MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS5

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019432	GAAA	2	8	69	76	75 %	0 %	25 %	0 %	414073303
2	NC_019432	ATTT	2	8	208	215	25 %	75 %	0 %	0 %	414073303
3	NC_019432	GGAC	2	8	383	390	25 %	0 %	50 %	25 %	414073303
4	NC_019432	TTGA	2	8	439	446	25 %	50 %	25 %	0 %	414073303
5	NC_019432	GAAA	2	8	708	715	75 %	0 %	25 %	0 %	414073303
6	NC_019432	AGTA	2	8	910	917	50 %	25 %	25 %	0 %	414073303
7	NC_019432	ATGA	2	8	952	959	50 %	25 %	25 %	0 %	414073303
8	NC_019432	AGAA	2	8	1269	1276	75 %	0 %	25 %	0 %	414073304
9	NC_019432	TTTA	2	8	1648	1655	25 %	75 %	0 %	0 %	414073304
10	NC_019432	AATC	2	8	1857	1864	50 %	25 %	0 %	25 %	414073304
11	NC_019432	ACAG	2	8	2093	2100	50 %	0 %	25 %	25 %	414073305
12	NC_019432	AATA	2	8	2237	2244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019432	CTTT	2	8	2387	2394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019432	ATCC	2	8	2989	2996	25 %	25 %	0 %	50 %	414073306
15	NC_019432	ATTA	2	8	4023	4030	50 %	50 %	0 %	0 %	414073307
16	NC_019432	ATAA	2	8	4070	4077	75 %	25 %	0 %	0 %	414073307
17	NC_019432	CAAT	2	8	4340	4347	50 %	25 %	0 %	25 %	414073307
18	NC_019432	TTTA	2	8	4491	4498	25 %	75 %	0 %	0 %	414073307
19	NC_019432	ATAA	2	8	5492	5499	75 %	25 %	0 %	0 %	414073308
20	NC_019432	ATAA	2	8	5636	5643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019432	TTTA	2	8	5730	5737	25 %	75 %	0 %	0 %	414073309
22	NC_019432	GTCA	2	8	6285	6292	25 %	25 %	25 %	25 %	414073309
23	NC_019432	AATA	2	8	7002	7009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019432	TTTG	2	8	8160	8167	0 %	75 %	25 %	0 %	414073310
25	NC_019432	ATTA	2	8	8823	8830	50 %	50 %	0 %	0 %	414073311
26	NC_019432	TTTG	2	8	8941	8948	0 %	75 %	25 %	0 %	414073311
27	NC_019432	TGAT	2	8	9412	9419	25 %	50 %	25 %	0 %	414073312
28	NC_019432	TTTC	2	8	9560	9567	0 %	75 %	0 %	25 %	414073312
29	NC_019432	TCAC	2	8	9764	9771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019432	ATTT	2	8	10069	10076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019432	TTCT	2	8	10146	10153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019432	TAAT	2	8	10349	10356	50 %	50 %	0 %	0 %	414073313
33	NC_019432	AATA	2	8	10449	10456	75 %	25 %	0 %	0 %	414073313
34	NC_019432	ATGA	2	8	10807	10814	50 %	25 %	25 %	0 %	414073313
35	NC_019432	ATAA	2	8	11052	11059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019432	TACA	2	8	11100	11107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.