MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 5701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020130	A	6	6	73291	73296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_020130	ATTTT	2	10	73322	73331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_020130	TA	3	6	73336	73341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_020130	T	6	6	73373	73378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_020130	TAA	2	6	73397	73402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_020130	TTA	2	6	73449	73454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556575
2007	NC_020130	A	7	7	73490	73496	100 %	0 %	0 %	0 %	442556575
2008	NC_020130	T	6	6	73702	73707	0 %	100 %	0 %	0 %	442556575
2009	NC_020130	CTT	2	6	73717	73722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556575
2010	NC_020130	ACT	2	6	73727	73732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556575
2011	NC_020130	ATA	2	6	73789	73794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556575
2012	NC_020130	AAT	2	6	73811	73816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556575
2013	NC_020130	T	6	6	73824	73829	0 %	100 %	0 %	0 %	442556575
2014	NC_020130	AT	3	6	73842	73847	50 %	50 %	0 %	0 %	442556575
2015	NC_020130	CCA	2	6	73863	73868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556575
2016	NC_020130	A	6	6	73922	73927	100 %	0 %	0 %	0 %	442556575
2017	NC_020130	ATA	2	6	73955	73960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556575
2018	NC_020130	TAG	2	6	74011	74016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556575
2019	NC_020130	TA	3	6	74033	74038	50 %	50 %	0 %	0 %	442556575
2020	NC_020130	T	6	6	74096	74101	0 %	100 %	0 %	0 %	442556575
2021	NC_020130	ACA	2	6	74113	74118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556575
2022	NC_020130	GAG	2	6	74140	74145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556575
2023	NC_020130	GCTTG	2	10	74160	74169	0 %	40 %	40 %	20 %	442556575
2024	NC_020130	CTC	2	6	74209	74214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556575
2025	NC_020130	ACT	2	6	74231	74236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556575
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2027	NC_020130	CATT	2	8	74316	74323	25 %	50 %	0 %	25 %	442556575
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2031	NC_020130	TTG	2	6	74561	74566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556575
2032	NC_020130	AGA	2	6	74570	74575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556575
2033	NC_020130	CTT	2	6	74578	74583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556575
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2035	NC_020130	CCA	2	6	74694	74699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556575
2036	NC_020130	CAT	2	6	74710	74715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556575
2037	NC_020130	AGA	2	6	74732	74737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556575
2038	NC_020130	TCT	2	6	74745	74750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556575
2039	NC_020130	CTA	2	6	74751	74756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556575
2040	NC_020130	AG	3	6	74765	74770	50 %	0 %	50 %	0 %	442556575
2041	NC_020130	CTA	2	6	74791	74796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556575
2042	NC_020130	TGCTT	2	10	74801	74810	0 %	60 %	20 %	20 %	442556575
2043	NC_020130	GGT	2	6	74850	74855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556575
2044	NC_020130	TTG	2	6	74861	74866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556575
2045	NC_020130	AG	3	6	74870	74875	50 %	0 %	50 %	0 %	442556575
2046	NC_020130	GTA	2	6	74947	74952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556575
2047	NC_020130	GAT	2	6	74965	74970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556575
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2052	NC_020130	CAT	2	6	75155	75160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556575
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2055	NC_020130	A	7	7	75263	75269	100 %	0 %	0 %	0 %	442556575
2056	NC_020130	ATTT	2	8	75302	75309	25 %	75 %	0 %	0 %	442556575
2057	NC_020130	CTC	2	6	75315	75320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556575
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2081	NC_020130	AAT	2	6	76101	76106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2082	NC_020130	ACT	2	6	76112	76117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2088	NC_020130	TA	3	6	76183	76188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_020130	A	9	9	76193	76201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2102	NC_020130	CTG	2	6	76632	76637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2105	NC_020130	TTTA	2	8	76794	76801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_020130	A	6	6	76833	76838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_020130	A	6	6	76874	76879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_020130	TAA	2	6	76880	76885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_020130	A	6	6	76889	76894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_020130	TAC	2	6	77012	77017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2112	NC_020130	AAAG	2	8	77118	77125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_020130	TTCT	2	8	77142	77149	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2114	NC_020130	A	7	7	77174	77180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_020130	AGA	2	6	77196	77201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_020130	TTA	2	6	77209	77214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_020130	TAA	2	6	77219	77224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_020130	TAA	2	6	77257	77262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_020130	TGA	2	6	77281	77286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2127	NC_020130	TA	3	6	77493	77498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_020130	ATAA	2	8	77500	77507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_020130	TAA	3	9	77505	77513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_020130	A	8	8	77547	77554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2133	NC_020130	GAA	2	6	77634	77639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2135	NC_020130	TAA	2	6	77692	77697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2138	NC_020130	GTA	2	6	77781	77786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_020130	ATA	2	6	77802	77807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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