MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 1218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020129	TGT	2	6	17473	17478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556519
502	NC_020129	AAG	2	6	17481	17486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556519
503	NC_020129	TA	3	6	17512	17517	50 %	50 %	0 %	0 %	442556519
504	NC_020129	TG	3	6	17543	17548	0 %	50 %	50 %	0 %	442556519
505	NC_020129	T	8	8	17594	17601	0 %	100 %	0 %	0 %	442556519
506	NC_020129	TA	3	6	17614	17619	50 %	50 %	0 %	0 %	442556519
507	NC_020129	GTT	2	6	17675	17680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556520
508	NC_020129	TAT	2	6	17795	17800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556520
509	NC_020129	CAA	2	6	17815	17820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556520
510	NC_020129	CGT	2	6	17869	17874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556520
511	NC_020129	GTTG	2	8	17965	17972	0 %	50 %	50 %	0 %	442556520
512	NC_020129	TTC	2	6	18006	18011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556520
513	NC_020129	CAG	2	6	18092	18097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556520
514	NC_020129	TAC	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556520
515	NC_020129	TTC	2	6	18126	18131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556520
516	NC_020129	ATT	2	6	18156	18161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556520
517	NC_020129	ATA	2	6	18166	18171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556520
518	NC_020129	A	6	6	18235	18240	100 %	0 %	0 %	0 %	442556520
519	NC_020129	AAG	2	6	18255	18260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556520
520	NC_020129	TAA	2	6	18282	18287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556520
521	NC_020129	TGT	2	6	18297	18302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556520
522	NC_020129	GTA	2	6	18341	18346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556520
523	NC_020129	CAC	2	6	18377	18382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556520
524	NC_020129	GAAA	2	8	18383	18390	75 %	0 %	25 %	0 %	442556520
525	NC_020129	ACT	2	6	18394	18399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556520
526	NC_020129	ATG	2	6	18480	18485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556520
527	NC_020129	AAT	2	6	18515	18520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556520
528	NC_020129	AGA	2	6	18552	18557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556520
529	NC_020129	CCT	2	6	18576	18581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_020129	TTA	2	6	18584	18589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020129	TA	3	6	18593	18598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020129	AT	3	6	18610	18615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020129	TTAT	2	8	18624	18631	25 %	75 %	0 %	0 %	442556521
534	NC_020129	ACA	2	6	18695	18700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556521
535	NC_020129	TCC	2	6	18739	18744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556521
536	NC_020129	TA	3	6	18784	18789	50 %	50 %	0 %	0 %	442556521
537	NC_020129	TAT	2	6	18838	18843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556521
538	NC_020129	TAT	2	6	18846	18851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556521
539	NC_020129	GTA	2	6	18870	18875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556521
540	NC_020129	GTT	2	6	18896	18901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556521
541	NC_020129	CAA	2	6	18921	18926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556521
542	NC_020129	ATT	2	6	18947	18952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556521
543	NC_020129	TAA	2	6	18981	18986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556521
544	NC_020129	TGA	2	6	18998	19003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556521
545	NC_020129	GAA	2	6	19016	19021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556521
546	NC_020129	TTTTGT	2	12	19031	19042	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	442556521
547	NC_020129	T	6	6	19049	19054	0 %	100 %	0 %	0 %	442556521
548	NC_020129	A	6	6	19075	19080	100 %	0 %	0 %	0 %	442556521
549	NC_020129	ATC	2	6	19162	19167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556521
550	NC_020129	AGAT	2	8	19183	19190	50 %	25 %	25 %	0 %	442556521
551	NC_020129	ATA	3	9	19259	19267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556521
552	NC_020129	ATA	2	6	19277	19282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556521
553	NC_020129	AAG	2	6	19298	19303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020129	TA	3	6	19320	19325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020129	T	6	6	19332	19337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020129	TACAT	2	10	19342	19351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
557	NC_020129	TAT	2	6	19355	19360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020129	ATA	2	6	19374	19379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020129	ATAAA	2	10	19384	19393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020129	GGA	2	6	19398	19403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020129	AGA	2	6	19440	19445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556522
562	NC_020129	TGT	2	6	19509	19514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556522
563	NC_020129	ATC	2	6	19565	19570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556522
564	NC_020129	CAC	2	6	19574	19579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556522
565	NC_020129	AT	3	6	19614	19619	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
566	NC_020129	TTA	2	6	19637	19642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556522
