MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1

Total Repeats: 837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020128	A	7	7	6	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020128	AAC	2	6	80	85	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020128	GAA	2	6	213	218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020128	TTTA	2	8	258	265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020128	TAT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020128	TCA	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020128	AT	3	6	297	302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020128	AT	3	6	320	325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020128	AAT	2	6	386	391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556481
10	NC_020128	ATTA	2	8	457	464	50 %	50 %	0 %	0 %	442556481
11	NC_020128	T	6	6	491	496	0 %	100 %	0 %	0 %	442556481
12	NC_020128	TAC	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556481
13	NC_020128	ATG	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556481
14	NC_020128	TGTTA	2	10	546	555	20 %	60 %	20 %	0 %	442556481
15	NC_020128	A	6	6	566	571	100 %	0 %	0 %	0 %	442556481
16	NC_020128	AAT	2	6	592	597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556481
17	NC_020128	T	7	7	664	670	0 %	100 %	0 %	0 %	442556481
18	NC_020128	AT	3	6	733	738	50 %	50 %	0 %	0 %	442556481
19	NC_020128	TTA	2	6	832	837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556481
20	NC_020128	CCT	2	6	851	856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556481
21	NC_020128	TGA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556481
22	NC_020128	CAC	2	6	891	896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556481
23	NC_020128	TTAG	2	8	902	909	25 %	50 %	25 %	0 %	442556481
24	NC_020128	GTG	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556481
25	NC_020128	A	8	8	1022	1029	100 %	0 %	0 %	0 %	442556481
26	NC_020128	T	8	8	1078	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	442556481
27	NC_020128	GAA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556481
28	NC_020128	TTA	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556481
29	NC_020128	A	6	6	1186	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	442556481
30	NC_020128	TCG	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556481
31	NC_020128	ATT	2	6	1288	1293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556481
32	NC_020128	TTC	2	6	1300	1305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556481
33	NC_020128	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556481
34	NC_020128	CTTC	2	8	1373	1380	0 %	50 %	0 %	50 %	442556481
35	NC_020128	TAT	2	6	1474	1479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020128	AGT	2	6	1548	1553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020128	AT	3	6	1657	1662	50 %	50 %	0 %	0 %	442556482
38	NC_020128	TAT	2	6	1696	1701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556482
39	NC_020128	TTATA	2	10	1813	1822	40 %	60 %	0 %	0 %	442556482
40	NC_020128	T	6	6	1855	1860	0 %	100 %	0 %	0 %	442556482
41	NC_020128	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020128	AT	3	6	2028	2033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020128	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020128	ATA	2	6	2096	2101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020128	TGA	2	6	2105	2110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020128	ATT	2	6	2126	2131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020128	TAA	2	6	2143	2148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020128	AT	3	6	2151	2156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020128	AGA	2	6	2167	2172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020128	ATAA	2	8	2184	2191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020128	TA	3	6	2215	2220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020128	T	7	7	2251	2257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020128	GAA	2	6	2280	2285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020128	ATA	2	6	2294	2299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020128	ATCA	2	8	2302	2309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020128	AAC	2	6	2320	2325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020128	AAG	2	6	2376	2381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020128	GAAA	2	8	2456	2463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020128	T	9	9	2468	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020128	CTTT	2	8	2526	2533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020128	AT	3	6	2539	2544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020128	TCC	2	6	2546	2551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_020128	GTAA	2	8	2562	2569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020128	AGA	2	6	2595	2600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020128	AGA	2	6	2615	2620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556483
66	NC_020128	TAT	2	6	2642	2647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556483
67	NC_020128	TGT	2	6	2656	2661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556483
68	NC_020128	GAA	2	6	2685	2690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556483
69	NC_020128	AGCA	2	8	2767	2774	50 %	0 %	25 %	25 %	442556483
70	NC_020128	T	6	6	2864	2869	0 %	100 %	0 %	0 %	442556483
71	NC_020128	A	6	6	2875	2880	100 %	0 %	0 %	0 %	442556483
72	NC_020128	TCT	2	6	2917	2922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556483
73	NC_020128	AGA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020128	AT	3	6	3049	3054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020128	TAT	2	6	3063	3068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020128	TGG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020128	A	6	6	3141	3146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020128	TAA	2	6	3200	3205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020128	TTG	2	6	3230	3235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020128	ATA	2	6	3264	3269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020128	T	6	6	3290	3295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020128	TAAA	2	8	3301	3308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020128	ACC	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_020128	GGTA	2	8	3331	3338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020128	T	6	6	3367	3372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020128	AAAT	2	8	3396	3403	75 %	25 %	0 %	0 %	442556484
