MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS2

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019434	TGAA	2	8	50	57	50 %	25 %	25 %	0 %	414075297
2	NC_019434	TTTA	2	8	191	198	25 %	75 %	0 %	0 %	414075297
3	NC_019434	AATC	2	8	426	433	50 %	25 %	0 %	25 %	414075297
4	NC_019434	CGGA	2	8	558	565	25 %	0 %	50 %	25 %	414075297
5	NC_019434	ACAA	2	8	1061	1068	75 %	0 %	0 %	25 %	414075297
6	NC_019434	TGAG	2	8	1197	1204	25 %	25 %	50 %	0 %	414075297
7	NC_019434	CAAT	2	8	1654	1661	50 %	25 %	0 %	25 %	414075298
8	NC_019434	AAAG	2	8	1797	1804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019434	ATAA	2	8	1976	1983	75 %	25 %	0 %	0 %	414075299
10	NC_019434	TTTA	2	8	2094	2101	25 %	75 %	0 %	0 %	414075299
11	NC_019434	TTTA	2	8	2382	2389	25 %	75 %	0 %	0 %	414075299
12	NC_019434	AAAT	2	8	2400	2407	75 %	25 %	0 %	0 %	414075299
13	NC_019434	TAAT	2	8	2423	2430	50 %	50 %	0 %	0 %	414075299
14	NC_019434	TAAA	2	8	2463	2470	75 %	25 %	0 %	0 %	414075299
15	NC_019434	ACTA	2	8	2589	2596	50 %	25 %	0 %	25 %	414075299
16	NC_019434	TTAT	2	8	2677	2684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019434	AAAT	2	8	2943	2950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019434	GATA	2	8	2983	2990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019434	AATT	2	8	3154	3161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019434	TAAT	2	8	3184	3191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019434	TCAA	2	8	3635	3642	50 %	25 %	0 %	25 %	414075300
22	NC_019434	ATAA	2	8	3878	3885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019434	TACA	2	8	3926	3933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019434	GAAC	2	8	4088	4095	50 %	0 %	25 %	25 %	414075301
25	NC_019434	TGTT	2	8	4114	4121	0 %	75 %	25 %	0 %	414075301
26	NC_019434	AAAG	2	8	4200	4207	75 %	0 %	25 %	0 %	414075301
27	NC_019434	ATTT	2	8	5055	5062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019434	TCAC	2	8	5438	5445	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.