MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	GA	3	6	150	155	50 %	0 %	50 %	0 %	414073261
2	NC_019431	AT	3	6	908	913	50 %	50 %	0 %	0 %	414073261
3	NC_019431	AT	3	6	1423	1428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019431	AG	3	6	1507	1512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019431	TA	3	6	2685	2690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019431	AG	3	6	3138	3143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019431	AG	3	6	5212	5217	50 %	0 %	50 %	0 %	414073265
8	NC_019431	AG	3	6	7553	7558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019431	CT	3	6	7824	7829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019431	TA	3	6	7924	7929	50 %	50 %	0 %	0 %	414073266
11	NC_019431	TA	3	6	8071	8076	50 %	50 %	0 %	0 %	414073266
12	NC_019431	TG	3	6	8390	8395	0 %	50 %	50 %	0 %	414073266
13	NC_019431	AT	3	6	8527	8532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019431	AT	3	6	9908	9913	50 %	50 %	0 %	0 %	414073268
15	NC_019431	AT	3	6	11193	11198	50 %	50 %	0 %	0 %	414073268
16	NC_019431	AG	3	6	11353	11358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019431	TA	3	6	11824	11829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019431	TA	3	6	11973	11978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019431	AG	3	6	12237	12242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019431	TA	3	6	12346	12351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019431	AT	3	6	13845	13850	50 %	50 %	0 %	0 %	414073270
22	NC_019431	AT	3	6	14624	14629	50 %	50 %	0 %	0 %	414073270
23	NC_019431	AT	3	6	14763	14768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019431	TA	3	6	15170	15175	50 %	50 %	0 %	0 %	414073271
25	NC_019431	TA	3	6	15467	15472	50 %	50 %	0 %	0 %	414073271
26	NC_019431	TC	3	6	17281	17286	0 %	50 %	0 %	50 %	414073273
27	NC_019431	AT	3	6	18494	18499	50 %	50 %	0 %	0 %	414073275
28	NC_019431	GA	3	6	18672	18677	50 %	0 %	50 %	0 %	414073275
29	NC_019431	TA	3	6	19620	19625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019431	TA	3	6	20023	20028	50 %	50 %	0 %	0 %	414073277
31	NC_019431	GT	3	6	20420	20425	0 %	50 %	50 %	0 %	414073277
32	NC_019431	TG	3	6	21018	21023	0 %	50 %	50 %	0 %	414073278
33	NC_019431	AT	3	6	21719	21724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019431	AG	3	6	22257	22262	50 %	0 %	50 %	0 %	414073279
35	NC_019431	AG	3	6	23381	23386	50 %	0 %	50 %	0 %	414073279
36	NC_019431	TA	3	6	23569	23574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019431	AT	3	6	25203	25208	50 %	50 %	0 %	0 %	414073281
38	NC_019431	GA	3	6	25300	25305	50 %	0 %	50 %	0 %	414073281
39	NC_019431	TA	4	8	25393	25400	50 %	50 %	0 %	0 %	414073281
40	NC_019431	GA	3	6	25443	25448	50 %	0 %	50 %	0 %	414073281
41	NC_019431	AT	3	6	25725	25730	50 %	50 %	0 %	0 %	414073281
42	NC_019431	TA	3	6	26596	26601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019431	AG	3	6	26604	26609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019431	TA	3	6	26824	26829	50 %	50 %	0 %	0 %	414073282
45	NC_019431	TA	3	6	27038	27043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019431	TC	3	6	27379	27384	0 %	50 %	0 %	50 %	414073283
47	NC_019431	CT	3	6	28786	28791	0 %	50 %	0 %	50 %	414073283
48	NC_019431	CT	3	6	29305	29310	0 %	50 %	0 %	50 %	414073283
49	NC_019431	AG	3	6	29361	29366	50 %	0 %	50 %	0 %	414073283
50	NC_019431	CT	3	6	30075	30080	0 %	50 %	0 %	50 %	414073284
51	NC_019431	AC	3	6	31057	31062	50 %	0 %	0 %	50 %	414073285
52	NC_019431	GT	3	6	32722	32727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019431	AT	4	8	33296	33303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019431	TC	3	6	33606	33611	0 %	50 %	0 %	50 %	414073288
55	NC_019431	TA	3	6	34217	34222	50 %	50 %	0 %	0 %	414073289
56	NC_019431	AT	3	6	34262	34267	50 %	50 %	0 %	0 %	414073289
57	NC_019431	TA	3	6	34658	34663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019431	AT	3	6	35226	35231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019431	CT	3	6	35687	35692	0 %	50 %	0 %	50 %	414073290
60	NC_019431	AT	6	12	37634	37645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019431	AT	3	6	38648	38653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019431	TA	4	8	39584	39591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019431	TA	3	6	39847	39852	50 %	50 %	0 %	0 %	414073292
64	NC_019431	AT	3	6	39905	39910	50 %	50 %	0 %	0 %	414073292
65	NC_019431	TA	3	6	40371	40376	50 %	50 %	0 %	0 %	414073294
66	NC_019431	TA	3	6	40615	40620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019431	TA	3	6	40655	40660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019431	GA	3	6	41478	41483	50 %	0 %	50 %	0 %	414073295
69	NC_019431	CT	3	6	42193	42198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019431	AG	3	6	42249	42254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019431	AG	3	6	42768	42773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019431	GA	3	6	44175	44180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019431	TA	3	6	44513	44518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019431	AT	3	6	44871	44876	50 %	50 %	0 %	0 %	414073296
75	NC_019431	AT	3	6	45167	45172	50 %	50 %	0 %	0 %	414073296
76	NC_019431	TA	3	6	45374	45379	50 %	50 %	0 %	0 %	414073296
77	NC_019431	CT	3	6	45922	45927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019431	TA	3	6	47093	47098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019431	AT	3	6	47237	47242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019431	AG	3	6	47338	47343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019431	TA	3	6	49483	49488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019431	TG	3	6	50668	50673	0 %	50 %	50 %	0 %	414073300
83	NC_019431	AC	3	6	51022	51027	50 %	0 %	0 %	50 %	414073301
84	NC_019431	CT	3	6	51746	51751	0 %	50 %	0 %	50 %	414073301
85	NC_019431	TA	5	10	52589	52598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019431	TA	3	6	52902	52907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019431	TA	3	6	52948	52953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.