MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1

Total Repeats: 837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020128	AT	3	6	16218	16223	50 %	50 %	0 %	0 %	442556495
502	NC_020128	AT	3	6	16288	16293	50 %	50 %	0 %	0 %	442556495
503	NC_020128	TATC	2	8	16297	16304	25 %	50 %	0 %	25 %	442556495
504	NC_020128	TCT	2	6	16323	16328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556495
505	NC_020128	TAA	2	6	16560	16565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556495
506	NC_020128	TTC	2	6	16724	16729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556495
507	NC_020128	ATC	2	6	16781	16786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556495
508	NC_020128	AT	3	6	16827	16832	50 %	50 %	0 %	0 %	442556495
509	NC_020128	AAG	2	6	16908	16913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556495
510	NC_020128	A	7	7	16973	16979	100 %	0 %	0 %	0 %	442556495
511	NC_020128	T	6	6	17000	17005	0 %	100 %	0 %	0 %	442556495
512	NC_020128	AAGG	2	8	17023	17030	50 %	0 %	50 %	0 %	442556495
513	NC_020128	TA	3	6	17069	17074	50 %	50 %	0 %	0 %	442556495
514	NC_020128	TTC	2	6	17075	17080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556495
515	NC_020128	CAA	2	6	17242	17247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556495
516	NC_020128	AACAA	2	10	17252	17261	80 %	0 %	0 %	20 %	442556495
517	NC_020128	TCT	2	6	17355	17360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556495
518	NC_020128	AGTAA	2	10	17361	17370	60 %	20 %	20 %	0 %	442556495
519	NC_020128	CAG	2	6	17395	17400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556495
520	NC_020128	CAT	2	6	17419	17424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556495
521	NC_020128	ATA	2	6	17471	17476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556495
522	NC_020128	GGA	2	6	17538	17543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556495
523	NC_020128	A	8	8	17547	17554	100 %	0 %	0 %	0 %	442556495
524	NC_020128	TTTTAA	2	12	17573	17584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020128	TCT	2	6	17594	17599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556496
526	NC_020128	AACTCC	2	12	17637	17648	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	442556496
527	NC_020128	A	8	8	17674	17681	100 %	0 %	0 %	0 %	442556496
528	NC_020128	CCA	2	6	17689	17694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556496
529	NC_020128	TAA	3	9	17757	17765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556496
530	NC_020128	A	6	6	17769	17774	100 %	0 %	0 %	0 %	442556496
531	NC_020128	ATC	2	6	17797	17802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556496
532	NC_020128	TA	3	6	17832	17837	50 %	50 %	0 %	0 %	442556496
533	NC_020128	T	6	6	17863	17868	0 %	100 %	0 %	0 %	442556496
534	NC_020128	TCA	2	6	17879	17884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556496
535	NC_020128	TGC	2	6	17898	17903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556496
536	NC_020128	AAT	2	6	17904	17909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556496
537	NC_020128	AGT	2	6	17917	17922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556496
538	NC_020128	TATATT	2	12	17934	17945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556496
539	NC_020128	CAT	2	6	17946	17951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556496
540	NC_020128	ATCC	2	8	17978	17985	25 %	25 %	0 %	50 %	442556497
541	NC_020128	ATG	2	6	17987	17992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556497
542	NC_020128	AAT	2	6	17996	18001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556497
543	NC_020128	TTG	2	6	18034	18039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556497
544	NC_020128	A	6	6	18109	18114	100 %	0 %	0 %	0 %	442556497
545	NC_020128	AAC	2	6	18155	18160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556497
546	NC_020128	AAC	2	6	18178	18183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556497
547	NC_020128	ACA	2	6	18189	18194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556497
548	NC_020128	AACA	2	8	18208	18215	75 %	0 %	0 %	25 %	442556497
549	NC_020128	A	6	6	18235	18240	100 %	0 %	0 %	0 %	442556497
550	NC_020128	TATT	2	8	18304	18311	25 %	75 %	0 %	0 %	442556497
551	NC_020128	A	6	6	18377	18382	100 %	0 %	0 %	0 %	442556497
552	NC_020128	TTC	2	6	18407	18412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556497
553	NC_020128	T	6	6	18415	18420	0 %	100 %	0 %	0 %	442556497
554	NC_020128	TCT	2	6	18441	18446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556497
555	NC_020128	ATT	2	6	18518	18523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556497
556	NC_020128	TCTTT	2	10	18572	18581	0 %	80 %	0 %	20 %	442556498
557	NC_020128	A	6	6	18617	18622	100 %	0 %	0 %	0 %	442556498
558	NC_020128	CTT	2	6	18627	18632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556498
