC_020130	TGT	2	6	124688	124693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556597
3612	NC_020130	GA	3	6	124729	124734	50 %	0 %	50 %	0 %	442556597
3613	NC_020130	TTG	2	6	124791	124796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556597
3614	NC_020130	AGC	2	6	124802	124807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556597
3615	NC_020130	ACA	2	6	124950	124955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556597
3616	NC_020130	ACA	2	6	124979	124984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556597
3617	NC_020130	TAT	2	6	125157	125162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556597
3618	NC_020130	CTT	2	6	125196	125201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556597
3619	NC_020130	ACA	2	6	125223	125228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_020130	A	6	6	125285	125290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_020130	TTA	2	6	125421	125426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556598
3622	NC_020130	TTA	2	6	125492	125497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556598
3623	NC_020130	TTTGGT	2	12	125498	125509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556598
3624	NC_020130	CATG	2	8	125539	125546	25 %	25 %	25 %	25 %	442556598
3625	NC_020130	CAG	2	6	125610	125615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556598
3626	NC_020130	GAT	2	6	125702	125707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556598
3627	NC_020130	TTG	2	6	125751	125756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556598
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3629	NC_020130	GTG	2	6	125898	125903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556598
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