MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS6

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019436	TCTTA	2	10	483	492	20 %	60 %	0 %	20 %	414075269
2	NC_019436	ATAAA	2	10	1645	1654	80 %	20 %	0 %	0 %	414075270
3	NC_019436	CAAGA	2	10	1878	1887	60 %	0 %	20 %	20 %	414075271
4	NC_019436	ATTTT	2	10	4320	4329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019436	CTCAA	2	10	5099	5108	40 %	20 %	0 %	40 %	414075274
6	NC_019436	AATGA	2	10	7160	7169	60 %	20 %	20 %	0 %	414075277
7	NC_019436	CTTTT	2	10	9308	9317	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019436	TATAA	2	10	11232	11241	60 %	40 %	0 %	0 %	414075281
9	NC_019436	TTTTG	2	10	14336	14345	0 %	80 %	20 %	0 %	414075283
10	NC_019436	TTTGA	2	10	16933	16942	20 %	60 %	20 %	0 %	414075285
11	NC_019436	TAAAA	2	10	18010	18019	80 %	20 %	0 %	0 %	414075285
12	NC_019436	AATTG	2	10	18140	18149	40 %	40 %	20 %	0 %	414075286
13	NC_019436	CGATG	2	10	19113	19122	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019436	TATTT	2	10	19866	19875	20 %	80 %	0 %	0 %	414075287
15	NC_019436	TTTGC	2	10	20915	20924	0 %	60 %	20 %	20 %	414075287
16	NC_019436	ATCCA	2	10	22560	22569	40 %	20 %	0 %	40 %	414075288
17	NC_019436	TCTTT	2	10	22801	22810	0 %	80 %	0 %	20 %	414075288
18	NC_019436	TTAGA	2	10	22856	22865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019436	CTTTT	2	10	25186	25195	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019436	ACGCA	2	10	25218	25227	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_019436	TTCAA	2	10	28969	28978	40 %	40 %	0 %	20 %	414075290
22	NC_019436	ATTAT	2	10	31189	31198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019436	TTGAA	2	10	31365	31374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019436	GGAAA	2	10	33627	33636	60 %	0 %	40 %	0 %	414075293
25	NC_019436	GTCTT	2	10	33723	33732	0 %	60 %	20 %	20 %	414075293
26	NC_019436	AAAAT	2	10	36902	36911	80 %	20 %	0 %	0 %	414075295
27	NC_019436	TTTTG	2	10	37317	37326	0 %	80 %	20 %	0 %	414075295
28	NC_019436	TCAAT	2	10	38332	38341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.