559	NC_020128	AAG	2	6	18637	18642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556498
560	NC_020128	ATAA	2	8	18698	18705	75 %	25 %	0 %	0 %	442556498
561	NC_020128	A	7	7	18704	18710	100 %	0 %	0 %	0 %	442556498
562	NC_020128	ATT	2	6	18719	18724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556498
563	NC_020128	GGGA	2	8	18738	18745	25 %	0 %	75 %	0 %	442556498
564	NC_020128	A	6	6	18798	18803	100 %	0 %	0 %	0 %	442556498
565	NC_020128	ATA	2	6	18825	18830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556498
566	NC_020128	TTAA	2	8	18860	18867	50 %	50 %	0 %	0 %	442556498
567	NC_020128	ATA	2	6	18932	18937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556498
568	NC_020128	CTT	2	6	18939	18944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_020128	TAT	2	6	18947	18952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020128	TA	3	6	18958	18963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020128	TATAG	2	10	18968	18977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020128	TA	3	6	18989	18994	50 %	50 %	0 %	0 %	442556499
573	NC_020128	TTA	2	6	19007	19012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556499
574	NC_020128	TTA	2	6	19014	19019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556499
575	NC_020128	GTC	2	6	19032	19037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556499
576	NC_020128	CAT	2	6	19059	19064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556499
577	NC_020128	TAA	2	6	19087	19092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556499
578	NC_020128	TAA	2	6	19096	19101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556499
579	NC_020128	A	6	6	19100	19105	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
580	NC_020128	TAT	2	6	19108	19113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556499
581	NC_020128	A	6	6	19117	19122	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
582	NC_020128	TAA	3	9	19126	19134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556499
583	NC_020128	CAA	2	6	19167	19172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556499
584	NC_020128	GTT	2	6	19175	19180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556499
585	NC_020128	A	6	6	19198	19203	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
586	NC_020128	ATC	2	6	19223	19228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556499
587	NC_020128	ATA	2	6	19239	19244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556499
588	NC_020128	ATG	2	6	19245	19250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556499
589	NC_020128	T	6	6	19256	19261	0 %	100 %	0 %	0 %	442556499
590	NC_020128	A	6	6	19288	19293	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
591	NC_020128	T	6	6	19372	19377	0 %	100 %	0 %	0 %	442556500
592	NC_020128	TA	3	6	19409	19414	50 %	50 %	0 %	0 %	442556500
593	NC_020128	TAT	2	6	19460	19465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556500
594	NC_020128	TAA	2	6	19466	19471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556500
595	NC_020128	T	7	7	19524	19530	0 %	100 %	0 %	0 %	442556500
596	NC_020128	TTG	2	6	19595	19600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556500
597	NC_020128	T	7	7	19616	19622	0 %	100 %	0 %	0 %	442556500
598	NC_020128	CAG	2	6	19688	19693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556500
599	NC_020128	TGT	2	6	19732	19737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556500
600	NC_020128	TAA	2	6	19754	19759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556500
601	NC_020128	CTGT	2	8	19796	19803	0 %	50 %	25 %	25 %	442556500
602	NC_020128	TGC	2	6	19806	19811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556500
603	NC_020128	TAA	2	6	19838	19843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556500
604	NC_020128	CAC	2	6	19850	19855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556500
605	NC_020128	TCT	2	6	19882	19887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556500
606	NC_020128	TCA	2	6	19894	19899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556500
607	NC_020128	ACA	2	6	19900	19905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556500
608	NC_020128	TA	7	14	19917	19930	50 %	50 %	0 %	0 %	442556500
609	NC_020128	AG	3	6	19933	19938	50 %	0 %	50 %	0 %	442556500
610	NC_020128	ATA	2	6	19976	19981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020128	CTAT	2	8	20045	20052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_020128	TA	3	6	20066	20071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020128	ATT	3	9	20082	20090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556501
614	NC_020128	AT	3	6	20096	20101	50 %	50 %	0 %	0 %	442556501
615	NC_020128	T	7	7	20114	20120	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
616	NC_020128	CT	3	6	20179	20184	0 %	50 %	0 %	50 %	442556501
617	NC_020128	TTG	2	6	20193	20198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556501
618	NC_020128	AAC	2	6	20208	20213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556501
619	NC_020128	CGA	2	6	20231	20236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556501
620	NC_020128	CAA	2	6	20238	20243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556501
621	NC_020128	ATT	2	6	20263	20268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556501
622	NC_020128	TCT	2	6	20354	20359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556501
623	NC_020128	T	6	6	20363	20368	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
624	NC_020128	ATC	2	6	20446	20451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556501
625	NC_020128	AT	4	8	20459	20466	50 %	50 %	0 %	0 %	442556501
626	NC_020128	TTCT	2	8	20467	20474	0 %	75 %	0 %	25 %	442556501
627	NC_020128	CAG	2	6	20481	20486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556501
628	NC_020128	AAAT	2	8	20544	20551	75 %	25 %	0 %	0 %	442556501
629	NC_020128	CCA	2	6	20558	20563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556501
630	NC_020128	CCT	2	6	20564	20569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556501
631	NC_020128	AAAT	2	8	20589	20596	75 %	25 %	0 %	0 %	442556501
632	NC_020128	AAT	2	6	20632	20637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556501
633	NC_020128	GTTTT	2	10	20652	20661	0 %	80 %	20 %	0 %	442556501
634	NC_020128	AGC	2	6	20677	20682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556501
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641	NC_020128	TCT	2	6	20924	20929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556501
642	NC_020128	T	6	6	20952	20957	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
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647	NC_020128	TA	3	6	21125	21130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
648	NC_020128	TAC	2	6	21135	21140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_020128	AAT	2	6	21141	21146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_020128	AT	7	14	21145	21158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_020128	ATA	2	6	21171	21176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_020128	AAT	2	6	21179	21184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_020128	ACC	2	6	21202	21207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556502
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663	NC_020128	AGAAA	2	10	21482	21491	80 %	0 %	20 %	0 %	442556502
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675	NC_020128	ATG	2	6	22025	22030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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704	NC_020128	T	6	6	22997	23002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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707	NC_020128	T	7	7	23099	23105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
708	NC_020128	TAA	2	6	23108	23113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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732	NC_020128	T	6	6	23670	23675	0 %	100 %	0 %	0 %	442556505
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742	NC_020128	ATTCC	2	10	24059	24068	20 %	40 %	0 %	40 %	442556505
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747	NC_020128	TA	3	6	24284	24289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
748	NC_020128	TA	4	8	24302	24309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
749	NC_020128	A	7	7	24311	24317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
750	NC_020128	ACA	2	6	24332	24337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
751	NC_020128	T	6	6	24348	24353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
752	NC_020128	A	6	6	24369	24374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
753	NC_020128	A	7	7	24391	24397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
754	NC_020128	T	6	6	24422	24427	0 %	100 %	0 %	0 %	442556506
755	NC_020128	T	6	6	24442	24447	0 %	100 %	0 %	0 %	442556506
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757	NC_020128	ACC	2	6	24492	24497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556506
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761	NC_020128	ATC	3	9	24683	24691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556506
762	NC_020128	ACA	2	6	24694	24699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556506
763	NC_020128	TAC	2	6	24826	24831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556506
764	NC_020128	TAT	2	6	24855	24860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556506
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766	NC_020128	AT	3	6	24888	24893	50 %	50 %	0 %	0 %	442556506
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