MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020127	GAT	2	6	217208	217213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555434
6003	NC_020127	CCA	2	6	217285	217290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555434
6004	NC_020127	GAG	2	6	217309	217314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555434
6005	NC_020127	AAAT	2	8	217335	217342	75 %	25 %	0 %	0 %	442555434
6006	NC_020127	AAG	2	6	217348	217353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555434
6007	NC_020127	TTC	2	6	217404	217409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555434
6008	NC_020127	TTG	2	6	217479	217484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555434
6009	NC_020127	ATTT	2	8	217485	217492	25 %	75 %	0 %	0 %	442555434
6010	NC_020127	CCA	2	6	217513	217518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555434
6011	NC_020127	TA	3	6	217672	217677	50 %	50 %	0 %	0 %	442555434
6012	NC_020127	TCATTT	2	12	217736	217747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442555434
6013	NC_020127	T	6	6	217745	217750	0 %	100 %	0 %	0 %	442555434
6014	NC_020127	ATT	2	6	217765	217770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555434
6015	NC_020127	A	7	7	217909	217915	100 %	0 %	0 %	0 %	442555434
6016	NC_020127	ACA	2	6	217969	217974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555434
6017	NC_020127	TAA	2	6	217989	217994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555434
6018	NC_020127	TTAT	2	8	218030	218037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_020127	TAT	3	9	218052	218060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_020127	AGA	2	6	218127	218132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_020127	TA	3	6	218190	218195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_020127	TTA	2	6	218209	218214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_020127	AATAA	2	10	218245	218254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_020127	AGA	2	6	218259	218264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_020127	AAGT	2	8	218290	218297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_020127	TTA	2	6	218310	218315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_020127	T	7	7	218349	218355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_020127	T	7	7	218405	218411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_020127	T	6	6	218423	218428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_020127	T	6	6	218433	218438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_020127	GTT	2	6	218443	218448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_020127	TTA	2	6	218466	218471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_020127	AGTT	2	8	218473	218480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_020127	ATTA	2	8	218481	218488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_020127	TAT	2	6	218490	218495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_020127	T	12	12	218498	218509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_020127	ATT	2	6	218583	218588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_020127	TCA	2	6	218600	218605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_020127	TAT	2	6	218611	218616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_020127	ATT	2	6	218633	218638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_020127	CT	3	6	218645	218650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_020127	TTAT	2	8	218672	218679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_020127	A	7	7	218709	218715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_020127	GCC	2	6	218730	218735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442555435
6045	NC_020127	AACAA	2	10	218745	218754	80 %	0 %	0 %	20 %	442555435
6046	NC_020127	TTC	2	6	218769	218774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555435
6047	NC_020127	GAA	2	6	218778	218783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555435
6048	NC_020127	A	6	6	218782	218787	100 %	0 %	0 %	0 %	442555435
6049	NC_020127	CTA	2	6	218816	218821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555435
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6051	NC_020127	GAA	2	6	218853	218858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555435
6052	NC_020127	GAC	2	6	218866	218871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555435
6053	NC_020127	CGA	2	6	218879	218884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555435
6054	NC_020127	A	6	6	218946	218951	100 %	0 %	0 %	0 %	442555435
6055	NC_020127	AGA	2	6	218960	218965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555435
6056	NC_020127	TGC	2	6	218972	218977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555435
6057	NC_020127	A	6	6	218987	218992	100 %	0 %	0 %	0 %	442555435
6058	NC_020127	AT	3	6	219085	219090	50 %	50 %	0 %	0 %	442555435
6059	NC_020127	GAA	2	6	219108	219113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555435
6060	NC_020127	CAA	2	6	219118	219123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555435
6061	NC_020127	ATG	2	6	219124	219129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555435
6062	NC_020127	TTGCT	2	10	219193	219202	0 %	60 %	20 %	20 %	442555435
6063	NC_020127	TCG	2	6	219203	219208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555435
6064	NC_020127	A	7	7	219226	219232	100 %	0 %	0 %	0 %	442555435
6065	NC_020127	ATA	2	6	219289	219294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555435
