MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 12037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019683	CATC	2	8	633	640	25 %	25 %	0 %	50 %	427722022
2	NC_019683	TAGC	2	8	795	802	25 %	25 %	25 %	25 %	427722022
3	NC_019683	GATT	2	8	864	871	25 %	50 %	25 %	0 %	427722022
4	NC_019683	CCAC	2	8	975	982	25 %	0 %	0 %	75 %	427722022
5	NC_019683	ATTG	2	8	1123	1130	25 %	50 %	25 %	0 %	427722022
6	NC_019683	TTTC	2	8	1532	1539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019683	TCTA	2	8	2294	2301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019683	ATGG	2	8	2575	2582	25 %	25 %	50 %	0 %	427722025
9	NC_019683	TTGG	2	8	3109	3116	0 %	50 %	50 %	0 %	427722025
10	NC_019683	GACA	2	8	3268	3275	50 %	0 %	25 %	25 %	427722025
11	NC_019683	TGAT	2	8	3303	3310	25 %	50 %	25 %	0 %	427722025
12	NC_019683	AAAT	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019683	AACC	2	8	4016	4023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019683	AACC	2	8	5196	5203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019683	GTAG	2	8	5332	5339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019683	TCAC	2	8	5388	5395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019683	CAAT	2	8	5483	5490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019683	AATC	2	8	6398	6405	50 %	25 %	0 %	25 %	427722026
19	NC_019683	TCCA	2	8	6581	6588	25 %	25 %	0 %	50 %	427722026
20	NC_019683	TTAC	2	8	7000	7007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019683	TGCC	2	8	7217	7224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019683	GTTC	2	8	7764	7771	0 %	50 %	25 %	25 %	427722027
23	NC_019683	GTTT	2	8	8744	8751	0 %	75 %	25 %	0 %	427722027
24	NC_019683	TGGG	2	8	9208	9215	0 %	25 %	75 %	0 %	427722027
25	NC_019683	TCGT	2	8	9544	9551	0 %	50 %	25 %	25 %	427722028
26	NC_019683	GATG	2	8	9734	9741	25 %	25 %	50 %	0 %	427722028
27	NC_019683	CTAG	2	8	10929	10936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019683	AAGC	2	8	11426	11433	50 %	0 %	25 %	25 %	427722029
29	NC_019683	TGAG	2	8	12239	12246	25 %	25 %	50 %	0 %	427722030
30	NC_019683	CTTG	2	8	12287	12294	0 %	50 %	25 %	25 %	427722030
31	NC_019683	ATAA	2	8	13597	13604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019683	TCCT	2	8	15563	15570	0 %	50 %	0 %	50 %	427722034
33	NC_019683	TCAA	2	8	15927	15934	50 %	25 %	0 %	25 %	427722035
34	NC_019683	TAAG	2	8	17659	17666	50 %	25 %	25 %	0 %	427722036
35	NC_019683	AATT	2	8	18998	19005	50 %	50 %	0 %	0 %	427722037
36	NC_019683	AATC	2	8	19620	19627	50 %	25 %	0 %	25 %	427722037
37	NC_019683	ATTA	2	8	20408	20415	50 %	50 %	0 %	0 %	427722038
38	NC_019683	GCCA	2	8	21653	21660	25 %	0 %	25 %	50 %	427722039
39	NC_019683	ATTA	2	8	21701	21708	50 %	50 %	0 %	0 %	427722039
40	NC_019683	AATG	2	8	22847	22854	50 %	25 %	25 %	0 %	427722039
41	NC_019683	GGGC	2	8	23376	23383	0 %	0 %	75 %	25 %	427722039
42	NC_019683	ATGA	2	8	23400	23407	50 %	25 %	25 %	0 %	427722039
43	NC_019683	TGGA	2	8	23415	23422	25 %	25 %	50 %	0 %	427722039
44	NC_019683	CAGC	2	8	23729	23736	25 %	0 %	25 %	50 %	427722039
