MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5004	NC_020127	TGA	2	6	178539	178544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555401
5005	NC_020127	TAACA	2	10	178545	178554	60 %	20 %	0 %	20 %	442555401
5006	NC_020127	ATA	2	6	178559	178564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555401
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5019	NC_020127	AGGT	2	8	179066	179073	25 %	25 %	50 %	0 %	442555401
5020	NC_020127	AAG	2	6	179102	179107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555401
5021	NC_020127	TTG	2	6	179147	179152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_020127	AAT	2	6	179180	179185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020127	TAC	2	6	179220	179225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_020127	A	7	7	179235	179241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_020127	TA	3	6	179352	179357	50 %	50 %	0 %	0 %	442555402
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5092	NC_020127	AT	3	6	181232	181237	50 %	50 %	0 %	0 %	442555404
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5100	NC_020127	TTG	2	6	181597	181602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_020127	ATTA	2	8	181622	181629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_020127	A	7	7	181633	181639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5106	NC_020127	A	7	7	181726	181732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_020127	T	7	7	181891	181897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_020127	TAT	3	9	181930	181938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_020127	ATTA	2	8	181941	181948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_020127	AAT	2	6	181950	181955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_020127	TA	3	6	181957	181962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_020127	T	6	6	181972	181977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_020127	T	6	6	181979	181984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_020127	TA	3	6	182023	182028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5116	NC_020127	T	6	6	182066	182071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_020127	ATGAT	2	10	186805	186814	40 %	40 %	20 %	0 %	442555408
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5251	NC_020127	CAATC	2	10	187381	187390	40 %	20 %	0 %	40 %	442555408
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5253	NC_020127	GCAT	2	8	187428	187435	25 %	25 %	25 %	25 %	442555408
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5255	NC_020127	CTG	2	6	187480	187485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555408
5256	NC_020127	CTT	2	6	187516	187521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555408
5257	NC_020127	TCA	2	6	187530	187535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555408
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5259	NC_020127	AGT	2	6	187591	187596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555408
5260	NC_020127	TTG	2	6	187651	187656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555408
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5262	NC_020127	CTT	2	6	187738	187743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555408
5263	NC_020127	TTCA	2	8	187793	187800	25 %	50 %	0 %	25 %	442555408
5264	NC_020127	AGAA	2	8	187805	187812	75 %	0 %	25 %	0 %	442555408
5265	NC_020127	T	6	6	187855	187860	0 %	100 %	0 %	0 %	442555408
5266	NC_020127	CTGTT	2	10	187895	187904	0 %	60 %	20 %	20 %	442555408
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5284	NC_020127	T	6	6	188810	188815	0 %	100 %	0 %	0 %	442555409
5285	NC_020127	TTG	2	6	188952	188957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555409
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5287	NC_020127	T	6	6	188964	188969	0 %	100 %	0 %	0 %	442555409
5288	NC_020127	AAT	2	6	189013	189018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555409
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5292	NC_020127	CTG	2	6	189201	189206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5335	NC_020127	ATTT	2	8	190909	190916	25 %	75 %	0 %	0 %	442555412
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5373	NC_020127	T	6	6	192184	192189	0 %	100 %	0 %	0 %	442555412
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5377	NC_020127	TAGAT	2	10	192346	192355	40 %	40 %	20 %	0 %	442555412
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