567	NC_020129	AT	3	6	19676	19681	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
568	NC_020129	ATT	2	6	19712	19717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556522
569	NC_020129	A	7	7	19747	19753	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
570	NC_020129	TTTTTG	2	12	19757	19768	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	442556522
571	NC_020129	GGA	2	6	19787	19792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556522
572	NC_020129	ACA	2	6	19815	19820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556522
573	NC_020129	CCT	2	6	19837	19842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556522
574	NC_020129	ATG	2	6	19850	19855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556522
575	NC_020129	AAC	3	9	19859	19867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556522
576	NC_020129	GATT	2	8	19886	19893	25 %	50 %	25 %	0 %	442556522
577	NC_020129	CAGG	2	8	19936	19943	25 %	0 %	50 %	25 %	442556522
578	NC_020129	ATT	2	6	19967	19972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556522
579	NC_020129	A	7	7	19992	19998	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
580	NC_020129	TAA	2	6	20007	20012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556522
581	NC_020129	AAAAT	2	10	20018	20027	80 %	20 %	0 %	0 %	442556522
582	NC_020129	TAC	2	6	20036	20041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556522
583	NC_020129	A	6	6	20062	20067	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
584	NC_020129	TGATA	2	10	20073	20082	40 %	40 %	20 %	0 %	442556522
585	NC_020129	T	7	7	20090	20096	0 %	100 %	0 %	0 %	442556522
586	NC_020129	GTT	2	6	20134	20139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556522
587	NC_020129	CA	3	6	20150	20155	50 %	0 %	0 %	50 %	442556522
588	NC_020129	AT	3	6	20170	20175	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
589	NC_020129	AAG	2	6	20177	20182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556522
590	NC_020129	AGG	2	6	20217	20222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556522
591	NC_020129	GTT	3	9	20257	20265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556522
592	NC_020129	AGA	2	6	20280	20285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556522
593	NC_020129	ATT	2	6	20295	20300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556522
594	NC_020129	CATT	2	8	20329	20336	25 %	50 %	0 %	25 %	442556522
595	NC_020129	A	6	6	20390	20395	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
596	NC_020129	TAC	2	6	20478	20483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556522
597	NC_020129	T	6	6	20505	20510	0 %	100 %	0 %	0 %	442556522
598	NC_020129	AGAAA	2	10	20529	20538	80 %	0 %	20 %	0 %	442556522
599	NC_020129	TA	3	6	20599	20604	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
600	NC_020129	T	6	6	20630	20635	0 %	100 %	0 %	0 %	442556522
601	NC_020129	GTTAT	2	10	20664	20673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020129	AC	3	6	20703	20708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_020129	TCA	2	6	20719	20724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_020129	AT	3	6	20731	20736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020129	AAG	2	6	20791	20796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020129	CA	3	6	20813	20818	50 %	0 %	0 %	50 %	442556523
607	NC_020129	AAT	2	6	20851	20856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556523
608	NC_020129	ACT	2	6	20893	20898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556523
609	NC_020129	GACT	2	8	20907	20914	25 %	25 %	25 %	25 %	442556523
610	NC_020129	CTT	2	6	20933	20938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556523
611	NC_020129	TAA	2	6	20939	20944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556523
612	NC_020129	GGA	2	6	20999	21004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556523
613	NC_020129	TAA	2	6	21033	21038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556523
614	NC_020129	AAAT	2	8	21062	21069	75 %	25 %	0 %	0 %	442556523
615	NC_020129	TGC	2	6	21078	21083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556523
616	NC_020129	ATA	2	6	21158	21163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556523
617	NC_020129	ACA	2	6	21168	21173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556523
618	NC_020129	TTA	2	6	21179	21184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556523
619	NC_020129	CT	3	6	21195	21200	0 %	50 %	0 %	50 %	442556523
620	NC_020129	AT	4	8	21218	21225	50 %	50 %	0 %	0 %	442556523
621	NC_020129	T	6	6	21228	21233	0 %	100 %	0 %	0 %	442556523
622	NC_020129	G	13	13	21249	21261	0 %	0 %	100 %	0 %	442556523
623	NC_020129	AGC	2	6	21294	21299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556523
624	NC_020129	TTAT	2	8	21302	21309	25 %	75 %	0 %	0 %	442556523
625	NC_020129	TGC	2	6	21366	21371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556523
626	NC_020129	TAG	2	6	21410	21415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556523
627	NC_020129	TTA	2	6	21422	21427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556523
628	NC_020129	GTCTT	2	10	21488	21497	0 %	60 %	20 %	20 %	442556523
629	NC_020129	CAA	3	9	21511	21519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556523
630	NC_020129	GAT	2	6	21532	21537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556523
631	NC_020129	TAT	2	6	21545	21550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556523
632	NC_020129	ATA	2	6	21551	21556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556523
633	NC_020129	TAT	2	6	21557	21562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556523
634	NC_020129	TTCC	2	8	21569	21576	0 %	50 %	0 %	50 %	442556523
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