MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei W56 plasmid pW56

Total Repeats: 1077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020057	CGA	2	6	25457	25462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843319
502	NC_020057	ACT	2	6	25465	25470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843319
503	NC_020057	GCC	2	6	25597	25602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436843319
504	NC_020057	ACTT	2	8	25630	25637	25 %	50 %	0 %	25 %	436843319
505	NC_020057	GAT	2	6	25648	25653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843319
506	NC_020057	GAA	2	6	25658	25663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843319
507	NC_020057	CAA	2	6	25798	25803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843319
508	NC_020057	GCA	2	6	25814	25819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843319
509	NC_020057	TAA	2	6	25866	25871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843319
510	NC_020057	GGT	2	6	25975	25980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843319
511	NC_020057	CA	3	6	26091	26096	50 %	0 %	0 %	50 %	436843319
512	NC_020057	GGC	2	6	26381	26386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843320
513	NC_020057	ATTT	2	8	26436	26443	25 %	75 %	0 %	0 %	436843320
514	NC_020057	A	6	6	26501	26506	100 %	0 %	0 %	0 %	436843320
515	NC_020057	CTG	2	6	26641	26646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843321
516	NC_020057	CGT	2	6	26769	26774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843321
517	NC_020057	CCA	2	6	26827	26832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843321
518	NC_020057	GCC	2	6	26994	26999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436843321
519	NC_020057	CAA	2	6	27050	27055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843321
520	NC_020057	ACG	2	6	27062	27067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843321
521	NC_020057	T	7	7	27110	27116	0 %	100 %	0 %	0 %	436843321
522	NC_020057	GTA	2	6	27237	27242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020057	ACG	2	6	27284	27289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_020057	CTC	2	6	27383	27388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_020057	CAG	2	6	27417	27422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020057	T	6	6	27471	27476	0 %	100 %	0 %	0 %	436843322
527	NC_020057	TGA	2	6	27505	27510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843322
528	NC_020057	GTC	2	6	27522	27527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843322
529	NC_020057	T	6	6	27551	27556	0 %	100 %	0 %	0 %	436843322
530	NC_020057	GTT	2	6	27557	27562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843322
531	NC_020057	CTA	2	6	27566	27571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843322
532	NC_020057	AAC	2	6	27579	27584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843322
533	NC_020057	TAG	2	6	27585	27590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843322
534	NC_020057	A	7	7	27597	27603	100 %	0 %	0 %	0 %	436843322
535	NC_020057	TA	3	6	27738	27743	50 %	50 %	0 %	0 %	436843322
536	NC_020057	TAT	2	6	27821	27826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843322
537	NC_020057	A	6	6	27850	27855	100 %	0 %	0 %	0 %	436843322
538	NC_020057	A	6	6	27892	27897	100 %	0 %	0 %	0 %	436843322
539	NC_020057	ATT	2	6	27954	27959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843322
540	NC_020057	T	6	6	27964	27969	0 %	100 %	0 %	0 %	436843322
541	NC_020057	TTG	2	6	28056	28061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843322
542	NC_020057	GGT	2	6	28106	28111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843323
543	NC_020057	GCTA	2	8	28121	28128	25 %	25 %	25 %	25 %	436843323
544	NC_020057	CTGA	2	8	28151	28158	25 %	25 %	25 %	25 %	436843323
545	NC_020057	CCG	2	6	28276	28281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436843323
546	NC_020057	T	6	6	28339	28344	0 %	100 %	0 %	0 %	436843323
547	NC_020057	CGT	2	6	28417	28422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843323
548	NC_020057	AAT	2	6	28499	28504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843323
549	NC_020057	CCT	2	6	28549	28554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843323
550	NC_020057	C	6	6	28558	28563	0 %	0 %	0 %	100 %	436843323
551	NC_020057	GGT	2	6	28662	28667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843323
552	NC_020057	GAC	2	6	28748	28753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843323
553	NC_020057	TAAG	2	8	28763	28770	50 %	25 %	25 %	0 %	436843323
554	NC_020057	GTG	2	6	28878	28883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843323
555	NC_020057	AACC	2	8	28960	28967	50 %	0 %	0 %	50 %	436843323
556	NC_020057	ATAG	2	8	28976	28983	50 %	25 %	25 %	0 %	436843323
557	NC_020057	AAT	2	6	29033	29038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843323
558	NC_020057	CTT	2	6	29075	29080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843323
559	NC_020057	TGA	2	6	29142	29147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843323
560	NC_020057	GTT	2	6	29203	29208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843323
561	NC_020057	TAC	2	6	29230	29235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843323
562	NC_020057	AGAT	2	8	29279	29286	50 %	25 %	25 %	0 %	436843323
563	NC_020057	GTG	2	6	29370	29375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843323
564	NC_020057	A	6	6	29563	29568	100 %	0 %	0 %	0 %	436843323
565	NC_020057	AATA	2	8	29577	29584	75 %	25 %	0 %	0 %	436843323
566	NC_020057	GTT	2	6	29667	29672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843323