45	NC_019683	TTCT	2	8	23900	23907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019683	CATC	2	8	24003	24010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019683	TGTA	2	8	24254	24261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019683	TGTT	2	8	24275	24282	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019683	TTTG	2	8	24678	24685	0 %	75 %	25 %	0 %	427722040
50	NC_019683	AACT	2	8	25317	25324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019683	AAGA	2	8	25349	25356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019683	TAAA	2	8	26900	26907	75 %	25 %	0 %	0 %	427722042
53	NC_019683	TGAT	2	8	27922	27929	25 %	50 %	25 %	0 %	427722043
54	NC_019683	GTTT	2	8	28048	28055	0 %	75 %	25 %	0 %	427722043
55	NC_019683	TCTG	2	8	28270	28277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019683	AGCC	2	8	28561	28568	25 %	0 %	25 %	50 %	427722044
57	NC_019683	GCTC	2	8	28659	28666	0 %	25 %	25 %	50 %	427722044
58	NC_019683	TCAA	2	8	28829	28836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019683	TTGA	2	8	29169	29176	25 %	50 %	25 %	0 %	427722045
60	NC_019683	AGGA	2	8	29920	29927	50 %	0 %	50 %	0 %	427722046
61	NC_019683	ATTC	2	8	31655	31662	25 %	50 %	0 %	25 %	427722048
62	NC_019683	CAAC	2	8	32123	32130	50 %	0 %	0 %	50 %	427722049
63	NC_019683	GCAT	2	8	33173	33180	25 %	25 %	25 %	25 %	427722050
64	NC_019683	TACT	2	8	33257	33264	25 %	50 %	0 %	25 %	427722050
65	NC_019683	GAGC	2	8	33403	33410	25 %	0 %	50 %	25 %	427722050
66	NC_019683	CAAT	2	8	33447	33454	50 %	25 %	0 %	25 %	427722050
67	NC_019683	ACAA	2	8	33757	33764	75 %	0 %	0 %	25 %	427722050
68	NC_019683	CGAT	2	8	34030	34037	25 %	25 %	25 %	25 %	427722051
69	NC_019683	AGGT	2	8	34294	34301	25 %	25 %	50 %	0 %	427722051
70	NC_019683	TTTA	2	8	34491	34498	25 %	75 %	0 %	0 %	427722051
71	NC_019683	GAGG	2	8	34536	34543	25 %	0 %	75 %	0 %	427722051
72	NC_019683	TAAA	2	8	35294	35301	75 %	25 %	0 %	0 %	427722053
73	NC_019683	TAAA	2	8	35515	35522	75 %	25 %	0 %	0 %	427722053
74	NC_019683	TGCC	2	8	35569	35576	0 %	25 %	25 %	50 %	427722053
75	NC_019683	TTCT	2	8	36306	36313	0 %	75 %	0 %	25 %	427722054
76	NC_019683	GGGT	2	8	36865	36872	0 %	25 %	75 %	0 %	427722054
77	NC_019683	ACCA	2	8	37578	37585	50 %	0 %	0 %	50 %	427722054
78	NC_019683	CAAC	2	8	37628	37635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019683	AACT	2	8	37642	37649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019683	TTCC	2	8	38356	38363	0 %	50 %	0 %	50 %	427722055
81	NC_019683	ACGG	2	8	38375	38382	25 %	0 %	50 %	25 %	427722055
82	NC_019683	AATA	2	8	38782	38789	75 %	25 %	0 %	0 %	427722055
83	NC_019683	TGGA	3	12	39367	39378	25 %	25 %	50 %	0 %	427722055
84	NC_019683	CTTC	2	8	39838	39845	0 %	50 %	0 %	50 %	427722055
85	NC_019683	CACT	2	8	40045	40052	25 %	25 %	0 %	50 %	427722055
86	NC_019683	AATC	2	8	40378	40385	50 %	25 %	0 %	25 %	427722055
87	NC_019683	GTTT	2	8	40456	40463	0 %	75 %	25 %	0 %	427722055
88	NC_019683	TTCA	2	8	40643	40650	25 %	50 %	0 %	25 %	427722055
89	NC_019683	TTTG	2	8	41411	41418	0 %	75 %	25 %	0 %	427722055
90	NC_019683	ATGT	2	8	41500	41507	25 %	50 %	25 %	0 %	427722055
91	NC_019683	AAAT	2	8	41589	41596	75 %	25 %	0 %	0 %	427722055
92	NC_019683	TTGC	2	8	41949	41956	0 %	50 %	25 %	25 %	427722055
93	NC_019683	TAAT	2	8	42254	42261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019683	TTTA	2	8	42263	42270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019683	TCAC	2	8	42867	42874	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019683	GGCT	2	8	43695	43702	0 %	25 %	50 %	25 %	427722057
