MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020127	TTTTCC	2	12	37404	37415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555291
1003	NC_020127	CTA	2	6	37503	37508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555291
1004	NC_020127	CTG	2	6	37525	37530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555291
1005	NC_020127	TAT	2	6	37552	37557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555291
1006	NC_020127	AT	3	6	37578	37583	50 %	50 %	0 %	0 %	442555291
1007	NC_020127	T	8	8	37625	37632	0 %	100 %	0 %	0 %	442555291
1008	NC_020127	AT	3	6	37638	37643	50 %	50 %	0 %	0 %	442555291
1009	NC_020127	AGC	2	6	37679	37684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555291
1010	NC_020127	TTC	2	6	37688	37693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555291
1011	NC_020127	TTG	2	6	37796	37801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555291
1012	NC_020127	AGA	3	9	37853	37861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555291
1013	NC_020127	TAA	2	6	37951	37956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555291
1014	NC_020127	A	6	6	37989	37994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020127	AGTA	2	8	38017	38024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020127	TAA	2	6	38040	38045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020127	AGT	2	6	38081	38086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020127	TAA	2	6	38113	38118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020127	AAG	2	6	38123	38128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020127	TA	4	8	38162	38169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020127	TA	3	6	38234	38239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020127	TA	3	6	38246	38251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020127	GTTT	2	8	38257	38264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020127	AAG	2	6	38274	38279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020127	TA	4	8	38311	38318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020127	AT	4	8	38328	38335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020127	TGT	2	6	38336	38341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020127	GTT	2	6	38357	38362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020127	AAT	2	6	38441	38446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555292
1030	NC_020127	AAT	2	6	38506	38511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555292
1031	NC_020127	GTTT	2	8	38554	38561	0 %	75 %	25 %	0 %	442555292
1032	NC_020127	TCT	2	6	38597	38602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555292
1033	NC_020127	CTA	2	6	38663	38668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555292
1034	NC_020127	ATA	3	9	38672	38680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555292
1035	NC_020127	TCTG	2	8	38761	38768	0 %	50 %	25 %	25 %	442555292
1036	NC_020127	AAAT	2	8	38820	38827	75 %	25 %	0 %	0 %	442555292
1037	NC_020127	TA	3	6	38857	38862	50 %	50 %	0 %	0 %	442555292
1038	NC_020127	TTC	3	9	38932	38940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555292
1039	NC_020127	AGA	2	6	38972	38977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555292
1040	NC_020127	TAG	2	6	38981	38986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555292
1041	NC_020127	TAA	2	6	38991	38996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555292
1042	NC_020127	TAT	2	6	39012	39017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555292
1043	NC_020127	ATT	6	18	39019	39036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555292
1044	NC_020127	T	6	6	39059	39064	0 %	100 %	0 %	0 %	442555292
1045	NC_020127	TAAG	2	8	39086	39093	50 %	25 %	25 %	0 %	442555292
1046	NC_020127	T	7	7	39137	39143	0 %	100 %	0 %	0 %	442555292
1047	NC_020127	T	7	7	39249	39255	0 %	100 %	0 %	0 %	442555292
1048	NC_020127	TAC	2	6	39288	39293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555292
1049	NC_020127	GTG	2	6	39339	39344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555292
1050	NC_020127	TG	4	8	39379	39386	0 %	50 %	50 %	0 %	442555292
1051	NC_020127	GTT	2	6	39428	39433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555292
1052	NC_020127	GTTCT	2	10	39483	39492	0 %	60 %	20 %	20 %	442555292
1053	NC_020127	AATG	2	8	39537	39544	50 %	25 %	25 %	0 %	442555292
1054	NC_020127	TAG	2	6	39633	39638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555292
1055	NC_020127	GAT	2	6	39639	39644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555292
1056	NC_020127	CTA	2	6	39687	39692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555292
1057	NC_020127	TAA	2	6	39717	39722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555292
1058	NC_020127	TCT	2	6	39749	39754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555292
1059	NC_020127	AT	3	6	39867	39872	50 %	50 %	0 %	0 %	442555292
1060	NC_020127	TTA	2	6	39935	39940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555292
1061	NC_020127	ATT	2	6	39991	39996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555292
1062	NC_020127	AGC	2	6	40015	40020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555292
1063	NC_020127	T	6	6	40029	40034	0 %	100 %	0 %	0 %	442555292
