MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS6

Total Repeats: 494

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019436	TAT	2	6	6	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
2	NC_019436	ATA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075269
3	NC_019436	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075269
4	NC_019436	ATT	2	6	201	206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
5	NC_019436	AAG	2	6	251	256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
6	NC_019436	AGA	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
7	NC_019436	ATG	3	9	368	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075269
8	NC_019436	TAT	2	6	399	404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
9	NC_019436	AGA	2	6	681	686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
10	NC_019436	GAA	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
11	NC_019436	GAT	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075269
12	NC_019436	TTA	2	6	859	864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075269
13	NC_019436	CTA	2	6	898	903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075269
14	NC_019436	AGA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
15	NC_019436	AAG	2	6	1055	1060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075269
16	NC_019436	GAA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075270
17	NC_019436	TAG	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075270
18	NC_019436	GTT	2	6	1304	1309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075270
19	NC_019436	ACA	2	6	1313	1318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075270
20	NC_019436	AAC	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075270
21	NC_019436	CAA	3	9	1485	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075270
22	NC_019436	AGA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075270
23	NC_019436	AGG	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414075270
24	NC_019436	GAA	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075270
25	NC_019436	AAT	2	6	1671	1676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075270
26	NC_019436	GGA	2	6	1893	1898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414075271
27	NC_019436	AGA	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075271
28	NC_019436	TAT	2	6	2008	2013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019436	ATT	2	6	2164	2169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019436	TCA	2	6	2273	2278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019436	TCA	3	9	2306	2314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
32	NC_019436	ATC	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
33	NC_019436	TGT	2	6	2491	2496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075272
34	NC_019436	TGT	2	6	2540	2545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075272
35	NC_019436	TAA	2	6	2790	2795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
36	NC_019436	GTC	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075272
37	NC_019436	AAT	2	6	3273	3278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
38	NC_019436	AAT	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
39	NC_019436	TGA	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075272
40	NC_019436	AAT	2	6	3472	3477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075272
41	NC_019436	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
42	NC_019436	TCA	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
43	NC_019436	TCA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075272
44	NC_019436	GAA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075272
45	NC_019436	CTT	2	6	3842	3847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075273
46	NC_019436	ATT	2	6	3909	3914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075273
47	NC_019436	GAA	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075273
48	NC_019436	ATA	2	6	4000	4005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075273
49	NC_019436	ATT	2	6	4077	4082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075273
50	NC_019436	ATC	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075273
51	NC_019436	ATT	2	6	4174	4179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075273
52	NC_019436	GGT	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019436	ATT	2	6	4511	4516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019436	TTC	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019436	TCT	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019436	TAT	2	6	4923	4928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019436	CCT	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019436	CAA	3	9	5125	5133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075274
59	NC_019436	ATA	2	6	5167	5172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
60	NC_019436	ATA	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
61	NC_019436	GTT	2	6	5392	5397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075274
62	NC_019436	TAA	2	6	5424	5429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
63	NC_019436	AAC	2	6	5494	5499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075274
64	NC_019436	TAA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075274
65	NC_019436	TCG	2	6	5612	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075274
66	NC_019436	CTG	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075274
67	NC_019436	TGA	2	6	5696	5701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019436	TTC	2	6	5834	5839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075275
69	NC_019436	CGT	2	6	5923	5928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075275
70	NC_019436	GCT	2	6	6112	6117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075275
71	NC_019436	TCT	2	6	6257	6262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075275
72	NC_019436	GTA	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075275
73	NC_019436	GTA	2	6	6387	6392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075275
74	NC_019436	AAT	2	6	6405	6410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075275
75	NC_019436	AAT	2	6	6672	6677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075276
76	NC_019436	CGG	2	6	6757	6762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414075276
77	NC_019436	TAT	2	6	6992	6997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075276
78	NC_019436	ACT	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075277
79	NC_019436	TAA	2	6	7126	7131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075277
80	NC_019436	TTG	2	6	7133	7138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075277
81	NC_019436	TCA	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075277
82	NC_019436	TAT	2	6	7237	7242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075277
83	NC_019436	ATC	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075277
84	NC_019436	CAG	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075277
85	NC_019436	TGG	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075277
86	NC_019436	ATA	2	6	7593	7598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075277
87	NC_019436	TGA	2	6	7614	7619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075277
88	NC_019436	ATA	2	6	7650	7655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075277
89	NC_019436	ATG	2	6	7737	7742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075277
90	NC_019436	TAG	2	6	7746	7751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075277
91	NC_019436	AAG	2	6	7792	7797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075277
92	NC_019436	AGT	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075277
93	NC_019436	GAT	2	6	7900	7905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075277
94	NC_019436	AAT	2	6	8087	8092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075277
95	NC_019436	CGG	2	6	8191	8196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414075277
96	NC_019436	CAT	2	6	8207	8212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075277
97	NC_019436	TAA	2	6	8358	8363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019436	GGT	2	6	8400	8405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075278
99	NC_019436	TCA	2	6	8544	8549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075278
