MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 5701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020130	GAA	2	6	89462	89467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556581
2502	NC_020130	T	6	6	89474	89479	0 %	100 %	0 %	0 %	442556581
2503	NC_020130	AC	3	6	89510	89515	50 %	0 %	0 %	50 %	442556581
2504	NC_020130	AAC	2	6	89537	89542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556581
2505	NC_020130	AT	4	8	89549	89556	50 %	50 %	0 %	0 %	442556581
2506	NC_020130	AACC	2	8	89574	89581	50 %	0 %	0 %	50 %	442556581
2507	NC_020130	A	6	6	89640	89645	100 %	0 %	0 %	0 %	442556581
2508	NC_020130	CCAT	2	8	89667	89674	25 %	25 %	0 %	50 %	442556581
2509	NC_020130	AAC	2	6	89724	89729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556581
2510	NC_020130	TGC	2	6	89730	89735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556581
2511	NC_020130	CTTTG	2	10	89754	89763	0 %	60 %	20 %	20 %	442556581
2512	NC_020130	CTAC	2	8	89773	89780	25 %	25 %	0 %	50 %	442556581
2513	NC_020130	TTCT	2	8	89802	89809	0 %	75 %	0 %	25 %	442556581
2514	NC_020130	TCA	2	6	89812	89817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556581
2515	NC_020130	GAC	2	6	89822	89827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556581
2516	NC_020130	TA	3	6	89828	89833	50 %	50 %	0 %	0 %	442556581
2517	NC_020130	ATC	2	6	89919	89924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556581
2518	NC_020130	TAC	2	6	89982	89987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556581
2519	NC_020130	TAA	2	6	89991	89996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556581
2520	NC_020130	GAT	2	6	90016	90021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556581
2521	NC_020130	TTA	2	6	90031	90036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556581
2522	NC_020130	T	6	6	90065	90070	0 %	100 %	0 %	0 %	442556581
2523	NC_020130	ACTT	2	8	90156	90163	25 %	50 %	0 %	25 %	442556581
2524	NC_020130	AT	3	6	90219	90224	50 %	50 %	0 %	0 %	442556581
2525	NC_020130	TTC	2	6	90228	90233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556581
2526	NC_020130	CAC	2	6	90236	90241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556581
2527	NC_020130	CCA	3	9	90244	90252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556581
2528	NC_020130	ACC	3	9	90255	90263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556581
2529	NC_020130	AT	4	8	90273	90280	50 %	50 %	0 %	0 %	442556581
2530	NC_020130	TCA	2	6	90283	90288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556581
2531	NC_020130	TTC	2	6	90294	90299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556581
2532	NC_020130	GAA	2	6	90313	90318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556581
2533	NC_020130	CTC	2	6	90324	90329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556581
2534	NC_020130	CCT	2	6	90361	90366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556581
2535	NC_020130	GTG	2	6	90386	90391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556581
2536	NC_020130	AAC	2	6	90402	90407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556581
2537	NC_020130	AGA	2	6	90426	90431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556581
2538	NC_020130	AGT	2	6	90450	90455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556581
2539	NC_020130	GACT	2	8	90460	90467	25 %	25 %	25 %	25 %	442556581
2540	NC_020130	TTC	2	6	90498	90503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556581
2541	NC_020130	CAGC	2	8	90628	90635	25 %	0 %	25 %	50 %	442556581
2542	NC_020130	GCT	2	6	90655	90660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556581
2543	NC_020130	AGT	3	9	90675	90683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556581
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2546	NC_020130	CTC	3	9	90752	90760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556581
2547	NC_020130	AACTA	2	10	90762	90771	60 %	20 %	0 %	20 %	442556581
2548	NC_020130	TGA	3	9	90777	90785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556581
2549	NC_020130	CAA	2	6	90829	90834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556581
2550	NC_020130	TAG	2	6	90839	90844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556581
2551	NC_020130	TCC	2	6	90894	90899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556581
2552	NC_020130	GCA	2	6	90916	90921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556581
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2554	NC_020130	CAT	2	6	91037	91042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556581
2555	NC_020130	ATT	2	6	91050	91055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556581
2556	NC_020130	A	6	6	91083	91088	100 %	0 %	0 %	0 %	442556581
2557	NC_020130	A	8	8	91090	91097	100 %	0 %	0 %	0 %	442556581
2558	NC_020130	ATT	2	6	91131	91136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556581
2559	NC_020130	TTA	2	6	91147	91152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556581
