MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 66185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019683	CAC	2	6	37	42	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_019683	AAG	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722022
3	NC_019683	AAC	2	6	105	110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
4	NC_019683	GTT	2	6	179	184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722022
5	NC_019683	CAG	2	6	337	342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722022
6	NC_019683	ACA	2	6	348	353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
7	NC_019683	GCG	2	6	364	369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722022
8	NC_019683	CCA	2	6	432	437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722022
9	NC_019683	GGT	2	6	482	487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
10	NC_019683	TGG	2	6	511	516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
11	NC_019683	CTG	2	6	681	686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722022
12	NC_019683	AAG	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722022
13	NC_019683	ACA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
14	NC_019683	CTG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722022
15	NC_019683	TGG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
16	NC_019683	CGC	2	6	1187	1192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722022
17	NC_019683	CAA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019683	TTA	2	6	1520	1525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019683	TGA	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019683	GGT	2	6	1767	1772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722023
21	NC_019683	ATT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722023
22	NC_019683	TTA	2	6	1920	1925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722023
23	NC_019683	TTG	2	6	1937	1942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019683	GCT	2	6	1988	1993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722024
25	NC_019683	TTC	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722024
26	NC_019683	GAG	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722024
27	NC_019683	ACC	2	6	2112	2117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722024
28	NC_019683	TAA	2	6	2140	2145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722024
29	NC_019683	CAA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722024
30	NC_019683	CAT	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722024
31	NC_019683	GTG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019683	GGT	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722025
33	NC_019683	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
34	NC_019683	CAC	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722025
35	NC_019683	TTG	2	6	2586	2591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722025
36	NC_019683	AGA	2	6	2701	2706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
37	NC_019683	GAT	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
38	NC_019683	TTA	2	6	2916	2921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
39	NC_019683	TAT	2	6	2941	2946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
40	NC_019683	AGG	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722025
41	NC_019683	TTG	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722025
42	NC_019683	CAG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722025
43	NC_019683	AAG	2	6	3261	3266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
44	NC_019683	TGA	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
45	NC_019683	TTA	2	6	3321	3326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
46	NC_019683	GCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722025
47	NC_019683	CTA	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722025
48	NC_019683	TGG	3	9	3505	3513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722025
49	NC_019683	GCA	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722025
50	NC_019683	AAC	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722025
51	NC_019683	AAG	2	6	3586	3591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019683	TGA	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019683	TTC	2	6	3713	3718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019683	TTC	2	6	3791	3796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019683	CAT	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019683	CTT	2	6	3837	3842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019683	TCA	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019683	AGC	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019683	TGG	2	6	4104	4109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019683	CGG	2	6	4215	4220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019683	ATG	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019683	GCT	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019683	CTT	2	6	4337	4342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019683	GAG	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019683	CTG	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019683	AGT	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019683	CTT	2	6	4541	4546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019683	AGT	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019683	TGT	2	6	4565	4570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019683	ACT	2	6	4613	4618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019683	TGA	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019683	GAG	2	6	4795	4800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019683	GAC	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019683	CTT	2	6	5010	5015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019683	GCG	2	6	5258	5263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019683	TGG	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019683	CTC	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019683	TGA	2	6	5435	5440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019683	CTT	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019683	CGC	2	6	5533	5538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019683	GTT	2	6	5540	5545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019683	CAG	2	6	5553	5558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019683	TGT	2	6	5560	5565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019683	CAT	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019683	GTG	2	6	5642	5647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019683	TCT	2	6	5687	5692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019683	CAG	2	6	5819	5824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722026
88	NC_019683	GAT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722026
89	NC_019683	TAA	2	6	6110	6115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722026
90	NC_019683	CAC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722026
91	NC_019683	CGG	2	6	6195	6200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722026
