MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS6

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019436	A	7	7	192	198	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
2	NC_019436	T	7	7	210	216	0 %	100 %	0 %	0 %	414075269
3	NC_019436	T	7	7	282	288	0 %	100 %	0 %	0 %	414075269
4	NC_019436	A	7	7	302	308	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
5	NC_019436	A	6	6	669	674	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
6	NC_019436	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
7	NC_019436	A	6	6	1093	1098	100 %	0 %	0 %	0 %	414075269
8	NC_019436	A	6	6	1512	1517	100 %	0 %	0 %	0 %	414075270
9	NC_019436	A	6	6	1581	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	414075270
10	NC_019436	A	6	6	1686	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	414075270
11	NC_019436	A	6	6	1943	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	414075271
12	NC_019436	T	6	6	2168	2173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019436	A	6	6	2181	2186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019436	T	6	6	2192	2197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019436	A	6	6	2210	2215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019436	T	6	6	2258	2263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019436	T	7	7	2339	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
18	NC_019436	T	7	7	2754	2760	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
19	NC_019436	T	6	6	3071	3076	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
20	NC_019436	T	7	7	3093	3099	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
21	NC_019436	T	6	6	3136	3141	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
22	NC_019436	T	7	7	3599	3605	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
23	NC_019436	T	6	6	3614	3619	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
24	NC_019436	T	6	6	3714	3719	0 %	100 %	0 %	0 %	414075272
25	NC_019436	T	6	6	3851	3856	0 %	100 %	0 %	0 %	414075273
26	NC_019436	A	6	6	4031	4036	100 %	0 %	0 %	0 %	414075273
27	NC_019436	T	6	6	4143	4148	0 %	100 %	0 %	0 %	414075273
28	NC_019436	A	7	7	4387	4393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019436	T	7	7	4493	4499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019436	T	7	7	4584	4590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019436	T	6	6	4728	4733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019436	T	8	8	4751	4758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019436	T	6	6	4808	4813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019436	T	6	6	4852	4857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019436	A	6	6	4984	4989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019436	A	6	6	4991	4996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019436	A	6	6	5155	5160	100 %	0 %	0 %	0 %	414075274
38	NC_019436	T	6	6	6417	6422	0 %	100 %	0 %	0 %	414075275
39	NC_019436	T	6	6	6468	6473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44	NC_019436	T	6	6	8505	8510	0 %	100 %	0 %	0 %	414075278
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49	NC_019436	T	6	6	9314	9319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019436	A	6	6	9576	9581	100 %	0 %	0 %	0 %	414075279
51	NC_019436	A	6	6	10349	10354	100 %	0 %	0 %	0 %	414075280
52	NC_019436	A	6	6	10388	10393	100 %	0 %	0 %	0 %	414075280
53	NC_019436	A	7	7	11252	11258	100 %	0 %	0 %	0 %	414075281
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66	NC_019436	A	6	6	14435	14440	100 %	0 %	0 %	0 %	414075283
67	NC_019436	T	6	6	14454	14459	0 %	100 %	0 %	0 %	414075283
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71	NC_019436	A	6	6	15086	15091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_019436	A	6	6	22985	22990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_019436	A	6	6	24222	24227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019436	A	6	6	28638	28643	100 %	0 %	0 %	0 %	414075290
111	NC_019436	T	7	7	31270	31276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019436	A	7	7	31450	31456	100 %	0 %	0 %	0 %	414075291
113	NC_019436	A	6	6	31827	31832	100 %	0 %	0 %	0 %	414075291
114	NC_019436	A	6	6	32082	32087	100 %	0 %	0 %	0 %	414075291
115	NC_019436	A	6	6	32441	32446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019436	A	6	6	32469	32474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019436	A	6	6	32520	32525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_019436	T	6	6	33137	33142	0 %	100 %	0 %	0 %	414075292
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123	NC_019436	A	7	7	34278	34284	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
124	NC_019436	A	7	7	34296	34302	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
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126	NC_019436	A	6	6	35040	35045	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
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129	NC_019436	A	7	7	35203	35209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019436	T	6	6	36125	36130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_019436	A	6	6	37647	37652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019436	A	6	6	37974	37979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_019436	A	7	7	38389	38395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019436	A	8	8	38452	38459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_019436	A	6	6	38520	38525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019436	A	6	6	38542	38547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.