MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020127	TAA	2	6	143177	143182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555372
4002	NC_020127	TTC	2	6	143184	143189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555372
4003	NC_020127	AAT	2	6	143259	143264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555372
4004	NC_020127	TGA	2	6	143277	143282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555372
4005	NC_020127	TTC	2	6	143331	143336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555372
4006	NC_020127	T	7	7	143367	143373	0 %	100 %	0 %	0 %	442555372
4007	NC_020127	TAA	2	6	143393	143398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555372
4008	NC_020127	GAA	2	6	143399	143404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555372
4009	NC_020127	ATCA	2	8	143475	143482	50 %	25 %	0 %	25 %	442555372
4010	NC_020127	ACG	2	6	143568	143573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555372
4011	NC_020127	CTG	2	6	143579	143584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555372
4012	NC_020127	GTT	2	6	143644	143649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555372
4013	NC_020127	ATT	2	6	143686	143691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555372
4014	NC_020127	ATT	2	6	143731	143736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555372
4015	NC_020127	ATT	2	6	143784	143789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555372
4016	NC_020127	TAA	3	9	143793	143801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555372
4017	NC_020127	GAA	2	6	143960	143965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555372
4018	NC_020127	TCA	2	6	143980	143985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555372
4019	NC_020127	TAA	2	6	143991	143996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555372
4020	NC_020127	TTC	2	6	144036	144041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555372
4021	NC_020127	TTG	2	6	144057	144062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555372
4022	NC_020127	TCA	2	6	144091	144096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555372
4023	NC_020127	TAG	2	6	144107	144112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555372
4024	NC_020127	AAT	2	6	144113	144118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555372
4025	NC_020127	CTC	2	6	144134	144139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555372
4026	NC_020127	ATG	2	6	144158	144163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555372
4027	NC_020127	CTA	2	6	144290	144295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555372
4028	NC_020127	T	6	6	144325	144330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020127	ATA	3	9	144353	144361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020127	AGAA	2	8	144362	144369	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020127	TAT	2	6	144373	144378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020127	TA	3	6	144380	144385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020127	AT	3	6	144437	144442	50 %	50 %	0 %	0 %	442555373
4034	NC_020127	T	6	6	144451	144456	0 %	100 %	0 %	0 %	442555373
4035	NC_020127	TTG	2	6	144481	144486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555373
4036	NC_020127	CAA	2	6	144504	144509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555373
4037	NC_020127	T	6	6	144561	144566	0 %	100 %	0 %	0 %	442555373
4038	NC_020127	AGA	2	6	144571	144576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555373
4039	NC_020127	TCG	2	6	144598	144603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555373
4040	NC_020127	GAA	2	6	144695	144700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555373
4041	NC_020127	AAC	2	6	144724	144729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555373
4042	NC_020127	GTT	2	6	144750	144755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555373
4043	NC_020127	AAT	2	6	144758	144763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555373
4044	NC_020127	TCA	2	6	144947	144952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555373
4045	NC_020127	A	6	6	145004	145009	100 %	0 %	0 %	0 %	442555373
4046	NC_020127	A	7	7	145141	145147	100 %	0 %	0 %	0 %	442555373
4047	NC_020127	TTAA	2	8	145148	145155	50 %	50 %	0 %	0 %	442555373
4048	NC_020127	TA	3	6	145308	145313	50 %	50 %	0 %	0 %	442555373
4049	NC_020127	TAT	2	6	145320	145325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555373
4050	NC_020127	AGCA	2	8	145375	145382	50 %	0 %	25 %	25 %	442555373
4051	NC_020127	T	6	6	145400	145405	0 %	100 %	0 %	0 %	442555373
4052	NC_020127	ACA	2	6	145430	145435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555373
4053	NC_020127	AAT	2	6	145465	145470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555373
4054	NC_020127	GTATTT	2	12	145472	145483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	442555373
4055	NC_020127	AGAA	2	8	145555	145562	75 %	0 %	25 %	0 %	442555373
4056	NC_020127	T	8	8	145651	145658	0 %	100 %	0 %	0 %	442555373
4057	NC_020127	AAC	2	6	145676	145681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555373
4058	NC_020127	TAT	2	6	145719	145724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_020127	AGT	2	6	145726	145731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_020127	AAAGAA	2	12	145748	145759	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_020127	TTATA	2	10	145769	145778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020127	AAAG	2	8	145797	145804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020127	T	6	6	145848	145853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_020127	ACCAT	2	10	145855	145864	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4065	NC_020127	AGA	2	6	145870	145875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_020127	ATA	2	6	145900	145905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_020127	CTA	2	6	145942	145947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555374
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4069	NC_020127	T	8	8	145989	145996	0 %	100 %	0 %	0 %	442555374
4070	NC_020127	AT	3	6	146040	146045	50 %	50 %	0 %	0 %	442555374
4071	NC_020127	TCCT	2	8	146062	146069	0 %	50 %	0 %	50 %	442555374
