MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. LL195

Total Repeats: 1161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019556	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019556	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	424712855
3	NC_019556	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	424712856
4	NC_019556	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	424712856
5	NC_019556	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	424712856
6	NC_019556	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	424712857
7	NC_019556	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	424712858
8	NC_019556	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	424712862
9	NC_019556	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	424712862
10	NC_019556	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	424712865
11	NC_019556	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712865
12	NC_019556	ATTTTC	2	12	21960	21971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	424712869
13	NC_019556	CTTCAT	2	12	22976	22987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	424712871
14	NC_019556	TTTTGG	2	12	23340	23351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712871
15	NC_019556	ATTGAA	2	12	26989	27000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	424712874
16	NC_019556	CCAAAA	2	12	37140	37151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712887
17	NC_019556	AATTAT	2	12	37754	37765	50 %	50 %	0 %	0 %	424712888
18	NC_019556	TCACCA	2	12	38901	38912	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	424712890
19	NC_019556	CGATTA	2	12	44331	44342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	424712894
20	NC_019556	TTATGT	2	12	48820	48831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	424712897
21	NC_019556	AAAGAT	2	12	52472	52483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	424712900
22	NC_019556	TGAAAT	2	12	53309	53320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	424712901
23	NC_019556	TGGCGG	2	12	56442	56453	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	424712905
24	NC_019556	TCAAAA	2	12	56562	56573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	424712905
25	NC_019556	AAAAAT	2	12	59009	59020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	424712910
26	NC_019556	GCAGAA	2	12	62934	62945	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	424712912
27	NC_019556	AGGTAA	2	12	63025	63036	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	424712913
28	NC_019556	TGATTG	2	12	64413	64424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	424712914
29	NC_019556	TGATTT	2	12	69744	69755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	424712919
30	NC_019556	TTTTGC	2	12	70349	70360	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	424712920
31	NC_019556	AAATAA	2	12	84074	84085	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	424712934
32	NC_019556	TAAATT	2	12	87226	87237	50 %	50 %	0 %	0 %	424712938
33	NC_019556	ATTTAT	2	12	87400	87411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019556	CTTTTT	2	12	96573	96584	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	424712951
35	NC_019556	ATCACT	2	12	99633	99644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712954
36	NC_019556	GATATT	2	12	99692	99703	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	424712954
37	NC_019556	CAGATT	2	12	103209	103220	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	424712954
38	NC_019556	AACTAT	2	12	105985	105996	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	424712955
39	NC_019556	AACCAG	2	12	111223	111234	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	424712960
40	NC_019556	TATTAG	2	12	115516	115527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	424712965
41	NC_019556	TAGCAG	2	12	115579	115590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	424712965
42	NC_019556	TTATTT	2	12	119041	119052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	424712969
43	NC_019556	ATTACA	2	12	123235	123246	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	424712974
44	NC_019556	TAAAAT	2	12	126959	126970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712977
45	NC_019556	CAAAAT	2	12	127100	127111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	424712977
46	NC_019556	CAAGCG	2	12	128101	128112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424712977
47	NC_019556	GTTTTA	2	12	133867	133878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	424712985
48	NC_019556	TGATTT	2	12	135883	135894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	424712989
49	NC_019556	AAGTAA	2	12	139854	139865	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	424712992
50	NC_019556	CCGTTA	2	12	143361	143372	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	424712999
51	NC_019556	CAGGTT	2	12	150686	150697	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019556	CAACTG	2	12	153107	153118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	424713008
53	NC_019556	TCTGAA	2	12	156088	156099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	424713014
54	NC_019556	GTTGCA	2	12	161835	161846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	424713022
55	NC_019556	GATTGC	2	12	161897	161908	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	424713022
56	NC_019556	AGGCGG	2	12	167545	167556	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	424713026
57	NC_019556	CGTAAC	2	12	170366	170377	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	424713027
58	NC_019556	AGTACC	2	12	170411	170422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	424713027
59	NC_019556	GTTTTC	2	12	171388	171399	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	424713028
60	NC_019556	GTTGAT	2	12	173004	173015	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	424713030
61	NC_019556	GTAAAA	2	12	173367	173378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	424713030
62	NC_019556	TTTTAC	2	12	175411	175422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	424713034
63	NC_019556	TTTTTA	2	12	176448	176459	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	424713036
64	NC_019556	GCATTA	2	12	176678	176689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	424713036
65	NC_019556	AAAGTA	2	12	177660	177671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	424713037
66	NC_019556	ACACTT	2	12	178577	178588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019556	TTGCAC	2	12	180554	180565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	424713039
68	NC_019556	AGAAGT	2	12	182702	182713	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	424713040
69	NC_019556	CAATCC	2	12	184618	184629	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	424713042
70	NC_019556	AAAGAT	2	12	186629	186640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	424713044
71	NC_019556	TGAAGT	2	12	190874	190885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713045
72	NC_019556	CATTGA	2	12	199007	199018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	424713052