97	NC_019683	GCAT	2	8	43801	43808	25 %	25 %	25 %	25 %	427722057
98	NC_019683	ATCC	2	8	44269	44276	25 %	25 %	0 %	50 %	427722058
99	NC_019683	AAAG	2	8	44299	44306	75 %	0 %	25 %	0 %	427722058
100	NC_019683	ATTC	2	8	45697	45704	25 %	50 %	0 %	25 %	427722060
101	NC_019683	AAAG	2	8	47178	47185	75 %	0 %	25 %	0 %	427722062
102	NC_019683	CAAA	2	8	47254	47261	75 %	0 %	0 %	25 %	427722062
103	NC_019683	CGTG	2	8	47736	47743	0 %	25 %	50 %	25 %	427722063
104	NC_019683	GTCA	2	8	47886	47893	25 %	25 %	25 %	25 %	427722063
105	NC_019683	GGAA	2	8	47921	47928	50 %	0 %	50 %	0 %	427722063
106	NC_019683	ACCA	2	8	48384	48391	50 %	0 %	0 %	50 %	427722063
107	NC_019683	TCAA	2	8	48502	48509	50 %	25 %	0 %	25 %	427722063
108	NC_019683	CAAT	2	8	49313	49320	50 %	25 %	0 %	25 %	427722063
109	NC_019683	TAAG	2	8	49980	49987	50 %	25 %	25 %	0 %	427722063
110	NC_019683	TCCA	2	8	50181	50188	25 %	25 %	0 %	50 %	427722063
111	NC_019683	ATAG	2	8	51400	51407	50 %	25 %	25 %	0 %	427722063
112	NC_019683	GAGT	2	8	52087	52094	25 %	25 %	50 %	0 %	427722064
113	NC_019683	TTTG	2	8	52619	52626	0 %	75 %	25 %	0 %	427722065
114	NC_019683	GTGA	2	8	53410	53417	25 %	25 %	50 %	0 %	427722066
115	NC_019683	AACC	2	8	54277	54284	50 %	0 %	0 %	50 %	427722067
116	NC_019683	TAAA	2	8	54464	54471	75 %	25 %	0 %	0 %	427722067
117	NC_019683	ATAG	2	8	55397	55404	50 %	25 %	25 %	0 %	427722068
118	NC_019683	TAGC	2	8	55408	55415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019683	TAGA	2	8	55514	55521	50 %	25 %	25 %	0 %	427722069
120	NC_019683	TTGG	2	8	55556	55563	0 %	50 %	50 %	0 %	427722069
121	NC_019683	ATCG	2	8	55570	55577	25 %	25 %	25 %	25 %	427722069
122	NC_019683	AGTC	2	8	57140	57147	25 %	25 %	25 %	25 %	427722070
123	NC_019683	TTAA	2	8	57354	57361	50 %	50 %	0 %	0 %	427722070
124	NC_019683	TTGA	2	8	57800	57807	25 %	50 %	25 %	0 %	427722070
125	NC_019683	GACT	2	8	58135	58142	25 %	25 %	25 %	25 %	427722070
126	NC_019683	TTCG	2	8	58279	58286	0 %	50 %	25 %	25 %	427722070
127	NC_019683	ATAA	2	8	58876	58883	75 %	25 %	0 %	0 %	427722070
128	NC_019683	TGGA	2	8	59064	59071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019683	GTTT	2	8	59348	59355	0 %	75 %	25 %	0 %	427722071
130	NC_019683	AATT	2	8	59426	59433	50 %	50 %	0 %	0 %	427722071
131	NC_019683	GCCA	2	8	59458	59465	25 %	0 %	25 %	50 %	427722071
132	NC_019683	CACT	2	8	59758	59765	25 %	25 %	0 %	50 %	427722071
133	NC_019683	CTCC	2	8	59778	59785	0 %	25 %	0 %	75 %	427722071
134	NC_019683	TCAG	2	8	60174	60181	25 %	25 %	25 %	25 %	427722071
135	NC_019683	ATTG	2	8	60464	60471	25 %	50 %	25 %	0 %	427722071
136	NC_019683	GCTC	2	8	60866	60873	0 %	25 %	25 %	50 %	427722071
137	NC_019683	CCAT	2	8	60930	60937	25 %	25 %	0 %	50 %	427722071
138	NC_019683	TCTG	2	8	61290	61297	0 %	50 %	25 %	25 %	427722071
139	NC_019683	GATG	2	8	61304	61311	25 %	25 %	50 %	0 %	427722071
140	NC_019683	GGTT	2	8	61625	61632	0 %	50 %	50 %	0 %	427722071
141	NC_019683	CACT	2	8	62221	62228	25 %	25 %	0 %	50 %	427722071
142	NC_019683	GCTA	2	8	62468	62475	25 %	25 %	25 %	25 %	427722072
143	NC_019683	TTCT	2	8	63023	63030	0 %	75 %	0 %	25 %	427722072
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