100	NC_019436	TCA	2	6	8564	8569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075278
101	NC_019436	AAT	2	6	8572	8577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075278
102	NC_019436	TAA	2	6	8643	8648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075278
103	NC_019436	TTC	2	6	8680	8685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075278
104	NC_019436	CTT	2	6	8829	8834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075278
105	NC_019436	ATA	2	6	8867	8872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075278
106	NC_019436	TCC	2	6	8944	8949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414075278
107	NC_019436	TTA	2	6	8976	8981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075278
108	NC_019436	TAT	2	6	9006	9011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075278
109	NC_019436	TCT	2	6	9068	9073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075278
110	NC_019436	TAT	2	6	9147	9152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019436	ATA	2	6	9161	9166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019436	ATA	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019436	CAT	3	9	9450	9458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075279
114	NC_019436	CTG	2	6	9603	9608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075279
115	NC_019436	CTG	2	6	9618	9623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075279
116	NC_019436	CCA	2	6	9800	9805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075279
117	NC_019436	TCG	2	6	9971	9976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075279
118	NC_019436	AAG	2	6	10037	10042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019436	TTG	2	6	10113	10118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019436	ATT	2	6	10185	10190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075280
121	NC_019436	ATC	2	6	10280	10285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075280
122	NC_019436	TTC	2	6	10424	10429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075280
123	NC_019436	AAT	2	6	10744	10749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075280
124	NC_019436	ACT	2	6	10756	10761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075280
125	NC_019436	CGG	2	6	10829	10834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414075280
126	NC_019436	TAT	2	6	11064	11069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075280
127	NC_019436	ATG	2	6	11184	11189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019436	AGT	2	6	11285	11290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075281
129	NC_019436	TAT	2	6	11396	11401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075281
130	NC_019436	TGG	2	6	11495	11500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075281
131	NC_019436	TAT	2	6	11523	11528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075281
132	NC_019436	TAT	2	6	11591	11596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075281
133	NC_019436	GCT	2	6	11748	11753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075281
134	NC_019436	TGT	2	6	11759	11764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075281
135	NC_019436	ATC	2	6	11775	11780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075281
136	NC_019436	ATT	2	6	11789	11794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075281
137	NC_019436	ATG	2	6	11832	11837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075281
138	NC_019436	TCT	2	6	11860	11865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075281
139	NC_019436	TTG	2	6	11932	11937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075281
140	NC_019436	TTG	2	6	11955	11960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075281
141	NC_019436	TTG	2	6	11992	11997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075281
142	NC_019436	CTA	2	6	12013	12018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075281
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144	NC_019436	TTA	2	6	12179	12184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019436	GAA	2	6	12228	12233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019436	ATT	2	6	12250	12255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075282
147	NC_019436	ATC	2	6	12345	12350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075282
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152	NC_019436	TGA	2	6	13258	13263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019436	CTT	2	6	13283	13288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019436	TAT	2	6	13297	13302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019436	ATA	2	6	13446	13451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_019436	AGC	2	6	13514	13519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019436	AGC	2	6	13612	13617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_019436	ATT	2	6	13633	13638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_019436	AAG	2	6	13794	13799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075283
162	NC_019436	AAT	2	6	13843	13848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075283
163	NC_019436	TCA	2	6	14006	14011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075283
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177	NC_019436	TTG	2	6	14706	14711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_019436	TAT	2	6	14821	14826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_019436	CTA	2	6	14920	14925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_019436	TAA	2	6	14956	14961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_019436	ATC	3	9	15074	15082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_019436	TAA	2	6	15093	15098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_019436	AAT	2	6	15101	15106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_019436	TTC	2	6	15233	15238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075284
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226	NC_019436	TCT	2	6	19692	19697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
227	NC_019436	GTA	2	6	19823	19828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
228	NC_019436	AAT	2	6	19949	19954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075287
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244	NC_019436	TCA	2	6	21312	21317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_019436	ATT	2	6	21321	21326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_019436	CAA	2	6	21401	21406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_019436	TGC	2	6	21423	21428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_019436	CTT	2	6	21437	21442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_019436	TGA	2	6	21629	21634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_019436	TCC	2	6	21664	21669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
251	NC_019436	TAT	2	6	21731	21736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019436	CAT	2	6	21741	21746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_019436	ACC	2	6	21759	21764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
254	NC_019436	ACG	2	6	21950	21955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_019436	GAA	2	6	22049	22054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_019436	CTG	2	6	22164	22169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_019436	CGT	2	6	22183	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_019436	CAG	2	6	22193	22198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_019436	ATT	2	6	22246	22251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075288
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388	NC_019436	ATC	2	6	30300	30305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075290
389	NC_019436	TTA	2	6	30319	30324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075290
390	NC_019436	ATC	2	6	30429	30434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075290
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487	NC_019436	ATA	4	12	37502	37513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_019436	CAA	2	6	38494	38499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_019436	CAA	2	6	38516	38521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_019436	CAA	2	6	38538	38543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
494	NC_019436	CAA	2	6	38560	38565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding