MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS4

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019437	TTC	2	6	82	87	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075303
2	NC_019437	GTA	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075303
3	NC_019437	TGA	2	6	315	320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075303
4	NC_019437	ATT	2	6	360	365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075303
5	NC_019437	ACT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075303
6	NC_019437	AAG	2	6	884	889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075303
7	NC_019437	TGA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075304
8	NC_019437	CAA	2	6	980	985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075304
9	NC_019437	ATC	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075304
10	NC_019437	ATG	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075304
11	NC_019437	TTA	2	6	1184	1189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075304
12	NC_019437	TCT	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075304
13	NC_019437	CAA	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075304
14	NC_019437	AGA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075304
15	NC_019437	GCC	2	6	1306	1311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414075304
16	NC_019437	ACA	2	6	1331	1336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075304
17	NC_019437	GTG	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075304
18	NC_019437	ACA	2	6	1435	1440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019437	CAA	2	6	1500	1505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019437	AGA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019437	GGT	2	6	1602	1607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019437	TAG	2	6	1787	1792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075305
23	NC_019437	ACT	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075305
24	NC_019437	ATT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075305
25	NC_019437	TTA	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075305
26	NC_019437	AGA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075305
27	NC_019437	TAA	2	6	2028	2033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075305
28	NC_019437	ATA	2	6	2256	2261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019437	AAT	2	6	2314	2319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075306
30	NC_019437	CTC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414075306
31	NC_019437	TGT	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075306
32	NC_019437	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075306
33	NC_019437	ATG	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075307
34	NC_019437	GGT	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075307
35	NC_019437	TTA	2	6	2691	2696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075307
36	NC_019437	CGG	2	6	2784	2789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414075307
37	NC_019437	CAA	2	6	2808	2813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075307
38	NC_019437	AAT	2	6	2910	2915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075307
39	NC_019437	GGT	2	6	2964	2969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075307
40	NC_019437	GTT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075307
41	NC_019437	ATA	2	6	3058	3063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075307
42	NC_019437	TAA	2	6	3217	3222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075308
43	NC_019437	GGC	2	6	3238	3243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414075308
44	NC_019437	TCG	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075308
45	NC_019437	TGT	2	6	3328	3333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075308
46	NC_019437	CAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075308
47	NC_019437	GAT	2	6	3403	3408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075308
48	NC_019437	TTA	2	6	3485	3490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075308
49	NC_019437	GAT	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075308
50	NC_019437	ATG	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019437	ATC	2	6	4128	4133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019437	GTT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019437	AGT	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019437	GAC	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019437	AAT	2	6	4694	4699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019437	AAT	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019437	TAT	2	6	4762	4767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019437	CAA	2	6	4786	4791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075309
59	NC_019437	CTG	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075309
60	NC_019437	TGA	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075309
61	NC_019437	CAA	2	6	5038	5043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075309
62	NC_019437	AGG	2	6	5369	5374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414075309
63	NC_019437	CAA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075310
64	NC_019437	TGA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075310
65	NC_019437	CAA	3	9	5470	5478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075310
66	NC_019437	ATT	2	6	5508	5513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075310
67	NC_019437	TCA	2	6	5565	5570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075310
68	NC_019437	ATA	2	6	5796	5801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019437	CTG	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019437	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019437	ATT	2	6	6110	6115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019437	TGA	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019437	AAG	2	6	6298	6303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019437	TTA	2	6	6307	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019437	TTA	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019437	AAG	2	6	6717	6722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019437	GTA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.