2560	NC_020130	TAA	2	6	91181	91186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556581
2561	NC_020130	AT	7	14	91207	91220	50 %	50 %	0 %	0 %	442556581
2562	NC_020130	ACT	2	6	91227	91232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_020130	CTA	2	6	91272	91277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_020130	TCT	2	6	91286	91291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_020130	TG	3	6	91337	91342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_020130	TTA	3	9	91346	91354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_020130	ATT	2	6	91356	91361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_020130	TACT	2	8	91396	91403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2569	NC_020130	A	6	6	91412	91417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_020130	A	7	7	91427	91433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_020130	AT	3	6	91485	91490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_020130	A	6	6	91495	91500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_020130	TAA	2	6	91524	91529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_020130	TTA	2	6	91535	91540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020130	AT	3	6	91560	91565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_020130	ACA	2	6	91605	91610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_020130	A	6	6	91656	91661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_020130	ATAC	2	8	91675	91682	50 %	25 %	0 %	25 %	442556582
2579	NC_020130	ATC	2	6	91695	91700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556582
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2583	NC_020130	AT	3	6	91896	91901	50 %	50 %	0 %	0 %	442556582
2584	NC_020130	TTG	2	6	91942	91947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556582
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2587	NC_020130	TAC	2	6	92090	92095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556582
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2591	NC_020130	CTG	2	6	92284	92289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556582
2592	NC_020130	TGTCTT	2	12	92306	92317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442556582
2593	NC_020130	ATCA	2	8	92417	92424	50 %	25 %	0 %	25 %	442556582
2594	NC_020130	GAAC	2	8	92442	92449	50 %	0 %	25 %	25 %	442556582
2595	NC_020130	GTTT	2	8	92462	92469	0 %	75 %	25 %	0 %	442556582
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2597	NC_020130	TAA	2	6	92639	92644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556582
2598	NC_020130	AAT	2	6	92679	92684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556582
2599	NC_020130	TGT	2	6	92688	92693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556582
2600	NC_020130	CCA	2	6	92805	92810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556582
2601	NC_020130	CTC	2	6	92816	92821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556582
2602	NC_020130	GGA	3	9	92886	92894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556582
2603	NC_020130	TA	3	6	92918	92923	50 %	50 %	0 %	0 %	442556582
2604	NC_020130	TCA	2	6	92931	92936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556582
2605	NC_020130	CT	4	8	92967	92974	0 %	50 %	0 %	50 %	442556582
2606	NC_020130	A	7	7	92978	92984	100 %	0 %	0 %	0 %	442556582
2607	NC_020130	GCA	2	6	93003	93008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556582
2608	NC_020130	TTCT	2	8	93019	93026	0 %	75 %	0 %	25 %	442556582
2609	NC_020130	CT	3	6	93032	93037	0 %	50 %	0 %	50 %	442556582
2610	NC_020130	CTTT	2	8	93059	93066	0 %	75 %	0 %	25 %	442556582
2611	NC_020130	T	6	6	93064	93069	0 %	100 %	0 %	0 %	442556582
2612	NC_020130	ATC	2	6	93074	93079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556582
2613	NC_020130	ATC	2	6	93090	93095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556582
2614	NC_020130	TTTC	2	8	93139	93146	0 %	75 %	0 %	25 %	442556582
2615	NC_020130	TTC	2	6	93173	93178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556582
2616	NC_020130	T	6	6	93179	93184	0 %	100 %	0 %	0 %	442556582
2617	NC_020130	AC	3	6	93199	93204	50 %	0 %	0 %	50 %	442556582
2618	NC_020130	CTG	2	6	93211	93216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556582
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2620	NC_020130	GTA	2	6	93303	93308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556582
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2622	NC_020130	AC	3	6	93337	93342	50 %	0 %	0 %	50 %	442556582
2623	NC_020130	CAC	3	9	93340	93348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556582
2624	NC_020130	A	6	6	93381	93386	100 %	0 %	0 %	0 %	442556582
2625	NC_020130	TAT	2	6	93430	93435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556582
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2627	NC_020130	A	6	6	93463	93468	100 %	0 %	0 %	0 %	442556582
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