MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020129	AT	3	6	5	10	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020129	AT	3	6	127	132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020129	AT	3	6	319	324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020129	TA	3	6	1126	1131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020129	AT	3	6	1245	1250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020129	TA	3	6	1326	1331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020129	AT	3	6	1571	1576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020129	AT	3	6	1628	1633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020129	TA	3	6	2145	2150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020129	CT	3	6	2321	2326	0 %	50 %	0 %	50 %	442556511
11	NC_020129	AC	3	6	2710	2715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020129	AT	3	6	2794	2799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020129	TA	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020129	TA	3	6	3621	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	442556512
15	NC_020129	TA	3	6	3918	3923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020129	TA	4	8	4120	4127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020129	AT	3	6	4544	4549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020129	TA	4	8	4608	4615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020129	TA	4	8	4675	4682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020129	TA	3	6	4725	4730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020129	TA	3	6	4993	4998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020129	TA	3	6	5048	5053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020129	GT	3	6	5090	5095	0 %	50 %	50 %	0 %	442556513
24	NC_020129	AT	3	6	5157	5162	50 %	50 %	0 %	0 %	442556513
25	NC_020129	AT	3	6	5193	5198	50 %	50 %	0 %	0 %	442556513
26	NC_020129	AT	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	442556513
27	NC_020129	GA	3	6	6117	6122	50 %	0 %	50 %	0 %	442556513
28	NC_020129	GT	3	6	6960	6965	0 %	50 %	50 %	0 %	442556513
29	NC_020129	TA	3	6	7978	7983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020129	AT	4	8	8051	8058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020129	AT	3	6	8076	8081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020129	TA	3	6	8130	8135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020129	AT	3	6	9239	9244	50 %	50 %	0 %	0 %	442556514
34	NC_020129	AT	3	6	9943	9948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020129	AT	4	8	10470	10477	50 %	50 %	0 %	0 %	442556515
36	NC_020129	TA	4	8	12467	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	442556515
37	NC_020129	TC	3	6	12524	12529	0 %	50 %	0 %	50 %	442556515
38	NC_020129	AT	3	6	12674	12679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020129	TG	3	6	13252	13257	0 %	50 %	50 %	0 %	442556516
40	NC_020129	AT	3	6	13375	13380	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
41	NC_020129	AT	3	6	13839	13844	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
42	NC_020129	AT	3	6	14089	14094	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
43	NC_020129	TA	3	6	14310	14315	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
44	NC_020129	TA	3	6	14470	14475	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
45	NC_020129	CA	3	6	14686	14691	50 %	0 %	0 %	50 %	442556516
46	NC_020129	AT	3	6	14943	14948	50 %	50 %	0 %	0 %	442556517
47	NC_020129	AT	3	6	15232	15237	50 %	50 %	0 %	0 %	442556517
48	NC_020129	AT	7	14	16240	16253	50 %	50 %	0 %	0 %	442556518
49	NC_020129	AT	3	6	16341	16346	50 %	50 %	0 %	0 %	442556518
50	NC_020129	AT	3	6	17343	17348	50 %	50 %	0 %	0 %	442556519
51	NC_020129	TA	3	6	17512	17517	50 %	50 %	0 %	0 %	442556519
52	NC_020129	TG	3	6	17543	17548	0 %	50 %	50 %	0 %	442556519
53	NC_020129	TA	3	6	17614	17619	50 %	50 %	0 %	0 %	442556519
54	NC_020129	TA	3	6	18593	18598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020129	AT	3	6	18610	18615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020129	TA	3	6	18784	18789	50 %	50 %	0 %	0 %	442556521
57	NC_020129	TA	3	6	19320	19325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020129	AT	3	6	19614	19619	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
59	NC_020129	AT	3	6	19676	19681	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
60	NC_020129	CA	3	6	20150	20155	50 %	0 %	0 %	50 %	442556522
61	NC_020129	AT	3	6	20170	20175	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
62	NC_020129	TA	3	6	20599	20604	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
63	NC_020129	AC	3	6	20703	20708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020129	AT	3	6	20731	20736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020129	CA	3	6	20813	20818	50 %	0 %	0 %	50 %	442556523
66	NC_020129	CT	3	6	21195	21200	0 %	50 %	0 %	50 %	442556523