73	NC_019556	TGCAGC	2	12	199662	199673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	424713053
74	NC_019556	TAAAAA	2	12	201900	201911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	424713055
75	NC_019556	AATAAA	2	12	204906	204917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019556	AAAGCA	2	12	215112	215123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	424713068
77	NC_019556	TTCTTT	2	12	219811	219822	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	424713074
78	NC_019556	GAAAAA	2	12	221900	221911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	424713076
79	NC_019556	GAAAAA	2	12	223124	223135	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	424713078
80	NC_019556	GCAAGT	2	12	228951	228962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	424713081
81	NC_019556	GAAAAC	2	12	231821	231832	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019556	TGTCGG	2	12	232871	232882	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	424713084
83	NC_019556	AAAAAC	2	12	234356	234367	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	424713085
84	NC_019556	GCAGAA	2	12	235900	235911	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	424713086
85	NC_019556	TAAAAT	2	12	239212	239223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424713090
86	NC_019556	CCAGAA	2	12	240425	240436	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	424713092
87	NC_019556	ATTCAA	2	12	242714	242725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019556	AAGGAA	2	12	244285	244296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019556	TAGGCG	2	12	245938	245949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019556	ATTCAA	2	12	248733	248744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019556	AAGGAA	2	12	250304	250315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019556	TAGGCG	2	12	251957	251968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019556	AGTCAA	2	12	253771	253782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019556	TTTACC	2	12	254200	254211	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	424713094
95	NC_019556	AGTAAA	2	12	261457	261468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	424713100
96	NC_019556	GTACGT	2	12	262263	262274	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	424713102
97	NC_019556	AAGTCG	2	12	267532	267543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	424713107
98	NC_019556	TTATAT	2	12	268556	268567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019556	ACAGTA	2	12	268885	268896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	424713110
100	NC_019556	AAAACA	2	12	269260	269271	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	424713111
101	NC_019556	GCATGG	2	12	269441	269452	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	424713111
102	NC_019556	CTGTAG	2	12	272385	272396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	424713116
103	NC_019556	GACAAT	2	12	273897	273908	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	424713118
104	NC_019556	GTGAGC	2	12	274352	274363	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	424713118
105	NC_019556	ATTGAT	2	12	274546	274557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	424713118
106	NC_019556	TAAAAA	2	12	275616	275627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	424713119
107	NC_019556	TGAATC	2	12	276401	276412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	424713120
108	NC_019556	GCTACT	2	12	278093	278104	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	424713121
109	NC_019556	TTCTGA	2	12	281167	281178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	424713123
110	NC_019556	AAGAAA	2	12	284383	284394	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	424713125
111	NC_019556	TTCGTG	2	12	290139	290150	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	424713126
112	NC_019556	TAACAA	2	12	293444	293455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	424713129
113	NC_019556	TTTAAC	2	12	294517	294528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	424713130
114	NC_019556	GTTGAG	2	12	296371	296382	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	424713131
115	NC_019556	ATTTTT	2	12	296644	296655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	424713131
116	NC_019556	TTTATA	2	12	297188	297199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424713132
117	NC_019556	CCAAAT	2	12	299177	299188	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	424713133
118	NC_019556	AGAACT	2	12	301791	301802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	424713136
119	NC_019556	AACTTT	2	12	304271	304282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019556	TACAAG	2	12	306035	306046	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	424713140
121	NC_019556	CGAAAT	2	12	306089	306100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	424713140
122	NC_019556	TAAAAA	2	12	309640	309651	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019556	CATTAT	2	12	309819	309830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	424713143
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209	NC_019556	CTATAA	2	12	520481	520492	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
210	NC_019556	AAACAA	2	12	527228	527239	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	424713367
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220	NC_019556	AAATGT	2	12	569305	569316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
221	NC_019556	GGAAAA	2	12	572700	572711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713416
222	NC_019556	CGAAAT	2	12	572868	572879	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	424713416
223	NC_019556	GCCGGA	2	12	575641	575652	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	424713417
224	NC_019556	AGATTT	2	12	577436	577447	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
225	NC_019556	GACGGC	2	12	577881	577892	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	424713421
226	NC_019556	CGCACT	2	12	578693	578704	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	424713421
227	NC_019556	TTGCTT	2	12	587085	587096	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	424713428
228	NC_019556	TTTTTC	2	12	587128	587139	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	424713428
229	NC_019556	GCAACC	2	12	590325	590336	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	424713433
230	NC_019556	AATCAC	2	12	591628	591639	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	424713434
231	NC_019556	TACAGT	2	12	593999	594010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	424713436
232	NC_019556	ATCCAG	2	12	596166	596177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	424713438
233	NC_019556	AGAATT	2	12	597478	597489	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	424713439
234	NC_019556	TTTGGC	2	12	601996	602007	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	424713443
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