MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 99570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019683	CAC	2	6	23680	23685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722039
502	NC_019683	CAGC	2	8	23729	23736	25 %	0 %	25 %	50 %	427722039
503	NC_019683	TAA	2	6	23741	23746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722039
504	NC_019683	ATC	2	6	23781	23786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722039
505	NC_019683	CTT	2	6	23816	23821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722039
506	NC_019683	CGT	2	6	23832	23837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722039
507	NC_019683	A	6	6	23844	23849	100 %	0 %	0 %	0 %	427722039
508	NC_019683	AGA	2	6	23884	23889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019683	TTCT	2	8	23900	23907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_019683	CATC	2	8	24003	24010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_019683	CAA	2	6	24052	24057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_019683	T	6	6	24097	24102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019683	GAT	2	6	24243	24248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_019683	TGTA	2	8	24254	24261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_019683	TGTT	2	8	24275	24282	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019683	ATT	2	6	24337	24342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019683	ATG	2	6	24433	24438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722040
518	NC_019683	ATT	2	6	24483	24488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722040
519	NC_019683	GT	3	6	24500	24505	0 %	50 %	50 %	0 %	427722040
520	NC_019683	GCT	2	6	24514	24519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722040
521	NC_019683	AGC	2	6	24531	24536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722040
522	NC_019683	TCC	2	6	24545	24550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722040
523	NC_019683	CTTCT	2	10	24636	24645	0 %	60 %	0 %	40 %	427722040
524	NC_019683	TTTG	2	8	24678	24685	0 %	75 %	25 %	0 %	427722040
525	NC_019683	CTG	2	6	24734	24739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722040
526	NC_019683	CG	3	6	24824	24829	0 %	0 %	50 %	50 %	427722040
527	NC_019683	A	6	6	24925	24930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_019683	TAAAT	2	10	24938	24947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_019683	T	6	6	24971	24976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_019683	TAAGAA	2	12	25002	25013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_019683	T	6	6	25015	25020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019683	ATT	2	6	25039	25044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019683	A	6	6	25051	25056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019683	TTC	2	6	25069	25074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_019683	ACC	2	6	25104	25109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_019683	ACT	2	6	25114	25119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_019683	GGC	2	6	25159	25164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_019683	AGACA	2	10	25185	25194	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
539	NC_019683	TTC	2	6	25198	25203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_019683	GGT	2	6	25258	25263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019683	CGA	2	6	25273	25278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_019683	AACT	2	8	25317	25324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_019683	AAGA	2	8	25349	25356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_019683	GTT	2	6	25358	25363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019683	TC	3	6	25364	25369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_019683	AGC	2	6	25389	25394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_019683	AAG	2	6	25463	25468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_019683	TTG	2	6	25497	25502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019683	CGG	2	6	25613	25618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722041
550	NC_019683	CAA	2	6	25619	25624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722041
551	NC_019683	TC	3	6	25650	25655	0 %	50 %	0 %	50 %	427722041
552	NC_019683	A	6	6	25768	25773	100 %	0 %	0 %	0 %	427722041
553	NC_019683	CAA	2	6	25798	25803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722041
554	NC_019683	GTG	2	6	25970	25975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722041
555	NC_019683	ACG	2	6	25983	25988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722041
556	NC_019683	CTC	2	6	26089	26094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722041
557	NC_019683	GTA	2	6	26249	26254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722042
558	NC_019683	GTC	2	6	26562	26567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722042
559	NC_019683	CA	3	6	26647	26652	50 %	0 %	0 %	50 %	427722042
560	NC_019683	TC	3	6	26668	26673	0 %	50 %	0 %	50 %	427722042
561	NC_019683	GCC	2	6	26834	26839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722042
562	NC_019683	TAAA	2	8	26900	26907	75 %	25 %	0 %	0 %	427722042
563	NC_019683	CTT	2	6	26984	26989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_019683	T	7	7	26995	27001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019683	TTA	2	6	27008	27013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_019683	CTG	2	6	27022	27027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_019683	TGA	2	6	27037	27042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_019683	CTG	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722043
569	NC_019683	ACA	2	6	27230	27235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722043
570	NC_019683	GAT	2	6	27347	27352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722043
571	NC_019683	GTT	2	6	27467	27472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722043
572	NC_019683	GTC	2	6	27490	27495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722043
