MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei W56 plasmid pW56

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020057	A	6	6	29	34	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020057	T	7	7	861	867	0 %	100 %	0 %	0 %	436843292
3	NC_020057	A	6	6	2196	2201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020057	T	7	7	3886	3892	0 %	100 %	0 %	0 %	436843293
5	NC_020057	T	6	6	4885	4890	0 %	100 %	0 %	0 %	436843295
6	NC_020057	T	7	7	5444	5450	0 %	100 %	0 %	0 %	436843297
7	NC_020057	T	6	6	5491	5496	0 %	100 %	0 %	0 %	436843297
8	NC_020057	T	6	6	5831	5836	0 %	100 %	0 %	0 %	436843297
9	NC_020057	T	6	6	6594	6599	0 %	100 %	0 %	0 %	436843298
10	NC_020057	A	6	6	7013	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	436843298
11	NC_020057	T	6	6	7126	7131	0 %	100 %	0 %	0 %	436843298
12	NC_020057	T	6	6	7525	7530	0 %	100 %	0 %	0 %	436843298
13	NC_020057	T	6	6	7608	7613	0 %	100 %	0 %	0 %	436843299
14	NC_020057	T	7	7	7729	7735	0 %	100 %	0 %	0 %	436843299
15	NC_020057	T	6	6	8190	8195	0 %	100 %	0 %	0 %	436843300
16	NC_020057	T	7	7	9894	9900	0 %	100 %	0 %	0 %	436843301
17	NC_020057	T	6	6	10393	10398	0 %	100 %	0 %	0 %	436843301
18	NC_020057	T	7	7	10674	10680	0 %	100 %	0 %	0 %	436843301
19	NC_020057	A	6	6	13086	13091	100 %	0 %	0 %	0 %	436843302
20	NC_020057	A	6	6	16009	16014	100 %	0 %	0 %	0 %	436843305
21	NC_020057	A	6	6	16773	16778	100 %	0 %	0 %	0 %	436843306
22	NC_020057	T	6	6	16901	16906	0 %	100 %	0 %	0 %	436843306
23	NC_020057	T	6	6	18451	18456	0 %	100 %	0 %	0 %	436843307
24	NC_020057	T	6	6	18923	18928	0 %	100 %	0 %	0 %	436843309
25	NC_020057	T	7	7	18973	18979	0 %	100 %	0 %	0 %	436843309
26	NC_020057	A	6	6	19215	19220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020057	A	10	10	22155	22164	100 %	0 %	0 %	0 %	436843314
28	NC_020057	T	6	6	22639	22644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020057	T	6	6	23342	23347	0 %	100 %	0 %	0 %	436843316
30	NC_020057	A	7	7	23401	23407	100 %	0 %	0 %	0 %	436843317
31	NC_020057	A	6	6	26501	26506	100 %	0 %	0 %	0 %	436843320
32	NC_020057	T	7	7	27110	27116	0 %	100 %	0 %	0 %	436843321
33	NC_020057	T	6	6	27471	27476	0 %	100 %	0 %	0 %	436843322
34	NC_020057	T	6	6	27551	27556	0 %	100 %	0 %	0 %	436843322
35	NC_020057	A	7	7	27597	27603	100 %	0 %	0 %	0 %	436843322
36	NC_020057	A	6	6	27850	27855	100 %	0 %	0 %	0 %	436843322
37	NC_020057	A	6	6	27892	27897	100 %	0 %	0 %	0 %	436843322
38	NC_020057	T	6	6	27964	27969	0 %	100 %	0 %	0 %	436843322
39	NC_020057	T	6	6	28339	28344	0 %	100 %	0 %	0 %	436843323
40	NC_020057	C	6	6	28558	28563	0 %	0 %	0 %	100 %	436843323
41	NC_020057	A	6	6	29563	29568	100 %	0 %	0 %	0 %	436843323
42	NC_020057	T	6	6	29671	29676	0 %	100 %	0 %	0 %	436843323
43	NC_020057	T	7	7	29951	29957	0 %	100 %	0 %	0 %	436843324
44	NC_020057	T	7	7	31742	31748	0 %	100 %	0 %	0 %	436843324
45	NC_020057	A	6	6	32224	32229	100 %	0 %	0 %	0 %	436843324
46	NC_020057	T	6	6	32388	32393	0 %	100 %	0 %	0 %	436843324
47	NC_020057	A	6	6	32986	32991	100 %	0 %	0 %	0 %	436843325