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6069	NC_020127	CATA	2	8	219505	219512	50 %	25 %	0 %	25 %	442555435
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6072	NC_020127	ACTC	2	8	219747	219754	25 %	25 %	0 %	50 %	442555435
6073	NC_020127	TGA	2	6	219824	219829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555435
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6078	NC_020127	TG	3	6	219963	219968	0 %	50 %	50 %	0 %	442555436
6079	NC_020127	GAATT	2	10	220000	220009	40 %	40 %	20 %	0 %	442555436
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6088	NC_020127	TA	3	6	220169	220174	50 %	50 %	0 %	0 %	442555436
6089	NC_020127	CCAT	2	8	220215	220222	25 %	25 %	0 %	50 %	442555436
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6098	NC_020127	AT	3	6	220566	220571	50 %	50 %	0 %	0 %	442555436
6099	NC_020127	ATA	2	6	220586	220591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555436
6100	NC_020127	AAATT	2	10	220618	220627	60 %	40 %	0 %	0 %	442555436
6101	NC_020127	ATA	2	6	220658	220663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555436
6102	NC_020127	AAG	2	6	220696	220701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555436
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6105	NC_020127	CAT	2	6	220881	220886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_020127	GAG	2	6	220959	220964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_020127	AGC	2	6	221043	221048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_020127	ATG	2	6	221109	221114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_020127	GGA	2	6	221200	221205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_020127	TGA	2	6	221260	221265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555437
6112	NC_020127	TCA	2	6	221307	221312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555437
6113	NC_020127	CTA	2	6	221389	221394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555437
6114	NC_020127	ATT	2	6	221424	221429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555437
6115	NC_020127	TGC	2	6	221523	221528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555437
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6117	NC_020127	ATC	2	6	221564	221569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555437
6118	NC_020127	AT	3	6	221676	221681	50 %	50 %	0 %	0 %	442555437
6119	NC_020127	A	7	7	221685	221691	100 %	0 %	0 %	0 %	442555437
6120	NC_020127	CAA	2	6	221695	221700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555437
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6122	NC_020127	A	7	7	221786	221792	100 %	0 %	0 %	0 %	442555437
6123	NC_020127	CCT	2	6	221796	221801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555437
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6127	NC_020127	T	6	6	221918	221923	0 %	100 %	0 %	0 %	442555437
6128	NC_020127	GGCT	2	8	221941	221948	0 %	25 %	50 %	25 %	442555437
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6131	NC_020127	TTCT	2	8	222061	222068	0 %	75 %	0 %	25 %	442555437
6132	NC_020127	TTG	2	6	222126	222131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555437
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6151	NC_020127	CT	3	6	222952	222957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6157	NC_020127	CAGA	2	8	223210	223217	50 %	0 %	25 %	25 %	442555438
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6164	NC_020127	TCCC	2	8	223604	223611	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6165	NC_020127	C	6	6	223609	223614	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6166	NC_020127	GAA	2	6	223678	223683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6178	NC_020127	TA	4	8	223879	223886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6197	NC_020127	TAT	2	6	224562	224567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6235	NC_020127	T	6	6	226144	226149	0 %	100 %	0 %	0 %	442555441
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6242	NC_020127	CCAT	2	8	226420	226427	25 %	25 %	0 %	50 %	442555441
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6250	NC_020127	GTG	2	6	226711	226716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555441
6251	NC_020127	TCG	2	6	226811	226816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555441
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6253	NC_020127	AGGGA	2	10	226827	226836	40 %	0 %	60 %	0 %	442555441
6254	NC_020127	AT	3	6	226880	226885	50 %	50 %	0 %	0 %	442555441
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6256	NC_020127	TC	3	6	226999	227004	0 %	50 %	0 %	50 %	442555441
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6378	NC_020127	A	7	7	233913	233919	100 %	0 %	0 %	0 %	442555449
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6381	NC_020127	GAC	2	6	234024	234029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555449
6382	NC_020127	ATC	2	6	234042	234047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555449
6383	NC_020127	TGC	2	6	234113	234118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555449
6384	NC_020127	TCCT	2	8	234143	234150	0 %	50 %	0 %	50 %	442555449
6385	NC_020127	CAT	2	6	234158	234163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555449
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6500	NC_020127	T	6	6	239216	239221	0 %	100 %	0 %	0 %	442555452

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