MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020127	ATG	2	6	162003	162008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555390
4502	NC_020127	CAA	2	6	162009	162014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555390
4503	NC_020127	CAG	2	6	162152	162157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555390
4504	NC_020127	A	7	7	162195	162201	100 %	0 %	0 %	0 %	442555390
4505	NC_020127	TTAGT	2	10	162228	162237	20 %	60 %	20 %	0 %	442555390
4506	NC_020127	AGC	2	6	162343	162348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555390
4507	NC_020127	TCC	2	6	162448	162453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555390
4508	NC_020127	CAT	2	6	162459	162464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555390
4509	NC_020127	CTA	2	6	162477	162482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555390
4510	NC_020127	TGC	2	6	162526	162531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555390
4511	NC_020127	ATT	2	6	162563	162568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555390
4512	NC_020127	T	6	6	162567	162572	0 %	100 %	0 %	0 %	442555390
4513	NC_020127	ATT	2	6	162640	162645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555390
4514	NC_020127	CAA	2	6	162651	162656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555390
4515	NC_020127	GA	3	6	162668	162673	50 %	0 %	50 %	0 %	442555390
4516	NC_020127	TGTTC	2	10	162710	162719	0 %	60 %	20 %	20 %	442555390
4517	NC_020127	A	6	6	162757	162762	100 %	0 %	0 %	0 %	442555390
4518	NC_020127	T	6	6	162830	162835	0 %	100 %	0 %	0 %	442555390
4519	NC_020127	TAT	2	6	162852	162857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555390
4520	NC_020127	CTT	2	6	162858	162863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555390
4521	NC_020127	AGA	2	6	162973	162978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555391
4522	NC_020127	TAC	2	6	162979	162984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555391
4523	NC_020127	TA	3	6	162987	162992	50 %	50 %	0 %	0 %	442555391
4524	NC_020127	TTA	2	6	163010	163015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555391
4525	NC_020127	TTA	2	6	163023	163028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555391
4526	NC_020127	TTCTT	2	10	163084	163093	0 %	80 %	0 %	20 %	442555391
4527	NC_020127	CTC	2	6	163141	163146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555391
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4529	NC_020127	TTA	2	6	163164	163169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555391
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4531	NC_020127	TTC	2	6	163212	163217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555391
4532	NC_020127	GTA	2	6	163316	163321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555391
4533	NC_020127	TTG	2	6	163359	163364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555391
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4535	NC_020127	GCT	3	9	163376	163384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555391
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4537	NC_020127	TTA	2	6	163425	163430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555391
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4540	NC_020127	GCT	2	6	163574	163579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555391
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4542	NC_020127	AGTT	2	8	163630	163637	25 %	50 %	25 %	0 %	442555391
4543	NC_020127	GTTAT	2	10	163649	163658	20 %	60 %	20 %	0 %	442555391
4544	NC_020127	TTA	2	6	163758	163763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555391
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4550	NC_020127	TTCT	2	8	164028	164035	0 %	75 %	0 %	25 %	442555391
4551	NC_020127	A	8	8	164041	164048	100 %	0 %	0 %	0 %	442555391
4552	NC_020127	TGG	3	9	164098	164106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555391
4553	NC_020127	TATC	2	8	164140	164147	25 %	50 %	0 %	25 %	442555391
4554	NC_020127	CTA	2	6	164154	164159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555391
4555	NC_020127	TTC	2	6	164164	164169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555391
4556	NC_020127	TCC	2	6	164203	164208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555391
4557	NC_020127	GAA	2	6	164217	164222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555391
4558	NC_020127	A	6	6	164226	164231	100 %	0 %	0 %	0 %	442555391
4559	NC_020127	TAC	2	6	164284	164289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555391
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4561	NC_020127	AAT	2	6	164334	164339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555391
4562	NC_020127	AT	3	6	164338	164343	50 %	50 %	0 %	0 %	442555391
4563	NC_020127	AAT	2	6	164356	164361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_020127	GAT	2	6	164378	164383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_020127	AT	3	6	164388	164393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_020127	ATT	3	9	164454	164462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_020127	TTTA	2	8	164491	164498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4570	NC_020127	TGCTAT	2	12	164585	164596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442555392
4571	NC_020127	CAG	2	6	164598	164603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555392
4572	NC_020127	AT	3	6	164614	164619	50 %	50 %	0 %	0 %	442555392
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4581	NC_020127	ATATT	2	10	164914	164923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4591	NC_020127	AATGG	2	10	165381	165390	40 %	20 %	40 %	0 %	442555393
4592	NC_020127	GTTC	2	8	165405	165412	0 %	50 %	25 %	25 %	442555393
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4610	NC_020127	TCT	3	9	165798	165806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555393
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4619	NC_020127	TTAT	2	8	166039	166046	25 %	75 %	0 %	0 %	442555393
4620	NC_020127	AGTC	2	8	166048	166055	25 %	25 %	25 %	25 %	442555393
4621	NC_020127	CTT	2	6	166065	166070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555393
4622	NC_020127	T	8	8	166073	166080	0 %	100 %	0 %	0 %	442555393
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