67	NC_020129	AT	4	8	21218	21225	50 %	50 %	0 %	0 %	442556523
68	NC_020129	TA	3	6	22523	22528	50 %	50 %	0 %	0 %	442556524
69	NC_020129	TC	3	6	22632	22637	0 %	50 %	0 %	50 %	442556525
70	NC_020129	TC	3	6	23828	23833	0 %	50 %	0 %	50 %	442556526
71	NC_020129	TA	7	14	24909	24922	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
72	NC_020129	TA	3	6	24980	24985	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
73	NC_020129	TA	3	6	25152	25157	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
74	NC_020129	AT	3	6	25350	25355	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
75	NC_020129	AT	3	6	25488	25493	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
76	NC_020129	TC	3	6	25572	25577	0 %	50 %	0 %	50 %	442556527
77	NC_020129	AT	7	14	26527	26540	50 %	50 %	0 %	0 %	442556528
78	NC_020129	AT	4	8	26921	26928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020129	TA	3	6	26990	26995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020129	AT	3	6	27205	27210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020129	AT	3	6	27455	27460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020129	AT	3	6	27495	27500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020129	AT	3	6	27577	27582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020129	TA	3	6	27841	27846	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
85	NC_020129	TA	4	8	28282	28289	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
86	NC_020129	TA	3	6	28467	28472	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
87	NC_020129	AC	3	6	28522	28527	50 %	0 %	0 %	50 %	442556529
88	NC_020129	TA	4	8	28672	28679	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
89	NC_020129	TA	4	8	29032	29039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020129	TA	3	6	29359	29364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020129	AT	4	8	29405	29412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020129	AT	3	6	29557	29562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020129	TA	3	6	29613	29618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020129	AT	3	6	29812	29817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020129	TA	3	6	29867	29872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020129	AT	3	6	29875	29880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020129	TA	3	6	29920	29925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020129	TA	3	6	30119	30124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020129	TA	3	6	30154	30159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020129	AT	3	6	31959	31964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020129	AT	3	6	32861	32866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020129	AG	3	6	32931	32936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020129	TA	3	6	33284	33289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020129	AT	3	6	33356	33361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020129	AT	3	6	33373	33378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020129	TA	3	6	33543	33548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020129	TA	3	6	33694	33699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020129	AT	6	12	33762	33773	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
109	NC_020129	GA	3	6	34513	34518	50 %	0 %	50 %	0 %	442556531
110	NC_020129	TC	4	8	35779	35786	0 %	50 %	0 %	50 %	442556531
111	NC_020129	TC	3	6	35886	35891	0 %	50 %	0 %	50 %	442556531
112	NC_020129	AT	3	6	35934	35939	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
113	NC_020129	AT	3	6	36034	36039	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
114	NC_020129	CT	3	6	36042	36047	0 %	50 %	0 %	50 %	442556531
115	NC_020129	AT	3	6	36099	36104	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
116	NC_020129	AT	3	6	36284	36289	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
117	NC_020129	TA	7	14	36548	36561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020129	TA	3	6	37468	37473	50 %	50 %	0 %	0 %	442556532
119	NC_020129	TA	3	6	38121	38126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020129	AT	3	6	38220	38225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020129	AT	3	6	38240	38245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020129	AT	3	6	38250	38255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020129	AT	3	6	38350	38355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020129	AT	4	8	38563	38570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020129	TA	4	8	38643	38650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020129	AT	3	6	38696	38701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020129	AT	3	6	39383	39388	50 %	50 %	0 %	0 %	442556533
128	NC_020129	AT	3	6	39794	39799	50 %	50 %	0 %	0 %	442556534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.