92	NC_019683	GCC	2	6	6270	6275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722026
93	NC_019683	TAA	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722026
94	NC_019683	AGC	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722026
95	NC_019683	TTC	2	6	6855	6860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019683	AGG	2	6	7233	7238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019683	AAT	2	6	7318	7323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019683	AGT	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019683	CTT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722027
100	NC_019683	TGA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722027
101	NC_019683	ATT	2	6	7632	7637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722027
102	NC_019683	GCT	2	6	7690	7695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722027
103	NC_019683	CAA	2	6	7860	7865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
104	NC_019683	GTG	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
105	NC_019683	AAT	2	6	7876	7881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722027
106	NC_019683	CAA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
107	NC_019683	GAA	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722027
108	NC_019683	TGG	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
109	NC_019683	CAA	2	6	8225	8230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
110	NC_019683	ATT	2	6	8337	8342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722027
111	NC_019683	TGG	2	6	8378	8383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
112	NC_019683	TTC	2	6	8588	8593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722027
113	NC_019683	TTG	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722027
114	NC_019683	CAG	2	6	8705	8710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722027
115	NC_019683	TGA	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722027
116	NC_019683	GTG	2	6	8759	8764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
117	NC_019683	TCT	2	6	8812	8817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722027
118	NC_019683	AAC	2	6	8886	8891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
119	NC_019683	AGA	2	6	8954	8959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722027
120	NC_019683	ACA	2	6	9051	9056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
121	NC_019683	TTG	2	6	9068	9073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722027
122	NC_019683	TGT	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722027
123	NC_019683	CTG	2	6	9155	9160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722027
124	NC_019683	AGC	2	6	9276	9281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722027
125	NC_019683	ATG	2	6	9425	9430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722027
126	NC_019683	ATA	2	6	9500	9505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019683	ATT	2	6	9564	9569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722028
128	NC_019683	ATT	2	6	9703	9708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722028
129	NC_019683	AAT	2	6	9899	9904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722028
130	NC_019683	ATG	2	6	10099	10104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
131	NC_019683	TAG	2	6	10117	10122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
132	NC_019683	TGA	2	6	10159	10164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
133	NC_019683	CGA	2	6	10223	10228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722028
134	NC_019683	ATT	2	6	10269	10274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722028
135	NC_019683	AAT	2	6	10350	10355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722028
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143	NC_019683	AAT	2	6	10866	10871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019683	AAT	2	6	10964	10969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_019683	CAA	2	6	18685	18690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722037
264	NC_019683	AAG	2	6	18697	18702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722037
265	NC_019683	TGG	2	6	18720	18725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722037
266	NC_019683	AAG	2	6	18760	18765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722037
267	NC_019683	ATA	2	6	18766	18771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722037
268	NC_019683	ATA	2	6	18838	18843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722037
269	NC_019683	TTA	2	6	18860	18865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722037
270	NC_019683	TTA	2	6	18883	18888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722037
271	NC_019683	ACA	2	6	18981	18986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722037
272	NC_019683	TGT	2	6	19085	19090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722037
273	NC_019683	CTG	2	6	19189	19194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722037
274	NC_019683	TTG	2	6	19237	19242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722037
275	NC_019683	CAG	2	6	19249	19254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722037
276	NC_019683	ATA	2	6	19282	19287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722037
277	NC_019683	TGG	2	6	19292	19297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722037
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283	NC_019683	TGG	2	6	19575	19580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722037
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285	NC_019683	AAT	2	6	19665	19670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722037
286	NC_019683	CAA	2	6	19752	19757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722037
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292	NC_019683	GAG	2	6	20348	20353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722038
293	NC_019683	GCC	2	6	20371	20376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722038
294	NC_019683	CTG	2	6	20464	20469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722038
295	NC_019683	TCG	2	6	20475	20480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722038
296	NC_019683	GCC	2	6	20564	20569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722038
297	NC_019683	CTG	2	6	20614	20619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722038
298	NC_019683	CGA	2	6	20641	20646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722038
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381	NC_019683	CTC	2	6	26089	26094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722041
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385	NC_019683	CTT	2	6	26984	26989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
386	NC_019683	TTA	2	6	27008	27013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_019683	CTG	2	6	27022	27027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_019683	TGA	2	6	27037	27042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
389	NC_019683	CTG	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722043
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