MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 5701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020130	GTT	2	6	19516	19521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556549
502	NC_020130	TGC	2	6	19525	19530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556549
503	NC_020130	TGA	2	6	19544	19549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556549
504	NC_020130	ACA	2	6	19557	19562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556549
505	NC_020130	GTA	2	6	19602	19607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556549
506	NC_020130	ATC	2	6	19628	19633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556549
507	NC_020130	ACA	2	6	19665	19670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556549
508	NC_020130	CTT	2	6	19687	19692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556549
509	NC_020130	CTTG	2	8	19732	19739	0 %	50 %	25 %	25 %	442556549
510	NC_020130	TTC	2	6	19745	19750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556549
511	NC_020130	CTT	2	6	19756	19761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556549
512	NC_020130	AGG	2	6	19769	19774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556549
513	NC_020130	GTT	2	6	19789	19794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556549
514	NC_020130	T	6	6	19801	19806	0 %	100 %	0 %	0 %	442556549
515	NC_020130	CTG	2	6	19840	19845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556549
516	NC_020130	TAT	2	6	19886	19891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556549
517	NC_020130	TGG	2	6	19926	19931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020130	CTT	2	6	19946	19951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020130	AAT	2	6	19960	19965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020130	ATAGA	2	10	19991	20000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020130	CTG	2	6	20024	20029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556550
522	NC_020130	TTGT	2	8	20049	20056	0 %	75 %	25 %	0 %	442556550
523	NC_020130	A	6	6	20094	20099	100 %	0 %	0 %	0 %	442556550
524	NC_020130	A	6	6	20103	20108	100 %	0 %	0 %	0 %	442556550
525	NC_020130	ACAA	2	8	20112	20119	75 %	0 %	0 %	25 %	442556550
526	NC_020130	AG	3	6	20197	20202	50 %	0 %	50 %	0 %	442556550
527	NC_020130	AAT	2	6	20217	20222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556550
528	NC_020130	CA	3	6	20249	20254	50 %	0 %	0 %	50 %	442556550
529	NC_020130	AGT	2	6	20303	20308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556550
530	NC_020130	TTA	2	6	20321	20326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556550
531	NC_020130	GTT	2	6	20341	20346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556550
532	NC_020130	ATAA	2	8	20347	20354	75 %	25 %	0 %	0 %	442556550
533	NC_020130	ATC	2	6	20359	20364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556550
534	NC_020130	GAT	2	6	20402	20407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556550
535	NC_020130	AT	3	6	20437	20442	50 %	50 %	0 %	0 %	442556550
536	NC_020130	AGT	2	6	20482	20487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556550
537	NC_020130	GTAA	2	8	20521	20528	50 %	25 %	25 %	0 %	442556550
538	NC_020130	AG	3	6	20556	20561	50 %	0 %	50 %	0 %	442556550
539	NC_020130	ATT	2	6	20706	20711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556550
540	NC_020130	CCA	2	6	20713	20718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556550
541	NC_020130	A	6	6	20724	20729	100 %	0 %	0 %	0 %	442556550
542	NC_020130	AG	4	8	20752	20759	50 %	0 %	50 %	0 %	442556550
543	NC_020130	TTGT	2	8	20760	20767	0 %	75 %	25 %	0 %	442556550
544	NC_020130	TAAA	2	8	20768	20775	75 %	25 %	0 %	0 %	442556550
545	NC_020130	A	6	6	20773	20778	100 %	0 %	0 %	0 %	442556550
546	NC_020130	AAT	2	6	20805	20810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556550
547	NC_020130	A	6	6	20816	20821	100 %	0 %	0 %	0 %	442556550
548	NC_020130	ATA	2	6	20825	20830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556550
549	NC_020130	ATAA	2	8	20901	20908	75 %	25 %	0 %	0 %	442556550
550	NC_020130	TAGA	2	8	20966	20973	50 %	25 %	25 %	0 %	442556550
551	NC_020130	TGC	2	6	20980	20985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556550
552	NC_020130	TAA	2	6	21084	21089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556551
553	NC_020130	GATA	2	8	21114	21121	50 %	25 %	25 %	0 %	442556551
554	NC_020130	ACA	2	6	21367	21372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556551
555	NC_020130	AAT	2	6	21433	21438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556551
556	NC_020130	TCA	2	6	21467	21472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556551
557	NC_020130	A	6	6	21474	21479	100 %	0 %	0 %	0 %	442556551
558	NC_020130	AAC	2	6	21505	21510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556551
559	NC_020130	T	6	6	21520	21525	0 %	100 %	0 %	0 %	442556551
560	NC_020130	TCCA	2	8	21640	21647	25 %	25 %	0 %	50 %	442556551
561	NC_020130	AAT	2	6	21709	21714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020130	ATTT	2	8	21741	21748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020130	TA	3	6	21799	21804	50 %	50 %	0 %	0 %	442556552
564	NC_020130	T	6	6	21859	21864	0 %	100 %	0 %	0 %	442556552
565	NC_020130	TGT	2	6	21908	21913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556552
566	NC_020130	TAT	2	6	21943	21948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556552
567	NC_020130	TGC	3	9	21979	21987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556552
