MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020129	A	7	7	32	38	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020129	A	6	6	113	118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020129	A	7	7	295	301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020129	A	6	6	1057	1062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020129	T	6	6	1080	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020129	A	6	6	1159	1164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020129	A	7	7	1342	1348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020129	A	6	6	1391	1396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020129	A	7	7	1641	1647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020129	A	6	6	1922	1927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020129	A	8	8	2017	2024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020129	A	6	6	2121	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020129	A	6	6	2265	2270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020129	A	6	6	2536	2541	100 %	0 %	0 %	0 %	442556511
15	NC_020129	T	6	6	2542	2547	0 %	100 %	0 %	0 %	442556511
16	NC_020129	T	6	6	2756	2761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020129	A	7	7	3452	3458	100 %	0 %	0 %	0 %	442556512
18	NC_020129	T	6	6	3670	3675	0 %	100 %	0 %	0 %	442556512
19	NC_020129	A	8	8	3718	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	442556512
20	NC_020129	T	7	7	3906	3912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020129	T	6	6	3957	3962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020129	A	6	6	4001	4006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020129	A	6	6	4023	4028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020129	A	6	6	4045	4050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020129	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020129	A	6	6	4087	4092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020129	T	6	6	4131	4136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020129	T	6	6	4150	4155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020129	A	6	6	4236	4241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020129	A	6	6	4355	4360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020129	T	8	8	4469	4476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020129	T	6	6	5687	5692	0 %	100 %	0 %	0 %	442556513
33	NC_020129	T	7	7	7240	7246	0 %	100 %	0 %	0 %	442556513
34	NC_020129	A	7	7	7747	7753	100 %	0 %	0 %	0 %	442556513
35	NC_020129	A	6	6	7801	7806	100 %	0 %	0 %	0 %	442556513
36	NC_020129	T	6	6	7824	7829	0 %	100 %	0 %	0 %	442556513
37	NC_020129	A	6	6	7846	7851	100 %	0 %	0 %	0 %	442556513
38	NC_020129	T	6	6	7928	7933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020129	T	6	6	7988	7993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020129	T	9	9	8019	8027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020129	A	6	6	8286	8291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020129	T	6	6	8420	8425	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
43	NC_020129	T	6	6	8806	8811	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
44	NC_020129	T	6	6	8883	8888	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
45	NC_020129	A	6	6	9120	9125	100 %	0 %	0 %	0 %	442556514
46	NC_020129	T	8	8	9312	9319	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
47	NC_020129	C	6	6	9345	9350	0 %	0 %	0 %	100 %	442556514
48	NC_020129	A	7	7	9443	9449	100 %	0 %	0 %	0 %	442556514
49	NC_020129	T	7	7	9483	9489	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
50	NC_020129	A	8	8	9492	9499	100 %	0 %	0 %	0 %	442556514
51	NC_020129	A	6	6	9604	9609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020129	A	6	6	9620	9625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020129	T	7	7	9677	9683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020129	T	6	6	9970	9975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020129	A	7	7	10040	10046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020129	A	7	7	10074	10080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020129	A	6	6	10125	10130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020129	T	7	7	10354	10360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020129	T	6	6	10450	10455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020129	T	6	6	10857	10862	0 %	100 %	0 %	0 %	442556515
61	NC_020129	A	6	6	10961	10966	100 %	0 %	0 %	0 %	442556515
62	NC_020129	A	6	6	10998	11003	100 %	0 %	0 %	0 %	442556515
63	NC_020129	T	6	6	11248	11253	0 %	100 %	0 %	0 %	442556515
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65	NC_020129	T	7	7	12626	12632	0 %	100 %	0 %	0 %	442556515
66	NC_020129	T	7	7	12724	12730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_020129	A	6	6	15102	15107	100 %	0 %	0 %	0 %	442556517
71	NC_020129	A	6	6	15244	15249	100 %	0 %	0 %	0 %	442556517
72	NC_020129	T	7	7	15260	15266	0 %	100 %	0 %	0 %	442556517
73	NC_020129	T	8	8	15328	15335	0 %	100 %	0 %	0 %	442556517
74	NC_020129	A	7	7	15359	15365	100 %	0 %	0 %	0 %	442556517
75	NC_020129	A	7	7	15699	15705	100 %	0 %	0 %	0 %	442556518
76	NC_020129	T	7	7	15897	15903	0 %	100 %	0 %	0 %	442556518
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80	NC_020129	T	6	6	16451	16456	0 %	100 %	0 %	0 %	442556518
81	NC_020129	A	6	6	16457	16462	100 %	0 %	0 %	0 %	442556518
82	NC_020129	T	8	8	16472	16479	0 %	100 %	0 %	0 %	442556518
83	NC_020129	T	6	6	16997	17002	0 %	100 %	0 %	0 %	442556519
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90	NC_020129	T	6	6	19332	19337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020129	A	7	7	19747	19753	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
92	NC_020129	A	7	7	19992	19998	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
93	NC_020129	A	6	6	20062	20067	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
94	NC_020129	T	7	7	20090	20096	0 %	100 %	0 %	0 %	442556522
95	NC_020129	A	6	6	20390	20395	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
96	NC_020129	T	6	6	20505	20510	0 %	100 %	0 %	0 %	442556522
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100	NC_020129	A	6	6	22510	22515	100 %	0 %	0 %	0 %	442556524
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102	NC_020129	A	8	8	22956	22963	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
103	NC_020129	A	6	6	23180	23185	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
104	NC_020129	A	6	6	23394	23399	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
105	NC_020129	A	6	6	23462	23467	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
106	NC_020129	A	6	6	23505	23510	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
107	NC_020129	A	6	6	23621	23626	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
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110	NC_020129	A	6	6	24997	25002	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
111	NC_020129	A	6	6	25160	25165	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
112	NC_020129	A	6	6	25230	25235	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
113	NC_020129	A	6	6	25670	25675	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
114	NC_020129	A	7	7	25841	25847	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
115	NC_020129	A	6	6	26057	26062	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
116	NC_020129	A	6	6	26158	26163	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
117	NC_020129	A	7	7	26197	26203	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
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119	NC_020129	T	7	7	26624	26630	0 %	100 %	0 %	0 %	442556528
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121	NC_020129	A	7	7	27176	27182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020129	G	6	6	27243	27248	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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126	NC_020129	A	6	6	28164	28169	100 %	0 %	0 %	0 %	442556529
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133	NC_020129	A	6	6	29214	29219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_020129	A	6	6	29288	29293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.