MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 5701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020130	GT	3	6	57250	57255	0 %	50 %	50 %	0 %	442556569
1502	NC_020130	TGT	3	9	57338	57346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1503	NC_020130	TTG	2	6	57409	57414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1504	NC_020130	TGT	2	6	57422	57427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1505	NC_020130	AATT	2	8	57430	57437	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1506	NC_020130	CTTGTT	2	12	57438	57449	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442556569
1507	NC_020130	TGTA	2	8	57452	57459	25 %	50 %	25 %	0 %	442556569
1508	NC_020130	TTG	2	6	57460	57465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1509	NC_020130	ATA	2	6	57513	57518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556569
1510	NC_020130	TTA	2	6	57542	57547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556569
1511	NC_020130	ATA	2	6	57584	57589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556569
1512	NC_020130	AAAT	2	8	57609	57616	75 %	25 %	0 %	0 %	442556569
1513	NC_020130	AAT	2	6	57619	57624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556569
1514	NC_020130	TAG	2	6	57642	57647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556569
1515	NC_020130	T	6	6	57652	57657	0 %	100 %	0 %	0 %	442556569
1516	NC_020130	A	7	7	57663	57669	100 %	0 %	0 %	0 %	442556569
1517	NC_020130	T	6	6	57684	57689	0 %	100 %	0 %	0 %	442556569
1518	NC_020130	AT	7	14	57697	57710	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1519	NC_020130	AT	3	6	57721	57726	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1520	NC_020130	ATA	2	6	57738	57743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556569
1521	NC_020130	TA	3	6	57742	57747	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1522	NC_020130	ATT	2	6	57781	57786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020130	TAAA	2	8	57802	57809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020130	A	7	7	57807	57813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020130	ATA	2	6	57825	57830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020130	AAT	2	6	57860	57865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020130	TTA	2	6	57869	57874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020130	TAA	2	6	57894	57899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020130	TAA	2	6	57908	57913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020130	AAAGAA	2	12	57952	57963	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020130	GATG	2	8	57969	57976	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020130	CTA	2	6	57980	57985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_020130	ATAA	2	8	58029	58036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020130	TA	3	6	58078	58083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020130	ATA	2	6	58101	58106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020130	GAAAA	2	10	58107	58116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020130	ATAG	2	8	58119	58126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020130	A	6	6	58148	58153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_020130	A	6	6	58164	58169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020130	TTA	2	6	58186	58191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020130	ATA	2	6	58198	58203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020130	TTA	2	6	58234	58239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020130	A	6	6	58268	58273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020130	T	6	6	58280	58285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020130	ATT	2	6	58294	58299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020130	ATATT	2	10	58326	58335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020130	TGA	2	6	58344	58349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020130	TGT	2	6	58414	58419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020130	ATGA	2	8	58425	58432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020130	ATAA	2	8	58588	58595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020130	T	6	6	58599	58604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020130	GT	3	6	58612	58617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020130	T	6	6	58672	58677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020130	AT	3	6	58703	58708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020130	TA	3	6	58734	58739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020130	TAA	2	6	58765	58770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020130	A	6	6	58787	58792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020130	AAC	2	6	58837	58842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_020130	ATA	2	6	58867	58872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020130	AAT	2	6	58926	58931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020130	TAT	2	6	58946	58951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020130	T	7	7	59010	59016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020130	CTG	2	6	59029	59034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_020130	AGA	2	6	59036	59041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020130	TTTCT	2	10	59062	59071	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1566	NC_020130	TTAT	2	8	59082	59089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020130	TGA	2	6	59107	59112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020130	GTA	2	6	59160	59165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020130	AATA	2	8	59185	59192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020130	