567	NC_020057	T	6	6	29671	29676	0 %	100 %	0 %	0 %	436843323
568	NC_020057	GCC	2	6	29738	29743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436843324
569	NC_020057	GCT	2	6	29824	29829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843324
570	NC_020057	ATG	2	6	29859	29864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843324
571	NC_020057	GT	3	6	29884	29889	0 %	50 %	50 %	0 %	436843324
572	NC_020057	T	7	7	29951	29957	0 %	100 %	0 %	0 %	436843324
573	NC_020057	CCA	2	6	29984	29989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843324
574	NC_020057	TTG	2	6	30054	30059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843324
575	NC_020057	GTTGCG	2	12	30098	30109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436843324
576	NC_020057	TGGGCT	2	12	30172	30183	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436843324
577	NC_020057	TCA	2	6	30211	30216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843324
578	NC_020057	AATT	2	8	30228	30235	50 %	50 %	0 %	0 %	436843324
579	NC_020057	ATAATC	2	12	30243	30254	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	436843324
580	NC_020057	GAC	2	6	30261	30266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843324
581	NC_020057	TTC	2	6	30303	30308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843324
582	NC_020057	CCG	2	6	30338	30343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436843324
583	NC_020057	GCC	2	6	30523	30528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436843324
584	NC_020057	CCA	2	6	30557	30562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843324
585	NC_020057	CTG	2	6	30588	30593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843324
586	NC_020057	ATG	2	6	30607	30612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843324
587	NC_020057	TA	3	6	30635	30640	50 %	50 %	0 %	0 %	436843324
588	NC_020057	CAA	2	6	30785	30790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843324
589	NC_020057	TAA	2	6	30825	30830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843324
590	NC_020057	CCG	2	6	30831	30836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436843324
591	NC_020057	CAC	2	6	30837	30842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843324
592	NC_020057	AATT	2	8	30851	30858	50 %	50 %	0 %	0 %	436843324
593	NC_020057	CTG	2	6	30966	30971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843324
594	NC_020057	TGG	2	6	30989	30994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843324
595	NC_020057	AGT	2	6	31089	31094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843324
596	NC_020057	ATA	2	6	31119	31124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843324
597	NC_020057	TGG	2	6	31148	31153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843324
598	NC_020057	AT	3	6	31213	31218	50 %	50 %	0 %	0 %	436843324
599	NC_020057	AAC	2	6	31221	31226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843324
600	NC_020057	TTC	2	6	31275	31280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843324
601	NC_020057	TGAC	2	8	31289	31296	25 %	25 %	25 %	25 %	436843324
602	NC_020057	TCA	2	6	31327	31332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843324
603	NC_020057	CAG	2	6	31341	31346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843324
604	NC_020057	TTA	2	6	31406	31411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843324
605	NC_020057	TCG	2	6	31427	31432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843324
606	NC_020057	CTC	2	6	31518	31523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843324
607	NC_020057	CGT	2	6	31524	31529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843324
608	NC_020057	GCT	2	6	31615	31620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843324
609	NC_020057	CAA	2	6	31667	31672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843324
610	NC_020057	AGA	2	6	31673	31678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843324
611	NC_020057	T	7	7	31742	31748	0 %	100 %	0 %	0 %	436843324
612	NC_020057	TTG	2	6	31800	31805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843324
613	NC_020057	ATC	2	6	31854	31859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843324
614	NC_020057	GGC	2	6	31863	31868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843324
615	NC_020057	CCG	2	6	31908	31913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436843324
616	NC_020057	AAG	2	6	31921	31926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843324
617	NC_020057	CAAA	2	8	32011	32018	75 %	0 %	0 %	25 %	436843324
618	NC_020057	A	6	6	32224	32229	100 %	0 %	0 %	0 %	436843324
619	NC_020057	T	6	6	32388	32393	0 %	100 %	0 %	0 %	436843324
620	NC_020057	ACC	2	6	32522	32527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_020057	AAC	2	6	32547	32552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020057	CAT	2	6	32578	32583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020057	CGG	2	6	32617	32622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_020057	GCT	2	6	32634	32639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020057	GTTATT	2	12	32723	32734	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020057	ATTG	2	8	32803	32810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020057	AAC	2	6	32831	32836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020057	TAT	2	6	32904	32909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020057	A	6	6	32986	32991	100 %	0 %	0 %	0 %	436843325
630	NC_020057	A	6	6	33072	33077	100 %	0 %	0 %	0 %	436843325
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