MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS6

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019436	GTTTGA	2	12	2646	2657	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075272
2	NC_019436	CTTTGT	2	12	2693	2704	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414075272
3	NC_019436	TTTCTT	2	12	2943	2954	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414075272
4	NC_019436	ATTTTT	2	12	4348	4359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019436	TCATTG	2	12	4795	4806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019436	TGACAA	2	12	5243	5254	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414075274
7	NC_019436	AAGAAA	2	12	7215	7226	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414075277
8	NC_019436	TCATTG	2	12	8448	8459	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414075278
9	NC_019436	TCGCCA	2	12	9692	9703	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414075279
10	NC_019436	TAAGAT	2	12	11109	11120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019436	GGACAT	2	12	13812	13823	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414075283
12	NC_019436	TAAACA	2	12	14576	14587	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414075283
13	NC_019436	TGCAGT	2	12	16440	16451	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414075285
14	NC_019436	CAAGTC	2	12	20421	20432	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414075287
15	NC_019436	AACGTG	2	12	21471	21482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019436	GATTAT	2	12	23827	23838	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019436	CCGTGA	2	12	26471	26482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414075290
18	NC_019436	TTGATG	2	12	26767	26778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414075290
19	NC_019436	TTTTTC	2	12	33144	33155	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414075292
20	NC_019436	GAAAAA	2	12	35572	35583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414075294
21	NC_019436	ATCAAA	2	12	35624	35635	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414075294

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.