48	NC_020057	A	6	6	33072	33077	100 %	0 %	0 %	0 %	436843325
49	NC_020057	A	6	6	33216	33221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020057	T	6	6	33262	33267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020057	T	6	6	33269	33274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020057	T	6	6	33430	33435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020057	T	6	6	34290	34295	0 %	100 %	0 %	0 %	436843326
54	NC_020057	A	6	6	34639	34644	100 %	0 %	0 %	0 %	436843327
55	NC_020057	A	6	6	35185	35190	100 %	0 %	0 %	0 %	436843327
56	NC_020057	A	6	6	35394	35399	100 %	0 %	0 %	0 %	436843327
57	NC_020057	A	7	7	36036	36042	100 %	0 %	0 %	0 %	436843328
58	NC_020057	T	6	6	37529	37534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020057	T	6	6	38176	38181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020057	G	6	6	38182	38187	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020057	T	6	6	38445	38450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020057	T	6	6	39183	39188	0 %	100 %	0 %	0 %	436843333
63	NC_020057	T	7	7	39721	39727	0 %	100 %	0 %	0 %	436843334
64	NC_020057	T	7	7	40105	40111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020057	A	6	6	40152	40157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020057	T	6	6	40383	40388	0 %	100 %	0 %	0 %	436843335
67	NC_020057	T	6	6	40497	40502	0 %	100 %	0 %	0 %	436843335
68	NC_020057	T	6	6	42358	42363	0 %	100 %	0 %	0 %	436843335
69	NC_020057	T	6	6	42896	42901	0 %	100 %	0 %	0 %	436843335
70	NC_020057	A	7	7	44981	44987	100 %	0 %	0 %	0 %	436843335
71	NC_020057	A	7	7	45114	45120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020057	A	7	7	45297	45303	100 %	0 %	0 %	0 %	436843336
73	NC_020057	A	7	7	45753	45759	100 %	0 %	0 %	0 %	436843337
74	NC_020057	T	6	6	45954	45959	0 %	100 %	0 %	0 %	436843338
75	NC_020057	T	6	6	47298	47303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020057	A	6	6	48426	48431	100 %	0 %	0 %	0 %	436843341
77	NC_020057	T	6	6	49550	49555	0 %	100 %	0 %	0 %	436843343
78	NC_020057	T	6	6	50598	50603	0 %	100 %	0 %	0 %	436843344
79	NC_020057	T	7	7	50841	50847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020057	T	6	6	50852	50857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020057	A	6	6	50877	50882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020057	T	6	6	51288	51293	0 %	100 %	0 %	0 %	436843345
83	NC_020057	A	6	6	51350	51355	100 %	0 %	0 %	0 %	436843345
84	NC_020057	A	7	7	51386	51392	100 %	0 %	0 %	0 %	436843345
85	NC_020057	T	6	6	51995	52000	0 %	100 %	0 %	0 %	436843345
86	NC_020057	A	7	7	52022	52028	100 %	0 %	0 %	0 %	436843345
87	NC_020057	A	6	6	52288	52293	100 %	0 %	0 %	0 %	436843346
88	NC_020057	A	6	6	52992	52997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020057	A	7	7	53045	53051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020057	A	6	6	54121	54126	100 %	0 %	0 %	0 %	436843348
91	NC_020057	A	7	7	55345	55351	100 %	0 %	0 %	0 %	436843352

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.