ACC	2	6	59209	59214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_020130	AGT	3	9	59270	59278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020130	T	6	6	59278	59283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020130	TGG	2	6	59300	59305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020130	ATG	2	6	59313	59318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020130	TTC	2	6	59347	59352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_020130	AGG	2	6	59357	59362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020130	TTC	3	9	59399	59407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_020130	CT	3	6	59429	59434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_020130	A	7	7	59441	59447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020130	TCC	2	6	59511	59516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_020130	TAC	2	6	59561	59566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_020130	GTT	2	6	59575	59580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020130	TTC	2	6	59585	59590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_020130	TATT	2	8	59627	59634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020130	TTC	2	6	59657	59662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_020130	AAG	2	6	59669	59674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020130	ATA	2	6	59731	59736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020130	T	6	6	59827	59832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020130	AGA	2	6	59846	59851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020130	TCAC	2	8	59877	59884	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_020130	GTT	2	6	59901	59906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020130	CCT	2	6	59979	59984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_020130	A	6	6	59989	59994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_020130	GGA	2	6	60018	60023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_020130	CTT	2	6	60060	60065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_020130	TAT	2	6	60106	60111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020130	ATA	2	6	60181	60186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020130	TAAAA	2	10	60193	60202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020130	TTA	2	6	60216	60221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020130	A	8	8	60221	60228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020130	CTTT	2	8	60252	60259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_020130	CTAA	2	8	60269	60276	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_020130	AAT	2	6	60280	60285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020130	AATA	2	8	60343	60350	75 %	25 %	0 %	0 %	442556570
1608	NC_020130	T	6	6	60393	60398	0 %	100 %	0 %	0 %	442556570
1609	NC_020130	CATT	2	8	60443	60450	25 %	50 %	0 %	25 %	442556570
1610	NC_020130	TCT	2	6	60485	60490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1611	NC_020130	ACC	2	6	60576	60581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556570
1612	NC_020130	T	6	6	60644	60649	0 %	100 %	0 %	0 %	442556570
1613	NC_020130	CA	3	6	60678	60683	50 %	0 %	0 %	50 %	442556570
1614	NC_020130	TG	3	6	60733	60738	0 %	50 %	50 %	0 %	442556570
1615	NC_020130	AT	3	6	60745	60750	50 %	50 %	0 %	0 %	442556570
1616	NC_020130	AACT	2	8	60758	60765	50 %	25 %	0 %	25 %	442556570
1617	NC_020130	TTC	2	6	60930	60935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1618	NC_020130	A	7	7	61158	61164	100 %	0 %	0 %	0 %	442556570
1619	NC_020130	ATA	2	6	61184	61189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556570
1620	NC_020130	CTTT	2	8	61225	61232	0 %	75 %	0 %	25 %	442556570
1621	NC_020130	T	6	6	61254	61259	0 %	100 %	0 %	0 %	442556570
1622	NC_020130	CTTT	2	8	61261	61268	0 %	75 %	0 %	25 %	442556570
1623	NC_020130	T	7	7	61286	61292	0 %	100 %	0 %	0 %	442556570
1624	NC_020130	GGT	2	6	61483	61488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556570
1625	NC_020130	GAA	3	9	61489	61497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556570
1626	NC_020130	ACT	2	6	61516	61521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556570
1627	NC_020130	TCA	2	6	61534	61539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556570
1628	NC_020130	TAG	2	6	61577	61582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556570
1629	NC_020130	CTT	2	6	61598	61603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1630	NC_020130	CTT	2	6	61619	61624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1631	NC_020130	GATG	2	8	61648	61655	25 %	25 %	50 %	0 %	442556570
1632	NC_020130	GAACCT	2	12	61690	61701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	442556570
1633	NC_020130	TCT	2	6	61702	61707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1634	NC_020130	AGA	2	6	61752	61757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556570
1635	NC_020130	CTT	2	6	61781	61786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1636	NC_020130	CTA	2	6	61804	61809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556570
1637	NC_020130	AGA	2	6	61845	61850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556570
1638	NC_020130	TTG	5	15	61854	61868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556570
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1653	NC_020130	TTC	2	6	62316	62321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
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1681	NC_020130	ATT	2	6	62996	63001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1764	NC_020130	TA	3	6	65225	65230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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