87	NC_020128	GTT	2	6	3450	3455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556484
88	NC_020128	T	6	6	3472	3477	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
89	NC_020128	AGA	2	6	3521	3526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556484
90	NC_020128	TTC	2	6	3531	3536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556484
91	NC_020128	AGC	2	6	3564	3569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556484
92	NC_020128	TC	3	6	3774	3779	0 %	50 %	0 %	50 %	442556484
93	NC_020128	A	7	7	3825	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
94	NC_020128	AGAT	2	8	3875	3882	50 %	25 %	25 %	0 %	442556484
95	NC_020128	AT	3	6	3886	3891	50 %	50 %	0 %	0 %	442556484
96	NC_020128	TC	3	6	3961	3966	0 %	50 %	0 %	50 %	442556484
97	NC_020128	CAA	2	6	3967	3972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556484
98	NC_020128	A	6	6	4030	4035	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
99	NC_020128	GTAA	2	8	4045	4052	50 %	25 %	25 %	0 %	442556484
100	NC_020128	ATA	2	6	4059	4064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
101	NC_020128	T	6	6	4065	4070	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
102	NC_020128	T	6	6	4078	4083	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
103	NC_020128	AT	3	6	4084	4089	50 %	50 %	0 %	0 %	442556484
104	NC_020128	TAAAA	2	10	4101	4110	80 %	20 %	0 %	0 %	442556484
105	NC_020128	AAT	2	6	4111	4116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
106	NC_020128	TAC	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556484
107	NC_020128	ATAAC	2	10	4177	4186	60 %	20 %	0 %	20 %	442556484
108	NC_020128	T	6	6	4189	4194	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
109	NC_020128	ATA	2	6	4204	4209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
110	NC_020128	A	6	6	4215	4220	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
111	NC_020128	ATA	2	6	4239	4244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
112	NC_020128	AAT	2	6	4320	4325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
113	NC_020128	GAA	2	6	4348	4353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556484
114	NC_020128	GCA	2	6	4366	4371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556484
115	NC_020128	AGAA	2	8	4374	4381	75 %	0 %	25 %	0 %	442556484
116	NC_020128	TCTT	2	8	4399	4406	0 %	75 %	0 %	25 %	442556484
117	NC_020128	TAA	2	6	4418	4423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
118	NC_020128	TAA	2	6	4533	4538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
119	NC_020128	AGT	2	6	4546	4551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556484
120	NC_020128	A	6	6	4552	4557	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
121	NC_020128	GTG	2	6	4574	4579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556484
122	NC_020128	GAAG	2	8	4592	4599	50 %	0 %	50 %	0 %	442556484
123	NC_020128	TTG	2	6	4637	4642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556484
124	NC_020128	GA	3	6	4655	4660	50 %	0 %	50 %	0 %	442556484
125	NC_020128	CAG	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556484
126	NC_020128	AAT	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
127	NC_020128	TCTG	2	8	4768	4775	0 %	50 %	25 %	25 %	442556484
128	NC_020128	TTA	2	6	4799	4804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556484
129	NC_020128	CAA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556484
130	NC_020128	CAT	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556484
131	NC_020128	TAA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
132	NC_020128	A	6	6	4879	4884	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
133	NC_020128	TATTTT	2	12	4920	4931	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442556484
134	NC_020128	T	7	7	4951	4957	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
135	NC_020128	TTG	2	6	4959	4964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556484
136	NC_020128	T	6	6	4965	4970	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
137	NC_020128	A	7	7	4990	4996	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
138	NC_020128	ATA	2	6	5003	5008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
139	NC_020128	TA	3	6	5041	5046	50 %	50 %	0 %	0 %	442556484
140	NC_020128	ATA	2	6	5053	5058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556484
141	NC_020128	TATT	2	8	5086	5093	25 %	75 %	0 %	0 %	442556484
142	NC_020128	ATT	2	6	5109	5114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556484
143	NC_020128	AGT	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556484
144	NC_020128	TGT	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556484
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159	NC_020128	TA	3	6	5419	5424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_020128	A	6	6	9356	9361	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
279	NC_020128	AGAA	2	8	9484	9491	75 %	0 %	25 %	0 %	442556488
280	NC_020128	A	6	6	9493	9498	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
281	NC_020128	T	7	7	9499	9505	0 %	100 %	0 %	0 %	442556488
282	NC_020128	A	8	8	9523	9530	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
283	NC_020128	AG	3	6	9543	9548	50 %	0 %	50 %	0 %	442556488
284	NC_020128	ACC	2	6	9610	9615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556488
285	NC_020128	T	8	8	9640	9647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_020128	TTA	2	6	9678	9683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556489
287	NC_020128	TA	4	8	9690	9697	50 %	50 %	0 %	0 %	442556489
288	NC_020128	AT	3	6	9723	9728	50 %	50 %	0 %	0 %	442556489
289	NC_020128	T	8	8	9771	9778	0 %	100 %	0 %	0 %	442556489
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387	NC_020128	TAAA	2	8	13070	13077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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