1064	NC_020127	TG	3	6	40047	40052	0 %	50 %	50 %	0 %	442555292
1065	NC_020127	TCA	2	6	40089	40094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555292
1066	NC_020127	GCT	2	6	40117	40122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555292
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1068	NC_020127	CTGA	2	8	40171	40178	25 %	25 %	25 %	25 %	442555292
1069	NC_020127	A	6	6	40196	40201	100 %	0 %	0 %	0 %	442555292
1070	NC_020127	TTGT	2	8	40212	40219	0 %	75 %	25 %	0 %	442555292
1071	NC_020127	TACAT	2	10	40247	40256	40 %	40 %	0 %	20 %	442555292
1072	NC_020127	TTTTAA	2	12	40263	40274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555292
1073	NC_020127	CTA	2	6	40311	40316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555292
1074	NC_020127	GTA	2	6	40364	40369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555292
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1077	NC_020127	TGA	2	6	40441	40446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555292
1078	NC_020127	ATT	2	6	40465	40470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555292
1079	NC_020127	AGCC	2	8	40472	40479	25 %	0 %	25 %	50 %	442555292
1080	NC_020127	AAATT	2	10	40493	40502	60 %	40 %	0 %	0 %	442555292
1081	NC_020127	TTTCAT	2	12	40521	40532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442555292
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1083	NC_020127	ATA	2	6	40582	40587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555292
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1085	NC_020127	TAT	2	6	40659	40664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555292
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1087	NC_020127	AAT	2	6	40798	40803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555292
1088	NC_020127	TA	3	6	40804	40809	50 %	50 %	0 %	0 %	442555292
1089	NC_020127	AT	3	6	40810	40815	50 %	50 %	0 %	0 %	442555292
1090	NC_020127	GTTA	2	8	40819	40826	25 %	50 %	25 %	0 %	442555292
1091	NC_020127	A	7	7	40838	40844	100 %	0 %	0 %	0 %	442555292
1092	NC_020127	AT	3	6	40856	40861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020127	AATA	3	12	40876	40887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020127	AT	3	6	40935	40940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_020127	A	8	8	40950	40957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020127	AATT	2	8	40963	40970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_020127	CTAT	2	8	40983	40990	25 %	50 %	0 %	25 %	442555293
1098	NC_020127	AGT	2	6	40998	41003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555293
1099	NC_020127	TTA	2	6	41083	41088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555293
1100	NC_020127	GTT	2	6	41118	41123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555293
1101	NC_020127	TTA	2	6	41187	41192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555293
1102	NC_020127	AAG	2	6	41197	41202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555293
1103	NC_020127	TCA	2	6	41204	41209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555293
1104	NC_020127	T	6	6	41213	41218	0 %	100 %	0 %	0 %	442555293
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1106	NC_020127	GTA	2	6	41265	41270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555293
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1108	NC_020127	ATA	2	6	41293	41298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555293
1109	NC_020127	TAG	2	6	41327	41332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555293
1110	NC_020127	GGT	2	6	41343	41348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555293
1111	NC_020127	TCT	2	6	41403	41408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555293
1112	NC_020127	TA	3	6	41415	41420	50 %	50 %	0 %	0 %	442555293
1113	NC_020127	TTA	2	6	41433	41438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555293
1114	NC_020127	TAT	3	9	41467	41475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555293
1115	NC_020127	AAG	2	6	41563	41568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555293
1116	NC_020127	CTT	2	6	41587	41592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555293
1117	NC_020127	TA	3	6	41628	41633	50 %	50 %	0 %	0 %	442555293
1118	NC_020127	T	6	6	41714	41719	0 %	100 %	0 %	0 %	442555293
1119	NC_020127	CTG	2	6	41767	41772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555293
1120	NC_020127	TTC	2	6	41774	41779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555293
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1123	NC_020127	TTG	2	6	41914	41919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555293
1124	NC_020127	TGG	2	6	41944	41949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555293
1125	NC_020127	GGT	2	6	42003	42008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555293
1126	NC_020127	AGA	2	6	42032	42037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555293
1127	NC_020127	TGG	2	6	42048	42053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555293
1128	NC_020127	TGT	2	6	42075	42080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555293
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