4072	NC_020127	AGT	2	6	146087	146092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555374
4073	NC_020127	TAT	2	6	146098	146103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555374
4074	NC_020127	CT	3	6	146211	146216	0 %	50 %	0 %	50 %	442555374
4075	NC_020127	TA	3	6	146280	146285	50 %	50 %	0 %	0 %	442555374
4076	NC_020127	GAA	2	6	146319	146324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555374
4077	NC_020127	CTG	2	6	146341	146346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555374
4078	NC_020127	ATA	2	6	146374	146379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555374
4079	NC_020127	AAGA	2	8	146416	146423	75 %	0 %	25 %	0 %	442555374
4080	NC_020127	TCT	2	6	146480	146485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555374
4081	NC_020127	ATTC	2	8	146505	146512	25 %	50 %	0 %	25 %	442555374
4082	NC_020127	CAT	2	6	146535	146540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_020127	ATGA	2	8	146543	146550	50 %	25 %	25 %	0 %	442555375
4084	NC_020127	AGA	2	6	146566	146571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555375
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4087	NC_020127	CAA	2	6	146840	146845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555375
4088	NC_020127	TTAGCA	2	12	146846	146857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442555375
4089	NC_020127	TA	3	6	146863	146868	50 %	50 %	0 %	0 %	442555375
4090	NC_020127	GA	3	6	146885	146890	50 %	0 %	50 %	0 %	442555375
4091	NC_020127	TCA	2	6	146939	146944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555375
4092	NC_020127	A	6	6	146946	146951	100 %	0 %	0 %	0 %	442555375
4093	NC_020127	ATT	2	6	146974	146979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555375
4094	NC_020127	ATC	2	6	146991	146996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555375
4095	NC_020127	AT	3	6	147034	147039	50 %	50 %	0 %	0 %	442555375
4096	NC_020127	CTT	2	6	147056	147061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555375
4097	NC_020127	ATG	2	6	147105	147110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555375
4098	NC_020127	GTT	2	6	147163	147168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555375
4099	NC_020127	TAT	2	6	147267	147272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555375
4100	NC_020127	AAT	2	6	147353	147358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555375
4101	NC_020127	TA	3	6	147375	147380	50 %	50 %	0 %	0 %	442555375
4102	NC_020127	TGG	2	6	147473	147478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555375
4103	NC_020127	TTG	2	6	147501	147506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555375
4104	NC_020127	TG	3	6	147525	147530	0 %	50 %	50 %	0 %	442555375
4105	NC_020127	A	7	7	147628	147634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_020127	TAA	2	6	147649	147654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_020127	GTTA	2	8	147676	147683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_020127	TTAC	2	8	147736	147743	25 %	50 %	0 %	25 %	442555376
4109	NC_020127	TTA	2	6	147779	147784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555376
4110	NC_020127	T	6	6	147792	147797	0 %	100 %	0 %	0 %	442555376
4111	NC_020127	ATT	2	6	147841	147846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555376
4112	NC_020127	A	6	6	147856	147861	100 %	0 %	0 %	0 %	442555376
4113	NC_020127	TCA	2	6	147868	147873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555376
4114	NC_020127	ACCTC	2	10	147877	147886	20 %	20 %	0 %	60 %	442555376
4115	NC_020127	AAG	2	6	147923	147928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555376
4116	NC_020127	ATA	2	6	147934	147939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555376
4117	NC_020127	AGG	2	6	147951	147956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555376
4118	NC_020127	AT	3	6	147963	147968	50 %	50 %	0 %	0 %	442555376
4119	NC_020127	GAA	2	6	147985	147990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555376
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4121	NC_020127	TGC	2	6	148053	148058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555376
4122	NC_020127	TTA	2	6	148115	148120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555376
4123	NC_020127	GATT	2	8	148143	148150	25 %	50 %	25 %	0 %	442555376
4124	NC_020127	A	6	6	148233	148238	100 %	0 %	0 %	0 %	442555376
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4126	NC_020127	T	6	6	148283	148288	0 %	100 %	0 %	0 %	442555376
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4252	NC_020127	AT	3	6	153018	153023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_020127	TAA	2	6	153024	153029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_020127	AT	3	6	153035	153040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_020127	TAT	2	6	153062	153067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_020127	AT	3	6	153088	153093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_020127	TTG	2	6	153130	153135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555382
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4273	NC_020127	CTT	2	6	153723	153728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4279	NC_020127	TTATA	2	10	153836	153845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4280	NC_020127	AT	3	6	153848	153853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4281	NC_020127	T	6	6	153853	153858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4282	NC_020127	T	6	6	153879	153884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4288	NC_020127	T	6	6	154030	154035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4289	NC_020127	TAA	2	6	154047	154052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4290	NC_020127	ATA	2	6	154095	154100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4291	NC_020127	TAA	2	6	154121	154126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4292	NC_020127	TA	3	6	154130	154135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4293	NC_020127	ATA	2	6	154141	154146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4294	NC_020127	TA	3	6	154149	154154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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