568	NC_020130	A	6	6	21995	22000	100 %	0 %	0 %	0 %	442556552
569	NC_020130	TTTC	2	8	22013	22020	0 %	75 %	0 %	25 %	442556552
570	NC_020130	TTA	2	6	22115	22120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556552
571	NC_020130	T	6	6	22127	22132	0 %	100 %	0 %	0 %	442556552
572	NC_020130	A	7	7	22195	22201	100 %	0 %	0 %	0 %	442556552
573	NC_020130	CTT	2	6	22212	22217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556552
574	NC_020130	GAA	2	6	22248	22253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556552
575	NC_020130	TCT	2	6	22262	22267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556552
576	NC_020130	ATA	2	6	22303	22308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556552
577	NC_020130	A	6	6	22339	22344	100 %	0 %	0 %	0 %	442556552
578	NC_020130	CAG	2	6	22347	22352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556552
579	NC_020130	AAGT	2	8	22410	22417	50 %	25 %	25 %	0 %	442556553
580	NC_020130	AAC	2	6	22422	22427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556553
581	NC_020130	CTA	2	6	22469	22474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556553
582	NC_020130	ATG	2	6	22480	22485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556553
583	NC_020130	CTT	2	6	22556	22561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556553
584	NC_020130	T	7	7	22600	22606	0 %	100 %	0 %	0 %	442556553
585	NC_020130	CCA	2	6	22618	22623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556553
586	NC_020130	GAA	2	6	22687	22692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556553
587	NC_020130	CCAT	2	8	22695	22702	25 %	25 %	0 %	50 %	442556553
588	NC_020130	CAT	3	9	22700	22708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556553
589	NC_020130	TGT	2	6	22733	22738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556553
590	NC_020130	CCT	2	6	22810	22815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556553
591	NC_020130	A	6	6	22827	22832	100 %	0 %	0 %	0 %	442556553
592	NC_020130	TCC	2	6	22839	22844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556553
593	NC_020130	TTG	2	6	22868	22873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556553
594	NC_020130	TTG	2	6	22923	22928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556553
595	NC_020130	TA	3	6	22956	22961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020130	AGA	2	6	22998	23003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020130	AACTA	2	10	23018	23027	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
598	NC_020130	TAGT	2	8	23036	23043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020130	TAGC	2	8	23046	23053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_020130	CTA	2	6	23059	23064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_020130	GAT	2	6	23119	23124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020130	TA	3	6	23166	23171	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
603	NC_020130	TCT	2	6	23185	23190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556554
604	NC_020130	AAAAG	2	10	23205	23214	80 %	0 %	20 %	0 %	442556554
605	NC_020130	T	6	6	23217	23222	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
606	NC_020130	T	8	8	23278	23285	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
607	NC_020130	GATA	2	8	23374	23381	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
608	NC_020130	GT	3	6	23424	23429	0 %	50 %	50 %	0 %	442556554
609	NC_020130	ATT	2	6	23451	23456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556554
610	NC_020130	TAA	2	6	23457	23462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556554
611	NC_020130	AGC	2	6	23484	23489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556554
612	NC_020130	AAT	2	6	23581	23586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556554
613	NC_020130	GAA	2	6	23599	23604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556554
614	NC_020130	T	7	7	23652	23658	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
615	NC_020130	ATT	2	6	23661	23666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556554
616	NC_020130	T	6	6	23696	23701	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
617	NC_020130	TGGT	2	8	23748	23755	0 %	50 %	50 %	0 %	442556554
618	NC_020130	ACA	2	6	23791	23796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556554
619	NC_020130	AT	3	6	23837	23842	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
620	NC_020130	TTG	2	6	23858	23863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556554
621	NC_020130	TCA	2	6	23867	23872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556554
622	NC_020130	TAAT	2	8	23914	23921	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
623	NC_020130	CAG	2	6	24002	24007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556554
624	NC_020130	TAAA	2	8	24106	24113	75 %	25 %	0 %	0 %	442556554
625	NC_020130	TCC	2	6	24162	24167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556554
626	NC_020130	CAA	2	6	24182	24187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556554
627	NC_020130	TTG	2	6	24216	24221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556554
628	NC_020130	T	6	6	24229	24234	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
629	NC_020130	T	8	8	24295	24302	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
630	NC_020130	AAG	2	6	24333	24338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556554
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632	NC_020130	GA	3	6	24470	24475	50 %	0 %	50 %	0 %	442556554
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