573	NC_019683	CTG	2	6	27562	27567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722043
574	NC_019683	GT	3	6	27628	27633	0 %	50 %	50 %	0 %	427722043
575	NC_019683	GAT	2	6	27741	27746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722043
576	NC_019683	TTG	3	9	27748	27756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722043
577	NC_019683	TGG	2	6	27770	27775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722043
578	NC_019683	GAA	2	6	27800	27805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722043
579	NC_019683	ACG	2	6	27811	27816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722043
580	NC_019683	CGT	2	6	27840	27845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722043
581	NC_019683	TGT	2	6	27875	27880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722043
582	NC_019683	TGA	2	6	27914	27919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722043
583	NC_019683	TGAT	2	8	27922	27929	25 %	50 %	25 %	0 %	427722043
584	NC_019683	GTTT	2	8	28048	28055	0 %	75 %	25 %	0 %	427722043
585	NC_019683	GAA	2	6	28056	28061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722043
586	NC_019683	CCT	2	6	28136	28141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722043
587	NC_019683	GAA	2	6	28167	28172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722043
588	NC_019683	AGC	2	6	28182	28187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722043
589	NC_019683	TCTG	2	8	28270	28277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_019683	GTT	2	6	28298	28303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722044
591	NC_019683	GCT	2	6	28389	28394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722044
592	NC_019683	GGC	2	6	28439	28444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722044
593	NC_019683	TCA	2	6	28465	28470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722044
594	NC_019683	GAT	2	6	28555	28560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722044
595	NC_019683	AGCC	2	8	28561	28568	25 %	0 %	25 %	50 %	427722044
596	NC_019683	CAA	2	6	28573	28578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722044
597	NC_019683	CAT	2	6	28612	28617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722044
598	NC_019683	AGT	2	6	28624	28629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722044
599	NC_019683	CTT	2	6	28648	28653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722044
600	NC_019683	GCTC	2	8	28659	28666	0 %	25 %	25 %	50 %	427722044
601	NC_019683	TTC	2	6	28688	28693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722044
602	NC_019683	AAC	2	6	28706	28711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722044
603	NC_019683	CT	3	6	28798	28803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_019683	TCAA	2	8	28829	28836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_019683	ACA	2	6	28838	28843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_019683	TGT	2	6	28873	28878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_019683	T	6	6	28921	28926	0 %	100 %	0 %	0 %	427722045
608	NC_019683	GTTTGA	2	12	28943	28954	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	427722045
609	NC_019683	CTG	2	6	28959	28964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722045
610	NC_019683	GGA	2	6	28973	28978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722045
611	NC_019683	TCAAC	2	10	28992	29001	40 %	20 %	0 %	40 %	427722045
612	NC_019683	TTC	2	6	29035	29040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722045
613	NC_019683	GCC	2	6	29048	29053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722045
614	NC_019683	CTTTTG	2	12	29130	29141	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	427722045
615	NC_019683	TTGA	2	8	29169	29176	25 %	50 %	25 %	0 %	427722045
616	NC_019683	GA	3	6	29220	29225	50 %	0 %	50 %	0 %	427722045
617	NC_019683	T	6	6	29323	29328	0 %	100 %	0 %	0 %	427722045
618	NC_019683	TG	3	6	29416	29421	0 %	50 %	50 %	0 %	427722045
619	NC_019683	GGC	2	6	29460	29465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_019683	A	7	7	29541	29547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_019683	T	8	8	29567	29574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_019683	ACT	2	6	29578	29583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_019683	ATT	2	6	29611	29616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019683	TC	3	6	29621	29626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_019683	T	7	7	29637	29643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_019683	A	6	6	29671	29676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_019683	TGC	2	6	29772	29777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722046
628	NC_019683	GAT	2	6	29803	29808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722046
629	NC_019683	TCA	2	6	29820	29825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722046
630	NC_019683	TCA	2	6	29836	29841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722046
631	NC_019683	AGGA	2	8	29920	29927	50 %	0 %	50 %	0 %	427722046
632	NC_019683	GGT	2	6	29941	29946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722046
633	NC_019683	GTG	2	6	30080	30085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722046
634	NC_019683	GAC	2	6	30146	30151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722046
635	NC_019683	GTA	2	6	30167	30172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722046
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639	NC_019683	GTG	3	9	30425	30433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722046
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754	NC_019683	CTT	2	6	36476	36481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722054
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758	NC_019683	CAT	2	6	36717	36722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722054
759	NC_019683	CAATGG	2	12	36752	36763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427722054
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